建立患者iPSC来源的tau蛋白病神经元模型并鉴定自噬相关表型
确认tau蛋白病神经元模型是否重现自噬-溶酶体通路异常和tau积累
将患者iPSC来源的NPC分化为神经元,在1-12周分化过程中检测ALP标志物(LC3-II、LAMP1、LAMP2、p62)和tau水平
Prolonged tau clearance and stress vulnerability rescue by pharmacological activation of autophagy in tauopathy neurons.
包含患者iPSC来源神经元多种细胞模型、小分子筛选、功能验证(应激脆弱性)、机制验证(自噬抑制剂和mTOR激活剂)及大鼠CNS渗透性实验
患者iPSC来源的tau-A152T神经元 患者iPSC来源的tau-P301L神经元 健康对照iPSC来源的tau-WT神经元 大鼠CNS渗透性模型
神经元分化5-8周后处理 mTORi浓度10 μM(雷帕霉素3 μM)处理24 h 应激实验中先用mTORi预处理8 h,再加入30 μM Aβ(1-42)或400 μM NMDA处理16 h 自噬抑制剂(SAR405、3-MA、BAF.A1)预处理6 h后再加mTORi处理18 h 单次24 h处理后洗脱,追踪tau水平和毒性至20天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认tau蛋白病神经元模型是否重现自噬-溶酶体通路异常和tau积累
将患者iPSC来源的NPC分化为神经元,在1-12周分化过程中检测ALP标志物(LC3-II、LAMP1、LAMP2、p62)和tau水平
从化合物库中筛选能在人NPC和神经元中激活自噬的化合物
在tau-WT NPC中进行LysoTracker和CYTO-ID荧光囊泡计数的高内涵显微筛选,并在分化5周的神经元中验证
确定先导mTORi在患者神经元中降低tau的效力和有效浓度
用OSI-027、AZD2014、AZD8055或雷帕霉素处理tau-A152T和tau-P301L神经元,通过Western blot和ELISA检测总tau和P-tauS396
确定mTORi是否优先降低不溶性tau种类
用Triton-X100和SDS对mTORi处理的A152T和P301L神经元进行蛋白分级分离,Western blot检测各组分tau
检验mTORi降低tau是否可挽救tau介导的神经元应激脆弱性
mTORi预处理A152T和P301L神经元后,用Aβ(1-42)或NMDA攻击,检测细胞活力
确定mTORi降低tau是否通过自噬途径
用自噬抑制剂预处理神经元后再加mTORi,检测tau水平;并检测自噬标志物变化
确认mTORi促进tau进入自噬体和吞噬溶酶体降解,而非外泌体分泌
mTORi处理神经元8 h后,进行密度梯度超速离心分离亚细胞组分和外泌体,Western blot检测tau和组分标志物
验证mTORi通过抑制mTORC1而非mTORC2或AMPK发挥作用
检测mTORC1底物磷酸化、mTORC2底物P-AKTS473和AMPK磷酸化;用mTOR激活剂MHY-1485共处理验证tau清除依赖于mTOR抑制
确定单次mTORi处理对tau水平和神经元活力的时间进程影响
mTORi处理24 h后洗脱,在20天内追踪tau水平、神经元活力和自噬标志物
确定单次mTORi处理后保护效应是否与tau降低持续时间一致
mTORi处理24 h洗脱后,在不同天数用Aβ(1-42)或NMDA攻击,检测细胞活力
了解AZD2014在神经元中的胞内浓度和游离药物水平,并评估大鼠脑渗透性
用UHPLC-MS-MS测定神经元中AZD2014总浓度和游离药物比例;大鼠持续输注4 h后测定脑和血浆浓度
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 多聚鸟氨酸 | Sigma | -- |
| 层粘连蛋白 | Sigma | -- | |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| Ham's F-12培养基 | Fisher Scientific Corning | -- | |
| B27添加剂 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 表皮生长因子 | Sigma | -- | |
| 成纤维细胞生长因子 | Stemgent | -- | |
| 肝素 | Sigma | -- | |
| 小分子筛选 | LysoTracker Red DND-99 | Life Technologies | L-7528 |
| CYTO-ID Green | Enzo Life Sciences | ENZ-51031 | |
| Hoechst 33342 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | P-Tau PHF1抗体 | -- | -- |
| Tau K9JA抗体 | -- | -- | |
| MAP2抗体 | -- | -- | |
| AlexaFluor偶联二抗 | Life Technologies | -- | |
| 细胞活力检测 | Alamar Blue细胞活力试剂 | Life Technologies | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Boston Bio-Products | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche Complete Mini tablets | -- | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Sigma | -- | |
| Pierce BCA蛋白测定试剂盒 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| SDS上样缓冲液 | NEB | -- | |
| Novex NuPAGE SDS-PAGE凝胶系统 | Invitrogen | -- | |
| PVDF膜 | EMD Millipore | -- | |
| HRP标记二抗 | Cell Signaling Technology | -- | |
| SuperSignal West Pico化学发光底物 | ThermoFisher | -- | |
| 放射自显影胶片 | LabScientific by ThermoFischer | -- | |
| Tau ELISA | 人总Tau ELISA试剂盒 | Invitrogen | -- |
| P-Tau[pS396]人ELISA试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Ambion Life Technologies | 15596018 |
| Direct-zol RNA小量制备试剂盒 | ZYMO Research | R2052 | |
| RT-qPCR | 高容量cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems, ThermoFisher Scientific | 4368814 |
| TaqMan基因表达预混液 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 应激脆弱性实验 | β-淀粉样蛋白(1-42) | -- | -- |
| N-甲基-D-天冬氨酸 | -- | -- | |
| 溶酶体分离 | 组织和培养细胞溶酶体富集试剂盒 | Thermo Scientific | -- |
| OptiPrep细胞分离介质 | -- | -- | |
| 外泌体分离 | ExoQuick-TC外泌体沉淀溶液 | -- | EXOTC10A-1 |
| 质谱分析 | AZD2014标准品 | Selleck | -- |
| 氯氮平内标 | Sigma | -- | |
| 快速平衡透析装置 | Thermo Fisher | -- | |
| mTOR激活验证 | MHY-1485 | -- | -- |
| 自噬抑制验证 | SAR405 | -- | -- |
| 3-甲基腺嘌呤 | -- | -- | |
| 巴弗洛霉素A1 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小分子筛选 | 细胞系、接种密度、化合物浓度(1 μM和10 μM)、CQ浓度(0.5 μM)、处理时间(24 h)、生物学重复数(n=5) 阅读提示:Methods 'Microscopy LysoTracker and CYTO-ID small-molecule screen'及Fig. 1图注 |
| mTORi处理tau蛋白病神经元 | 神经元分化时间(6周)、mTORi浓度(10 μM,雷帕霉素3 μM)、处理时间(24 h)、检测方法(Western blot/ELISA) 阅读提示:Results 'mTORi reduce tau burden in FTD patient-derived neurons'及Fig. 2、Fig. 3图注 |
| 应激脆弱性实验 | mTORi预处理时间(8 h)、应激物浓度(30 μM Aβ(1-42)或400 μM NMDA)、应激时间(16 h)、活力检测方法(Alamar Blue) 阅读提示:Methods 'Stress vulnerability assays'及Supplementary Fig. 4f |
| 自噬依赖验证 | 自噬抑制剂种类(SAR405、3-MA、BAF.A1)、预处理时间(6 h)、mTORi处理时间(18 h)、总处理时间(24 h) 阅读提示:Results 'Evidence of autophagy activation in human ex vivo neurons'及Fig. 4i |
| 单次给药持久效应 | mTORi浓度(10 μM或100 nM,雷帕霉素3 μM)、处理时间(24 h)、洗脱后追踪时间点(1-20天)、检测指标(tau、P-tauS396、β-III-tubulin、活力) 阅读提示:Results 'mTORi have a prolonged effect on tau levels and toxicity'及Fig. 7a |
| 亚细胞分级分离 | 处理时间(8 h)、mTORi浓度(10 μM)、密度梯度超速离心条件、组分标志物 阅读提示:Methods 'Sub-cellular fractionation of lysosomes'及Fig. 5图注 |
| mTORC1靶点验证 | mTORi浓度范围(0.1 nM–50 μM)、处理时间(24 h)、MHY-1485预处理浓度(1 μM、2.5 μM)和时间(6 h) 阅读提示:Results 'Tau clearance is a downstream effect of mTOR inhibition'及Fig. 6图注 |
| 大鼠CNS渗透性实验 | 大鼠品系(Han Wistar雄性)、周龄(8-10周)、体重(280-300 g)、给药剂量(2 μmol/kg/h)、输注时间(4 h)、n=3 阅读提示:Methods 'AZD2014 CNS penetration study in rat' |