构建BAT特异性Mettl3敲除小鼠
在体内特异性敲除棕色脂肪组织中的Mettl3,以研究其对iBAT发育的影响。
将Mettl3flox/flox小鼠与Ucp1-iCre转基因小鼠杂交,生成BAT特异性Mettl3敲除(BKO)小鼠;通过Southern blot和免疫印迹验证敲除效率和组织特异性。
METTL3 is essential for postnatal development of brown adipose tissue and energy expenditure in mice.
包含BAT特异性敲除小鼠体内模型、原代棕色脂肪细胞体外模型、m6A-RIP-seq和RNA-seq组学分析、荧光素酶报告基因功能验证
BAT特异性Mettl3敲除(BKO)小鼠 原代棕色前脂肪细胞及成熟棕色脂肪细胞 8周龄Mettl3flox/flox和BKO小鼠iBAT组织 高脂饮食诱导肥胖(DIO)小鼠和ob/ob肥胖小鼠
BKO小鼠构建:Mettl3flox/flox与Ucp1-iCre杂交,BAT特异性敲除Mettl3 高脂饮食配方:MD12032,45%脂肪,Medicience CL-316,243处理:1 mg/kg体重腹腔注射,每日一次,连续4天 急性冷暴露:4°C处理6小时;慢性冷暴露:4°C 7天 葡萄糖耐量试验:禁食6小时,腹腔注射d-葡萄糖1 g/kg;胰岛素耐量试验:禁食6小时,腹腔注射人胰岛素1 U/kg
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在体内特异性敲除棕色脂肪组织中的Mettl3,以研究其对iBAT发育的影响。
将Mettl3flox/flox小鼠与Ucp1-iCre转基因小鼠杂交,生成BAT特异性Mettl3敲除(BKO)小鼠;通过Southern blot和免疫印迹验证敲除效率和组织特异性。
确定METTL3缺失对iBAT出生后发育和形态的影响。
在出生后0、1、5、10、20、30、60天观察iBAT大体形态,进行H&E染色,称量iBAT重量和体重,免疫印迹检测METTL3和UCP1蛋白水平。
探究METTL3缺失对iBAT基因表达和m6A修饰的影响。
对8周龄Mettl3flox/flox和BKO小鼠iBAT进行RNA-seq和m6A-RIP-seq,分析差异表达基因、m6A峰分布和motif,并通过qPCR和m6A-RIP-RT-qPCR验证Prdm16、Pparg、Ucp1的m6A修饰和表达。
验证Prdm16、Pparg、Ucp1的m6A修饰位点是否影响其表达,并鉴定参与的m6A阅读蛋白。
将Prdm16、Pparg、Ucp1含m6A位点的最后外显子和3′-UTR区域克隆至pMIR-REPORT Luciferase载体,与原代棕色前脂肪细胞中共转染siMettl3或siYthdf1/2/3及β-Gal质粒,诱导分化48小时后检测荧光素酶活性。
确定METTL3对棕色脂肪细胞分化的直接影响。
从4–5周龄Mettl3flox/flox或C57BL/6野生型小鼠肩胛间棕色脂肪垫分离SVF细胞,用Ad-Cre或Ad-βGal腺病毒感染,诱导分化为成熟棕色脂肪细胞,进行Oil Red O染色、qPCR、Western blot和mtDNA拷贝数检测。
评估METTL3缺失对小鼠能量消耗、耐寒能力和WAT褐变的影响。
使用代谢笼监测8周龄小鼠O2消耗和CO2产生速率,进行急性冷暴露(4°C)和慢性冷暴露(4°C 7天)实验,以及CL-316,243注射诱导WAT褐变,检测直肠温度、血清游离脂肪酸、iWAT重量和Ucp1/Pgc-1α表达。
确定BAT特异性Mettl3敲除是否 predisposes 小鼠 to HFD诱导的肥胖和代谢综合征。
给BKO和对照小鼠喂食45%高脂饮食,每周称体重,检测体脂和瘦体重,进行葡萄糖耐量试验(GTT)和胰岛素耐量试验(ITT),检测血清胰岛素、甘油三酯和肝脏p-AKT水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 高脂饮食喂养 | 高脂饲料 | Medicience | MD12032 |
| 体成分分析 | 体成分分析仪 | Brucker | LF50 |
| 代谢监测 | 代谢笼 | Sable Systems | -- |
| 葡萄糖耐量试验 | D-葡萄糖 | -- | -- |
| 胰岛素耐量试验 | 人胰岛素 | Lily | -- |
| 血清胰岛素检测 | 胰岛素ELISA试剂盒 | EZassay | MS100 |
| 直肠温度监测 | 直肠探头 | Phyritemp | 7001HT |
| 蛋白质印迹 | METTL3抗体 | Cell Signaling Technology | D2160 |
| Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 磷酸化Akt (S473)抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| UCP1抗体 | Sigma | U6382 | |
| PGC-1α抗体 | Proteintech | 66369-1-lg | |
| β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 60008-1-lg | |
| PPARγ抗体 | Proteintech | 16643-1-AP | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-lg | |
| 总OXPHOS抗体 | Abcom | ab110413 | |
| PRDM16抗体 | ABclonal | A11581 | |
| YTHDF1抗体 | proteintech | 17479-1-AP | |
| YTHDF2抗体 | proteintech | 24744-1-AP | |
| YTHDF3抗体 | proteintech | 25537-1-AP | |
| RNA提取 | TriPure分离试剂 | Roche | 94015120 |
| cDNA合成 | M-MLV逆转录酶 | Promega | M1701 |
| 实时定量PCR | SYBR Green混合液 | Roche | 4913914001 |
| LightCycler 480实时PCR系统 | Roche | -- | |
| 原代细胞分离 | II型胶原酶 | -- | -- |
| Dispase II | -- | -- | |
| m6A-RIP-seq | Dynabeads mRNA纯化试剂盒 | Invitrogen | 61006 |
| m6A抗体 | Synaptic System | 202003 | |
| Magna MeRIPTM m6A试剂盒 | MERK | 17-10499 | |
| 荧光素酶实验 | X-tremeGENE siRNA转染试剂 | Roche | -- |
| 荧光素酶检测系统 | Promega | -- | |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | Solarbio | R0020 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| BKO小鼠构建 | Mettl3flox/flox小鼠遗传背景、Ucp1-iCre转基因品系、敲除效率验证方法 阅读提示:Methods 'Animal experiments'及Supplementary Fig. 1 |
| 高脂饮食诱导肥胖 | 高脂饮食配方(MD12032,45%脂肪,Medicience)、喂养起始周龄、喂养时长 阅读提示:Methods 'Animal experiments'及Fig. 8 legend |
| 冷暴露实验 | 急性冷暴露温度(4°C)和时长(6小时)、慢性冷暴露方案(3天间歇+4天持续) 阅读提示:Methods 'Cold-stress experiments'及Fig. 7、Fig. 8 legend |
| CL-316,243处理 | 剂量(1 mg/kg体重)、给药途径(腹腔注射)、频率(每日一次)、时长(4天) 阅读提示:Methods 'Chronic CL-316,243 treatment' |
| 原代棕色脂肪细胞分化 | SVF分离方法、诱导分化培养基成分及浓度、分化时间 阅读提示:Methods 'Primary brown adipocytes culture and adenovirus infection'及Fig. 6 legend |
| m6A-RIP-seq | 每样本混合小鼠数量(5只)、总RNA量(300 μg)、m6A抗体(202003, Synaptic System)、试剂盒(17-10499, MERK) 阅读提示:Methods 'RNA-seq and m6ARIP-seq'及Fig. 4、Fig. 5 legend |
| 荧光素酶报告基因实验 | siRNA浓度(100 nM)、转染试剂(X-tremeGENE, Roche)、分化时间(48小时)、荧光素酶检测系统(Promega) 阅读提示:Methods 'Transfection, siRNA knockdown, and luciferase assays'及Fig. 5 legend |
| 葡萄糖耐量试验和胰岛素耐量试验 | 禁食时间(6小时)、葡萄糖剂量(1 g/kg)、胰岛素剂量(1 U/kg)、给药途径(腹腔注射) 阅读提示:Methods 'Glucose tolerance tests and Insulin tolerance tests'及Fig. 9 legend |