利用被货物受体识别的N-聚糖限制性通行证序列标签改善糖蛋白的分泌

Improved secretion of glycoproteins using an N-glycan-restricted passport sequence tag recognized by cargo receptor.

作者信息Hirokazu Yagi, Maho Yagi-Utsumi, Rena Honda, Yusaku Ohta, Taiki Saito, Miho Nishio, Satoshi Ninagawa, Kousuke Suzuki, Takahiro Anzai, Yukiko Kamiya, Kazuhiro Aoki, Mahito Nakanishi, Tadashi Satoh, Koichi Kato
PMID32170195
发布时间2020-03-13
DOI10.1038/s41467-020-15192-1

实验完整度

高

包含NMR结构分析、CRISPR/Cas9基因敲除细胞系分泌实验、RUSH活细胞成像等多层级功能与机制验证。

主要模型

HCT116细胞(野生型及MCFD2、ERGIC-53、ERGL敲除细胞) HEK293T细胞 Expi293F细胞 COS-7细胞(用于FV分泌验证)

重点核对

HCT116细胞中FVIII、EPO等重组蛋白的转染与分泌水平检测 CRISPR/Cas9介导的MCFD2、ERGIC-53、ERGL单敲除及双敲除细胞验证 NMR滴定实验测定FVIII/FV肽段与MCFD2/ERGIC-53CRD复合物的解离常数 EPO-N-糖基化位点突变体(N24Q、N38Q、N84Q)的分泌水平比较 RUSH系统检测EPO从ER到高尔基体的转运效率

摘要

MCFD2和ERGIC-53是联合性因子V和因子VIII缺陷症的致病基因产物,它们形成货物受体复合物,负责这些凝血因子在内质网早期分泌途径中的细胞内运输。在本研究中,我们利用NMR技术成功鉴定了来自因子VIII的MCFD2结合片段,该片段由10个氨基酸序列组成,可增强其分泌。这促使我们研究将该序列附着于重组糖蛋白上对其分泌的可能影响。我们发现,仅通过将通行证序列标签添加到重组促红细胞生成素上,其分泌水平就显著增加。我们的发现不仅为凝血因子的细胞内运输及其遗传缺陷提供了分子基础,而且为增加具有生物制药意义的重组糖蛋白的生产产量提供了一种潜在有用的工具。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
FVIII中是否存在被MCFD2/ERGIC-53货物受体复合物识别的特定序列,以及将该序列作为通行证标签能否增强重组糖蛋白的分泌?
核心机制
MCFD2与ERGIC-53CRD结合后被变构激活,进而通过其EF-hand螺旋识别FV/FVIII B结构域中的SDLL(-/M)LL(K/R)QS基序,与ERGIC-53对N-聚糖的结合协同作用,促进货物糖蛋白从ER到ERGIC的囊泡运输。
主要证据
NMR实验证实FVIII肽段(Asn776–Asp838)与MCFD2/ERGIC-53CRD复合物结合(Kd约1.1×10−5 M),且该结合依赖于ERGIC-53CRD;HCT116细胞中删除该基序或敲除MCFD2/ERGIC-53/ERGL均降低FVIII分泌;将10氨基酸基序融合至EPO C端可显著提高其分泌,且该增强作用在MCFD2或ERGIC-53敲除细胞中受损;RUSH实验显示通行证序列标签提高EPO从ER到高尔基体的转运效率。
研究意义
为F5F8D的病理机制提供了分子基础,提示通过靶向MCFD2/ERGIC-53复合物实现抗凝治疗的可能,并为提高具有生物制药意义的重组糖蛋白产量提供了一种潜在方法。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

鉴定FVIII中的MCFD2结合基序

寻找FVIII B结构域中与MCFD2/ERGIC-53CRD复合物相互作用的特定序列。

使用15N标记的FVIII片段(Asn776–Asp838)进行NMR滴定实验,加入MCFD2/ERGIC-53CRD复合物或单独MCFD2,分析化学位移扰动并计算解离常数。

2

验证MCFD2与FV/FVIII基序的相互作用模式

确定MCFD2通过其EF-hand螺旋与FV/FVIII基序结合,且该结合受ERGIC-53CRD或ERGL变构激活。

使用15N标记的MCFD2进行HSQC实验,分别加入FV肽段(Asp926–Lys953)或FVIII肽段,在存在或 absence of ERGIC-53CRD衍生三肽或ERGL衍生三肽的条件下观察化学位移变化。

3

验证MCFD2结合基序对FVIII分泌的功能重要性

检验删除MCFD2结合基序或敲除货物受体组分对FVIII分泌的影响。

在HCT116细胞中转染野生型FVIII或基序缺失突变体(FVIIIΔmotif),并在野生型、MCFD2-KO、ERGIC-53-KO、ERGIC-53/ERGL双KO细胞中检测培养基中FVIII抗原水平。

4

检验通行证序列标签对EPO分泌的增强作用

研究将MCFD2结合基序融合至EPO不同位置对其分泌水平的影响。

构建EPO-N-motif、EPO-C-motif、EPO-N-long、EPO-C-long等融合蛋白,转染HCT116细胞,检测培养基中EPO水平,并在MCFD2-KO或ERGIC-53-KO细胞中验证依赖性。

5

分析N-糖基化及基序氨基酸对分泌增强的贡献

确定N-糖基化位点和基序中关键氨基酸对通行证序列功能的影响。

使用EPO N-糖基化位点突变体(N24Q、N38Q、N84Q)以及基序中丙氨酸替换突变体,在HCT116细胞中检测分泌水平;同时通过NMR分析丙氨酸替换对MCFD2结合的影响。

6

验证通行证序列对ER到高尔基体转运效率的影响

利用RUSH系统观察通行证序列标签是否促进EPO从ER到高尔基体的顺向运输。

在HCT116细胞中转染表达mScarlet-I-EPO或mScarlet-I-EPO-motif的RUSH质粒,加入生物素触发转运,30分钟后固定细胞,免疫荧光标记GM130,共聚焦显微镜成像并计算共定位系数。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
AVANCE 800 波谱仪Bruker BioSpin--
AVANCE 500 波谱仪Bruker BioSpin--
pRGEN-U6-sgRNA质粒ToolGen--
Cas9-GFP质粒Addgene44719
Guide-it CRISPR/Cas9系统(绿色/红色)Takara Bio Inc.--
聚乙烯亚胺“Max”Polysciences Inc.--
ExpiFectamine 293转染试剂盒Thermo Fisher Scientific--
Expi293表达培养基Thermo Fisher Scientific--
pET28a质粒----
泛素羧基末端水解酶YUH1----
镍离子亲和层析----
抗Flag M2亲和凝胶Sigma-Aldrich--
3×FLAG标签肽Sigma-Aldrich--
VisuLize FVIII抗原检测试剂盒Affinity Biologicals Inc.--
Asssay Max™人因子V ELISA试剂盒ASSAYPRO--
抗AAT抗体Agilent--
抗Flag M2抗体Sigma-Aldrich--
聚偏二氟乙烯膜Millipore--
Blocking One封闭液Nacalai Tesque--
鼠单克隆抗Flag M2抗体Sigma-AldrichF1804
抗人LMAN1(ERGIC-53)抗体Proteintech13364
抗人SDNSF/MCFD2抗体R&D SystemMAB2357
抗β-肌动蛋白抗体Sigma-AldrichA2228
抗小鼠IgG抗体-HRPGE Healthcare--
抗兔Ig抗体-HRPCell Signaling Technology--
Immobilon Western化学发光HRP底物溶液Millipore--
TRIzol试剂Thermo Fisher Scientific--
SuperScriptIII逆转录酶Thermo Fisher Scientific--
AmpliTaq Gold DNA聚合酶Thermo Fisher Scientific--
SYBR safe DNA凝胶染料Thermo Fisher Scientific--
li-Str_ST-SBP-mCherry质粒Addgene65269
Expifectamine™ 293试剂Thermo Fisher Scientific--
兔多克隆抗GM130抗体Proteintech11308-1-AP
Alexa Fluor 488标记抗兔IgG抗体Jackson ImmunoResearch711-545-152
荧光显微镜BZ-X700Keyence Co.--
BZ-H3XF/切片模块Keyence Co.--
BD FACSAria II细胞分选仪BD Biosciences--
FV衍生肽段AnyGen Co., Ltd.--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
NMR滴定实验
15N标记FVIII片段浓度(0.1 mM)、MCFD2/ERGIC-53CRD滴定范围(0.02–0.3 mM)、缓冲液组成(20 mM MES pH 6.0,10 mM CaCl2,150 mM NaCl,10% D2O)、采集温度(283 K)
阅读提示:Methods中NMR spectroscopy小节及Fig. 1b, c图注
NMR MCFD2相互作用实验
15N标记MCFD2浓度(0.2 mM)、FV/FVIII肽段加入量(2倍摩尔过量)、ERGIC-53CRD或ERGL三肽加入量(5倍摩尔过量)、缓冲液含2% DMSO-d6、采集温度(303 K)
阅读提示:Methods中NMR spectroscopy小节及Fig. 2a, 3a图注
FVIII分泌实验
HCT116细胞(野生型及MCFD2、ERGIC-53、ERGIC-53/ERGL敲除细胞)、转染后检测时间(72小时)、ELISA试剂盒(VisuLize FVIII Antigen Kit)、独立转染次数(n=4)、统计方法(双尾非配对Student t检验)
阅读提示:Methods中Secretion level assays of recombinant proteins小节及Fig. 4b图注
EPO分泌实验
EPO融合蛋白构建设计(N端/C端,含或不含TEV序列)、HCT116细胞(野生型及MCFD2-KO、ERGIC-53-KO)、ELISA检测(抗Flag M2抗体)、独立转染次数(n=3)
阅读提示:Methods中Secretion level assays of recombinant proteins小节及Fig. 4a, c–f图注
RUSH转运实验
RUSH质粒(li-Str_ST-SBP-mCherry替换为mScarlet-I-EPO或EPO-motif)、生物素浓度(40 μM)、转运时间(30分钟)、固定条件(2%多聚甲醛10分钟)、GM130抗体稀释比(1:1000)、至少9个细胞用于定量、Manders' M1系数分析
阅读提示:Methods中Retention using selective hooks system小节及Fig. 5图注