鉴定疾病肾小球中CD9表达
寻找参与肾外肾小球疾病的PEC激活相关分子。
对NTS诱导CGN小鼠第4天和第10天新鲜分离肾小球进行比较RNA测序,并用免疫组化和免疫荧光检测小鼠及人肾活检中CD9表达。
The tetraspanin CD9 controls migration and proliferation of parietal epithelial cells and glomerular disease progression.
含小鼠CGN和FSGS模型、PEC特异性基因敲除、体外PEC敲低、微流控趋化及人肾活检,多层级功能与机制验证
NTS诱导的小鼠CGN模型 DOCA-salt单侧肾切除小鼠FSGS模型 原代PEC细胞系(Cd9 shRNA敲低) 人肾活检组织
PEC特异性Cd9敲除(iPec-Cd9lox/lox)与对照小鼠在NTN模型中的ACR、BUN及新月体比例 DOCA-salt模型中iPec-Cd9wt/wt与iPec-Cd9lox/lox小鼠的ACR、BUN、硬化及FSGS病变比例 Cd9 shRNA敲低PEC在PDGF-BB和HB-EGF刺激下的增殖(KI67)与迁移能力 微流控通道中PDGF-BB梯度(20 ng/mL,3 h)下PEC定向迁移 PDGF-BB和HB-EGF刺激后PDGFRβ、EGFR及FAK磷酸化水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
寻找参与肾外肾小球疾病的PEC激活相关分子。
对NTS诱导CGN小鼠第4天和第10天新鲜分离肾小球进行比较RNA测序,并用免疫组化和免疫荧光检测小鼠及人肾活检中CD9表达。
确定CD9在CGN和FSGS中的作用及关键细胞来源。
使用Cd9−/−小鼠、血小板特异性PF4-Cd9、足细胞特异性Pod-Cd9、PEC特异性iPec-Cd9敲除小鼠,在NTN和DOCA-salt模型中评估肾功能和组织损伤。
解析CD9对PEC黏附、增殖、迁移及生长因子信号的影响。
用shRNA敲低PEC中CD9,进行黏附实验、KI67增殖检测、划痕迁移实验、微流控梯度迁移实验及Western blot检测PDGFRβ、EGFR、FAK和ITGB1。
验证小鼠发现与人类CGN和FSGS的相关性。
对ANCA相关CGN、FSGS、MCD及正常肾组织进行CD9、CD44和ITGB1免疫荧光共染。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| PEC诱导性基因敲除 | 盐酸多西环素 | Sigma Aldrich | -- |
| DOCA-salt模型 | DOCA缓释片 | Innovative Research of America | -- |
| 组织固定与包埋 | Araldite M包埋树脂 | Sigma Aldrich | -- |
| 组织固定 | Trump固定液 | EMS | -- |
| 免疫荧光 | 兔抗WT1抗体 | Abcam | ab89901 |
| 山羊抗PODXL抗体 | R&D systems | BAF1556 | |
| 兔抗CD9抗体 | Abcam | ab92726 | |
| 大鼠抗CD44抗体 | Abcam | ab119348 | |
| AF647标记大鼠抗CD44抗体 | Biolegend | 103018 | |
| 兔抗β1整合素抗体 | Abcam | ab179471 | |
| 山羊抗synaptopodin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC21537 | |
| 兔抗p57抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC8298 | |
| 山羊抗podoplanin抗体 | R&D Systems | AF3244-SP | |
| 小鼠抗PCNA抗体 | Abcam | ab29 | |
| 豚鼠抗synaptopodin抗体 | Synaptic Systems | 163004 | |
| AF488标记驴抗山羊IgG抗体 | Life Technologies | A-11005 | |
| AF594标记驴抗兔IgG抗体 | Life Technologies | A-21207 | |
| AF488标记驴抗大鼠IgG抗体 | Life Technologies | A-21208 | |
| Cy5标记驴抗兔IgG抗体 | Jackson Immunoresearch | -- | |
| 免疫组化 | Histofine免疫组化试剂 | Nichirei Biosciences | -- |
| 免疫组化显色 | AEC显色试剂 | DAKO | -- |
| 细胞培养 | 完全内皮细胞基础培养基 | PromoCell | -- |
| 青霉素/链霉素 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 细胞传代 | 0.05%胰蛋白酶EDTA | Thermo Fisher Scientific | -- |
| CD9敲低 | CD9 shRNA慢病毒载体 | Sigma Aldrich | SHCLND NM_007657, TRCN0000066393 |
| CD9敲低对照 | MISSION非靶向shRNA对照载体 | Sigma Aldrich | SHC002 |
| 迁移实验 | IBIDI培养插件 | IBIDI | 81176 |
| 流式凋亡检测 | APC标记Annexin-V | ImmunoTools | -- |
| 碘化丙啶 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Annexin-V结合缓冲液 | BD Pharmingen | -- | |
| 增殖检测 | PE标记抗人Ki67单克隆抗体(克隆B56) | BD Pharmingen | -- |
| Western blot | RIPA提取缓冲液 | Roche | -- |
| 大鼠抗CD9抗体 | BD Pharmingen | 553758 | |
| 兔抗磷酸化PDGF受体β Y1009抗体 | Cell Signaling Technology | 4549 | |
| 兔抗PDGFRβ抗体 | Cell Signaling | 3169 | |
| 兔抗β1整合素抗体 | Millipore | 04-1109 | |
| 兔抗CASP3抗体 | Cell Signaling Technology | 9662 | |
| 兔抗磷酸化EGFR Y1068抗体 | Cell Signaling Technology | 2234 | |
| 兔抗EGFR抗体 | Cell Signaling Technology | 2232 | |
| 兔抗磷酸化FAK Y397抗体 | Cell Signaling | 3283 | |
| 兔抗FAK抗体 | Millipore | 06-543 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Jackson Immunoresearch | 706-036-148 | |
| Clarity Western ECL底物 | Bio-Rad | 170-5061 | |
| Western blot成像 | LAS-4000成像系统 | Fuji | LAS4000 |
| RNA提取 | Qiazol裂解试剂 | Qiagen | -- |
| 逆转录 | Quantitect逆转录试剂盒 | Qiagen | -- |
| qPCR | Maxima SYBR Green/Rox qPCR混合液 | Fermentas; Thermo Fisher Scientific | -- |
| 尿白蛋白检测 | 小鼠白蛋白ELISA试剂盒 | CellTrend GmbH | -- |
| 血压测定 | BP-2000血压分析系统 | Visitech system | -- |
| 血细胞计数 | Hemavet血细胞计数仪 | Drew scientific | -- |
| 透射电镜观察 | JEOL 1011透射电子显微镜 | JEOL | -- |
| 共聚焦显微镜观察 | LSM 710共聚焦激光显微镜 | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| NTS诱导CGN模型 | 肾毒血清剂量15 µl、稀释于85 µL PBS、第2和3天重复注射、21天后处死;小鼠性别、周龄、分组及样本量 阅读提示:Methods中Induction of nephrotoxic nephritis小节及Fig. 2、Fig. 3图注 |
| DOCA-salt单侧肾切除FSGS模型 | DOCA 50 mg/片、21天释放、单侧左肾切除、0.9% NaCl饮水、6周终点;小鼠性别、周龄、分组及样本量 阅读提示:Methods中DOCA-salt and nephron reduction model小节及Fig. 4图注 |
| PEC特异性Cd9敲除 | iPec-Cre与Cd9-floxed杂交、多西环素饮水14天(5%蔗糖、1 mg/ml)后洗脱1周、敲除效率验证 阅读提示:Methods中Animals小节及Supplementary Fig. 7 |
| 体外PEC敲低与迁移实验 | Cd9 shRNA MOI 20、转导后至少7天分析、PDGF-BB和HB-EGF 10 ng/mL刺激、微流控PDGF-BB 20 ng/mL梯度3 h 阅读提示:Methods中Cell silencing of Cd9、Cell migration in IBIDI chambers及Migration in PDGF gradient小节,Fig. 5图注 |
| Western blot信号检测 | PDGF-BB和HB-EGF时间序列刺激条件、磷酸化位点Y1009/Y1068/Y397、每组n=4次实验 阅读提示:Methods中Western blot analysis小节及Fig. 6图注 |