SMPDL3b对足细胞鞘脂代谢的影响
确定SMPDL3b是否改变足细胞磷酸二酯酶活性及活性鞘脂含量
在CTRL、siSMP和SMP OE人足细胞中检测磷酸二酯酶活性,并用LC-MS测定鞘磷脂、神经酰胺和C1P含量及C1P种类;在转染全长SMPDL3b的HEK293中行C1P磷酸酶体外 assay。
SMPDL3b modulates insulin receptor signaling in diabetic kidney disease.
含人足细胞体外模型、HEK293转染、db/db小鼠及足细胞特异性敲除模型,并进行功能与机制验证
人足细胞(CTRL、siSMP、SMP OE) HEK293细胞转染模型 足细胞特异性Smpdl3b敲除db/db小鼠 C57BL/6小鼠肾小球
人足细胞胰岛素刺激浓度0.1和1 nM、30 min,动力学为1 nM处理0–30 min SMP OE与siSMP及CTRL足细胞分组比较 C1P体外处理浓度100 µM、1 h,胰岛素1 nM刺激30 min db/db小鼠腹腔注射C16:0 C1P 30 mg/kg,每日一次,连续28天,n=6/组 CD处理浓度5 mM、1 h
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定SMPDL3b是否改变足细胞磷酸二酯酶活性及活性鞘脂含量
在CTRL、siSMP和SMP OE人足细胞中检测磷酸二酯酶活性,并用LC-MS测定鞘磷脂、神经酰胺和C1P含量及C1P种类;在转染全长SMPDL3b的HEK293中行C1P磷酸酶体外 assay。
验证SMPDL3b是否影响胰岛素刺激下AKT与p70S6K等下游信号
对CTRL、siSMP、SMP OE足细胞给予递增浓度胰岛素,Western blot检测pAKT/tAKT、p-p70S6K/t-p70S6K、p-4EB-P1/t-4EB-P1;并行亚细胞分离与流式检测IR的质膜定位与阳性细胞比例。
检验SMPDL3b是否差异影响IR亚型与caveolin-1复合物形成
在共转染hIRA-FLAG、hIRB-FLAG、SMPDL3b及caveolin-1质粒的HEK293中行免疫共沉淀;并用C57BL/6小鼠肾小球行内源性IP验证;用CD处理检验对IRB/caveolin-1结合及AKT磷酸化的恢复作用。
确认足细胞特异性Smpdl3b缺失小鼠可存活且肾脏表型正常
将Smpdl3b-floxed小鼠与Podocin-Cre小鼠杂交,经PCR及qRT-PCR、Western blot、免疫荧光验证敲除效率,并在28周龄检测体重、肾重、尿白蛋白/肌酐、BUN、血清肌酐及系膜扩张。
验证足细胞特异性Smpdl3b缺失是否足以保护糖尿病小鼠免于DKD
构建fl/fl;db/db双敲除小鼠,分四组比较28周龄体重、肾重比、尿白蛋白/肌酐、PAS系膜扩张、WT1足细胞计数、电镜足突与GBM厚度、pAKT免疫组化及肾皮质鞘脂LC-MS。
检验外源C1P是否恢复IR信号并延缓已形成的DKD
SMP OE足细胞用C1P预处理后胰岛素刺激检测pAKT与p-p70S6K;12周龄db/db小鼠腹腔注射C1P或生理盐水28天,检测尿白蛋白/肌酐、系膜扩张、pAKT免疫染色及糖耐量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Corning | 10-040-CV |
| DMEM培养基 | ThermoFisher Scientific Inc. | 11995-073 | |
| 免疫共沉淀 | Dynabeads M-270 Epoxy免疫共沉淀试剂盒 | ThermoFisher Scientific Inc. | 14321D |
| 足细胞处理 | 人胰岛素 | Sigma-Aldrich | I9278-5ML |
| 药物处理 | 甲基-β-环糊精 | Sigma-Aldrich | H107-100G |
| C1P处理 | C16:0神经酰胺-1-磷酸 | Avanti Polar Lipid | 860533 |
| C1P磷酸酶测定 | C6-NBD神经酰胺 | Avanti Polar Lipid | 810209P |
| 重组人SMPDL3b蛋白(MYC/DDK标签) | Creative Biomart | SMPDL3b-2823H | |
| Western blot | 抗小窝蛋白-1(磷酸化Cav1 Tyr14)抗体 | Cell Signaling Technology | 3251 |
| 抗小窝蛋白-1(Cav1 D46G3)抗体 | Cell Signaling Technology | 3267 | |
| 抗胰岛素受体β亚基(4B8)抗体 | Cell Signaling Technology | 3025 | |
| 抗Na/K-ATP酶抗体 | Cell Signaling Technology | 3010 | |
| 抗MEK-1/2(D1A5)抗体 | Cell Signaling Technology | 8727 | |
| 抗磷酸化AKT(Ser473,D9E)抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| 抗总AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 抗磷酸化p70S6K(Thr389,108D2)抗体 | Cell Signaling Technology | 9234 | |
| 抗p70S6K抗体 | Cell Signaling Technology | 9202 | |
| 抗磷酸化4E-BP1(Thr37/46,236B4)抗体 | Cell Signaling Technology | 2855 | |
| 抗4E-BP1抗体 | Cell Signaling Technology | 9644 | |
| Western blot与免疫荧光 | SMPDL3b抗体 | GenWay Biotech | GWB-2281D4 |
| 内源性免疫共沉淀 | 胰岛素受体β亚基抗体(CT-1) | ThermoFisher Scientific Inc. | MA5-13778 |
| 免疫荧光 | 抗WT1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-192 |
| 抗突触足蛋白抗体(P19) | Santa Cruz Biotechnology | sc-21537 | |
| Alexa荧光568二抗 | Invitrogen | Thermo Fisher Scientific | A10042 | |
| Alexa荧光488二抗 | Invitrogen | Thermo Fisher Scientific | A11059 | |
| DAPI | Invitrogen | Thermo Fisher Scientific | D1306 | |
| 流式细胞术 | 人BD Fc封闭试剂 | BD Bioscience | 564220 |
| 人/鼠胰岛素受体/CD220 APC偶联抗体 | R&D Systems | FAB1544A | |
| 同型对照IgG APC偶联抗体 | R&D Systems | IC108A | |
| 尿样分析 | 白蛋白ELISA试剂盒 | Bethyl Lab. | E90-134 |
| 肌酐检测试剂盒 | Stanbio | 0420-500 | |
| 动物饲养 | 18%蛋白啮齿动物饲料 | Tekland Global (Envigo) | 2018S |
| 转染 | FuGene-6转染试剂 | -- | -- |
| 质粒构建 | 带GFP标签的人SMPDL3b质粒 | OriGene | RG217688 |
| 带GFP标签的人小窝蛋白-1质粒 | OriGene | RG210274 | |
| 带Myc-DDK标签的人小窝蛋白-1质粒 | OriGene | RC210274 | |
| pCMV6-AC-3DDK空载体 | OriGene | PS100057 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 足细胞培养与处理 | 细胞分化14天、血清饥饿24 h;胰岛素0.1和1 nM处理30 min;CD 5 mM处理1 h;C1P 100 µM处理1 h 阅读提示:Methods中“Cell culture”和“Treatment of human podocytes”小节 |
| 脂质组学分析 | 体外每样本至少1×10^6细胞、体内至少25 mg肾皮质;每组3次独立实验 阅读提示:Methods中“LC–MS analysis”小节及Fig. 1、Fig. 5图注 |
| 磷酸二酯酶活性测定 | 1 mM底物、37 °C、5% CO2、1 h、405 nm读数 阅读提示:Methods中“Phosphodiesterase enzymatic activity assay”小节 |
| C1P磷酸酶体外测定 | 50 µM C6-NBD-C1P复合10 µM BSA,2 µg蛋白,37 °C、10 min;纯化蛋白0–1000 ng 阅读提示:Methods中“C1P phosphatase assay”小节 |
| 免疫共沉淀 | 各IP至少重复3次;内源性IP用5只C57BL/6小鼠混合肾小球;1.5 mg抗体偶联磁珠/1.5 g肾小球 阅读提示:Methods中“Transient transfection and IP”小节及Fig. 3图注 |
| 足细胞特异性敲除小鼠 | Smpdl3b-floxed与Podocin-Cre杂交;28周龄表型分析;Cre+;+/+ n=10、Cre+;fl/fl n=6 阅读提示:Methods中“Genotyping, housing, and phenotypic analysis of mice”及Fig. 4图注 |
| db/db双敲除小鼠DKD评估 | 四组样本量10/11/9/9;28周龄终点;LC-MS每组3只动物 阅读提示:Methods动物小节及Fig. 5图注 |
| 外源C1P体内给药 | 12周龄db/db小鼠,30 mg/kg C16:0 C1P或0.9%生理盐水,每日腹腔注射28天,每组n=6;C1P储备液含2.5% DMSO 阅读提示:Methods中“Exogenous C1P treatment of diabetic mice”小节及Fig. 6图注 |