检测PAH患者及实验PH模型肺组织中ENO1表达
验证ENO1在PAH/PH中是否上调。
对PHBI来源的对照、IPAH和APAH人PASMC进行Western blot和RT-qPCR检测ENO1/ENO2/ENO3;对PAH患者肺切片进行ENO1免疫组化;对缺氧小鼠、SuHx大鼠和MCT大鼠肺组织进行Western blot、RT-qPCR及免疫组化检测。
Alpha-enolase regulates the malignant phenotype of pulmonary artery smooth muscle cells via the AMPK-Akt pathway.
含人PASMC样本、多种细胞模型、MEF模型、小鼠和大鼠PH模型及代谢、信号通路机制验证
人肺动脉平滑肌细胞(PASMC) 野生型及AMPKα1/α2缺失MEF 缺氧诱导PH小鼠模型 Sugen/缺氧诱导PH大鼠模型
PASMC来源与传代:Lonza原代人PASMC及PHBI来源的对照、IPAH、APAH人PASMC,使用第5–7代,干预组与对照组传代匹配 ENO1干预方式:慢病毒shRNA沉默,或pCMV3-ENO1-GFP电转过表达,并设shCTRL或空载pCMV3-GFP对照 ENOblock处理:体外10 μM处理8 h或12 h;小鼠0.5 mg/天/只腹腔注射2周;大鼠20 mg/kg腹腔注射2周 缺氧处理:PASMC 1% O2处理24 h等;小鼠10% O2暴露2周;大鼠10% O2暴露3周后复氧2周 动物模型分组与样本量:小鼠每组8–10只,大鼠每组6–10只;SuHx大鼠第1天皮下注射Sugen 5416 20 mg/kg
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证ENO1在PAH/PH中是否上调。
对PHBI来源的对照、IPAH和APAH人PASMC进行Western blot和RT-qPCR检测ENO1/ENO2/ENO3;对PAH患者肺切片进行ENO1免疫组化;对缺氧小鼠、SuHx大鼠和MCT大鼠肺组织进行Western blot、RT-qPCR及免疫组化检测。
验证ENO1是否影响PASMC增殖与收缩蛋白表达。
用shENO1慢病毒沉默ENO1,或在常氧和1% O2缺氧下用10 μM ENOblock处理PASMC,检测PCNA、BrdU掺入、细胞活力及Myocardin、α-SMA、MHC、Calponin表达。
验证ENO1是否足以促进PASMC增殖和去分化表型。
用pCMV3-ENO1-GFP电转过表达ENO1,检测GFP/ENO1表达、PEP水平、PCNA、BrdU掺入及收缩蛋白表达。
验证ENO1是否影响PASMC对凋亡的敏感性。
在shENO1、ENOblock处理或ENO1过表达并给予etoposide的PASMC中,检测PARP、Caspase 3、Caspase 9剪切、TUNEL凋亡率、LDH细胞死亡及细胞活力。
验证ENO1是否通过Akt-GSK3β通路促进PASMC增殖和存活。
在shENO1、ENOblock或ENO1过表达的PASMC中检测p-Akt(T308/S473)、p-PRAS40、p-GSK3β;用GSK690693或MK2206抑制Akt后检测PCNA、BrdU掺入和细胞活力。
验证AMPKα1是否介导ENO1对Akt的激活,并判断是否依赖PEP。
检测p-AMPKα(T172)和p-ACC;用Compound C或AICAR处理PASMC;在WT、AMPKα1-null、AMPKα2-null MEF中检测AICAR诱导的p-Akt;在ENO1过表达PASMC中用siRNA沉默AMPKα1/α2;外源PEP处理检测p-AMPK和p-Akt。
验证ENO1是否参与缺氧/HIF激活诱导的糖酵解转变。
用Seahorse XF24进行线粒体应激试验和糖酵解应激试验,检测OCR、ECAR及 basal/maximal respiration、basal/maximal glycolysis、OCR/ECAR;用DMOG模拟缺氧/HIF激活,并结合shENO1、ENOblock或ENO1过表达及GSK690693处理。
判断ENO1抑制后PASMC是否转向替代碳源。
用Fatty Acid Oxidation Assay Kit联合Seahorse检测β-氧化OCR,用Glutamine-Glo Assay Kit检测培养基谷氨酰胺消耗。
验证药理学抑制ENO1能否逆转缺氧诱导的PH。
C57BL/6J小鼠暴露于常氧或10% O2 2周后,给予ENOblock腹腔注射2周,检测ENO活性、RVSP、RV/(LV+S)、肺血管壁厚度及SMA/Ki67共染的PASMC增殖。
验证ENOblock对更严重PH模型的疗效及其与AMPK/Akt通路的关系。
雄性SD大鼠接受Sugen 5416皮下注射并暴露10% O2 3周,复氧2周后给予ENOblock腹腔注射2周,检测RVSP、RV/(LV+S)、肺血管壁厚度、SMA/Ki67增殖及p-ACC、p-PRAS40免疫共染。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | SmGM-2培养基 | Lonza | -- |
| Dulbecco改良Eagle培养基 | -- | -- | |
| 缺氧处理 | INVIVO2 300缺氧工作站 | Ruskinn Technology Limited | -- |
| 细胞增殖检测 | BrdU掺入实验试剂 | EMD Millipore Corporation | -- |
| 细胞活力检测 | Cell Titer 96 AQueous One Solution细胞增殖实验试剂 | Promega Corporation | -- |
| 细胞死亡检测 | 乳酸脱氢酶细胞毒性检测试剂盒 | Roche | -- |
| 细胞凋亡检测 | TUNEL凋亡检测试剂盒 | Abcam | -- |
| 慢病毒沉默 | 靶向ENO1的shRNA慢病毒 | Santa Cruz Biotechnology | -- |
| 细胞筛选 | 嘌呤霉素 | Sigma-Aldrich | -- |
| 过表达 | pCMV3-ENO1-GFP质粒 | Sino biological | -- |
| 电转 | Nucleofector电转系统 | Lonza | -- |
| ENO活性检测 | 烯醇化酶活性检测试剂盒 | Biovision | -- |
| PEP检测 | PEP比色/荧光检测试剂盒 | Abnova | -- |
| Western blot | SuperSignal West Femto底物 | Thermo Fisher | -- |
| α-Tubulin抗体 | Sigma-Aldrich | T5168 | |
| β-actin抗体 | Sigma-Aldrich | A2228 | |
| α-SMA抗体 | Sigma-Aldrich | A5228 | |
| Calponin抗体 | Sigma-Aldrich | C2687 | |
| Myocardin抗体 | R&D Systems | MAB4028 | |
| SM22α抗体 | Abcam | ab10135 | |
| PCNA抗体 | Proteintech Group | 10205–2-AP | |
| ENO1抗体 | Cell Signaling Technology | 3810 | |
| PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 9542 | |
| 剪切型PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 5625 | |
| Caspase 3抗体 | Cell Signaling Technology | 9665 | |
| 剪切型Caspase 3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| Caspase 9抗体 | Cell Signaling Technology | 9508 | |
| 剪切型Caspase 9抗体 | Cell Signaling Technology | 7237 | |
| p-PRAS40抗体 | Cell Signaling Technology | 13175 | |
| PRAS40抗体 | Cell Signaling Technology | 2691 | |
| p-Akt (T308)抗体 | Cell Signaling Technology | 13038 | |
| p-Akt (S473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 4691 | |
| p-GSK3β抗体 | Cell Signaling Technology | 5558 | |
| GSK3β抗体 | Cell Signaling Technology | 12456 | |
| p-ACC抗体 | Cell Signaling Technology | 11818 | |
| ACC抗体 | Cell Signaling Technology | 3676 | |
| p-AMPKα (T172)抗体 | Cell Signaling Technology | 2535 | |
| AMPKα抗体 | Cell Signaling Technology | 5831 | |
| AMPKα1抗体 | Upstate Biotechnology | 07-350 | |
| AMPKα2抗体 | Upstate Biotechnology | 07-363 | |
| MHC抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-376157 | |
| ENO2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-71047 | |
| ENO3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-100811 | |
| HIF1α抗体 | BD Biosciences | 610958 | |
| 抗小鼠IgG-HRP偶联二抗 | Bio-Rad | 172–1011 | |
| 抗兔IgG-HRP偶联二抗 | Bio-Rad | 172–1034 | |
| 抗山羊IgG-HRP偶联二抗 | Bio-Rad | 172–1019 | |
| RNA提取 | RNeasy Plus Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| 反转录 | Taqman RNA反转录试剂盒 | Applied Biosystems | -- |
| RT-qPCR | StepOnePlus实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- |
| 免疫荧光 | DAPI封片剂 | -- | -- |
| ZEISS Z1 AxioObserver荧光显微镜 | Carl Zeiss | -- | |
| 免疫组化 | DAB显色液 | Dako | -- |
| 代谢检测 | Seahorse XF24细胞代谢分析仪 | Agilent | -- |
| 寡霉素 | -- | -- | |
| FCCP | -- | -- | |
| 抗霉素 | -- | -- | |
| 葡萄糖 | -- | -- | |
| 2-脱氧葡萄糖 | -- | -- | |
| β-氧化检测 | 脂肪酸氧化检测试剂盒 | Abcam | -- |
| 谷氨酰胺消耗检测 | 谷氨酰胺Glo检测试剂盒 | Promega | -- |
| 缺氧造模 | BioSpherix A舱 | BioSpherix | -- |
| Proox Model P110氧控制器 | BioSpherix | -- | |
| 血流动力学检测 | Millar压力换能导管 | -- | -- |
| 数据处理 | Aperio ImageScope软件 | -- | -- |
| 影像分析 | ImageJ | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PASMC来源与培养 | 细胞来源(Lonza CC-258或PHBI)、供体分组(对照/IPAH/APAH)、传代次数5–7代、干预组与对照组传代匹配、SmGM-2培养基含5% FBS 阅读提示:Methods的Cell culture and hypoxic exposure小节 |
| ENO1沉默与过表达 | shRNA慢病毒靶向ENO1、感染后1.5 mg/ml puromycin筛选2天;pCMV3-ENO1-GFP电转过表达及空载pCMV3-GFP对照 阅读提示:Methods的Silencing and overexpression of ENO1 in PASMC小节及Fig. 2图注 |
| ENOblock体外处理 | ENOblock浓度(常用10 μM,部分实验为梯度浓度)、处理时间(8 h、12 h或24 h)、是否联合1% O2缺氧 阅读提示:Fig. 2、Fig. 3、Fig. 6图注及Methods相关段落 |
| 缺氧与DMOG处理 | PASMC缺氧条件为1% O2;DMOG浓度100 μM;具体处理时长按各图注(8 h、12 h或24 h) 阅读提示:各Figure legend及Methods的Oxygen consumption and extracellular acidification小节 |
| Seahorse代谢检测 | 每孔30,000个PASMC、贴壁12 h、线粒体应激试验与糖酵解应激试验的注射药物及终浓度、OCR/ECAR按蛋白量归一化 阅读提示:Methods的Oxygen consumption and extracellular acidification小节 |
| 缺氧诱导小鼠PH模型与ENOblock给药 | 8周龄C57BL/6J小鼠、10% O2暴露2周、ENOblock 0.5 mg/天/只腹腔注射2周(第1周每日1次,第2周隔日1次)、每组8–10只 阅读提示:Methods的HPH models and ENOblock treatment小节及Fig. 7a图注 |
| SuHx诱导大鼠PH模型与ENOblock给药 | 雄性SD大鼠190–200 g、Sugen 5416 20 mg/kg皮下注射、10% O2暴露3周后复氧2周、ENOblock 20 mg/kg腹腔注射2周、每组6–10只 阅读提示:Methods的HPH models and ENOblock treatment小节及Fig. 8a图注 |
| 动物模型终点检测 | RVSP右心导管检测、RV/(LV+S)比值、肺血管壁厚度评估(小鼠50–100 µm、大鼠60–120 µm肌性动脉,每张切片至少10条)、SMA/Ki67共染增殖率 阅读提示:Methods的HPH models and ENOblock treatment小节及Fig. 7、Fig. 8图注 |
| 统计设计 | 样本量估算采用效应量0.75;结果以mean ± SEM表示,至少三次实验;Student t检验或单因素方差分析加Bonferroni事后检验 阅读提示:Methods的Statistical analysis小节 |