P053的体外抑制活性与选择性评价
验证P053对CerS1的抑制效力及对其它CerS同工酶的选择性
使用HEK293、U251和COS细胞表达各CerS同工酶,以NBD-二氢鞘氨醇和特定脂肪酰CoA为底物,HPLC检测产物,计算IC50;并用重组鞘氨醇激酶1/2评估脱靶效应。
A selective inhibitor of ceramide synthase 1 reveals a novel role in fat metabolism.
包含体外酶活、细胞脂质组学、小鼠HFD模型、高胰岛素-正葡萄糖钳夹及线粒体功能验证
HEK293细胞 小鼠原代皮层神经元 高脂饮食C57BL6/J小鼠 离体比目鱼肌和EDL肌纤维
P053口服灌胃剂量5 mg/kg/day,持续4-6周,对照为2% DMSO饮水 高脂饮食含45%热量来自脂肪,正常饮食含8%热量来自脂肪 HEK293细胞处理24 h,P053浓度100 nM至1 μM 高胰岛素-正葡萄糖钳夹中胰岛素输注速率6 mU/kg/min,葡萄糖钳夹水平~8 mM 小鼠样本量:脂质组学每组18-20只,钳夹实验每组6-9只
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证P053对CerS1的抑制效力及对其它CerS同工酶的选择性
使用HEK293、U251和COS细胞表达各CerS同工酶,以NBD-二氢鞘氨醇和特定脂肪酰CoA为底物,HPLC检测产物,计算IC50;并用重组鞘氨醇激酶1/2评估脱靶效应。
验证P053在活细胞中抑制CerS1并选择性降低C18鞘脂
小鼠皮层神经元预处理P053后加入D7-二氢鞘氨醇,LC-MS/MS检测D7-神经酰胺;HEK293细胞处理24 h后靶向定量神经酰胺、HexCer和SM。
评估P053口服生物利用度及对骨骼肌C18神经酰胺的选择性降低
单次5 mg/kg口服灌胃测定血浆浓度;每日5 mg/kg P053给予chow或HFD小鼠4-6周,脂质组学分析骨骼肌、肝脏和脂肪组织。
验证CerS1抑制对高脂饮食诱导的脂肪堆积和胰岛素抵抗的作用
测量体重、脂肪量、脂肪垫重量、食物摄入;进行口服葡萄糖耐量试验和高胰岛素-正葡萄糖钳夹评估胰岛素敏感性。
验证CerS1抑制增加骨骼肌脂肪酸氧化和线粒体呼吸容量
离体比目鱼肌和肌肉匀浆中测定14C-棕榈酸氧化及掺入TAG;透化EDL纤维中测定呼吸链复合物活性;qPCR和Western blot检测线粒体标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与转染 | FuGene-6转染试剂 | Promega | -- |
| 神经酰胺合成酶活性测定 | NBD-二氢鞘氨醇 | -- | -- |
| C18:0-辅酶A | -- | -- | |
| C24:1-辅酶A | -- | -- | |
| C16:0-辅酶A | -- | -- | |
| 细胞处理 | FTY720 | Cayman Chemical Company | -- |
| 伏马菌素B1 | Cayman Chemical Company | -- | |
| 脂质提取 | 17:0/17:0神经酰胺 | Avanti Polar Lipids | -- |
| 17:0/17:0/17:0甘油三酯 | Cayman Chemical | -- | |
| Western blot | 复合物I NADH脱氢酶抗体 | Abcam | ab110242 |
| 复合物II琥珀酸脱氢酶亚基B抗体 | Abcam | ab14714 | |
| 复合物III核心2泛醇-细胞色素c还原酶抗体 | Abcam | ab14745 | |
| 复合物IV细胞色素c氧化酶抗体 | Cell Signaling Technology | 11967S | |
| 复合物V ATP合酶α亚基抗体 | Abcam | ab14748 | |
| PGC1α抗体 | Merck Millipore | AB3242 | |
| AMPKα抗体 | Cell Signaling Technology | 2532S | |
| 磷酸化AMPKα (Thr172)抗体 | Cell Signaling Technology | 2535S | |
| ACC抗体 | Cell Signaling Technology | 3662S | |
| 磷酸化ACC (Ser79)抗体 | Cell Signaling Technology | 3661S | |
| 泛14-3-3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-629 | |
| 胰岛素测定 | 超敏小鼠胰岛素ELISA试剂盒 | Crystal Chem | -- |
| 葡萄糖代谢 | 6,6-2H葡萄糖 | Sigma Aldrich | -- |
| 高胰岛素-正葡萄糖钳夹 | [3,3H]-葡萄糖 | PerkinElmer | -- |
| 2[14C]脱氧葡萄糖 | PerkinElmer | -- | |
| 胰岛素(Actrapid) | Novo Nordisk | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外CerS抑制活性测定 | P053浓度范围、底物种类(C18:0-CoA等)、反应时间30 min、温度37 °C、每个浓度n=3 阅读提示:Methods 'Ceramide synthase assays'小节及Fig. 1图注 |
| 小鼠P053给药 | 给药剂量5 mg/kg/day、给药方式口服灌胃、给药时长4-6周、对照溶剂2% DMSO饮水、饮食脂肪热量比例(chow 8%,HFD 45%) 阅读提示:Methods 'Administration of P053 to mice'小节 |
| 高胰岛素-正葡萄糖钳夹 | 胰岛素输注速率6 mU/kg/min、葡萄糖钳夹水平~8 mM、每组小鼠数量、示踪剂输注方案 阅读提示:Methods 'Hyperinsulinemic-euglycemic clamps'小节 |
| 离体肌肉棕榈酸氧化 | 肌肉类型(比目鱼肌)、预孵育时间30 min、14C-棕榈酸浓度0.5 mM、孵育时间1 h、每组n=5 阅读提示:Methods 'Palmitate oxidation and incorporation into TAG'小节及Fig. 5图注 |
| 脂质组学分析 | 每组样本量18-20、内标种类和用量、统计校正方法(Benjamini, Krieger and Yekutieli,Q=1%) 阅读提示:Methods 'Lipid extraction'和'Lipid quantification'小节及Supplementary Data File 2 |