MLL5通过促进STUB1介导的RIG-I降解抑制抗病毒天然免疫应答

MLL5 suppresses antiviral innate immune response by facilitating STUB1-mediated RIG-I degradation.

作者信息Peipei Zhou, Xiaodan Ding, Xiaoling Wan, Lulu Liu, Xiujie Yuan, Wei Zhang, Xinhui Hui, Guangxun Meng, Hui Xiao, Bin Li, Jin Zhong, Fajian Hou, Lihwen Deng, Yan Zhang
PMID29593341
发布时间2018-03-28
DOI10.1038/s41467-018-03563-8

实验完整度

高

含体外细胞模型、Mll5-/-小鼠模型及VSV感染验证,并有共免疫沉淀、泛素化、蛋白降解等功能与机制验证

主要模型

Mll5-/-小鼠及其来源的BMDMs、PMs和MEFs MLL5-/- HEK293T细胞 VSV-GFP感染的细胞与小鼠标本

重点核对

Mll5-/-小鼠基因型鉴定:exon 3缺失8个核苷酸 VSV-GFP感染剂量与途径:1×10^7 pfu/g或1×10^6 pfu/g静脉注射 poly(I:C)和5′-pppRNA转染浓度与时间:1 μg/ml和0.4 μg/ml,6 h MG132和CHX处理浓度与时间:MG132 30 μM或5 μM,CHX 100 μg/ml RIG-I K48多泛素化检测:MG132 5 μM处理12 h后免疫沉淀

摘要

Trithorax组蛋白MLL5是一种重要的表观遗传修饰因子,控制细胞周期进程、染色质结构维持和造血。然而,MLL5在天然抗病毒免疫中是否发挥作用尚不清楚。本研究表明MLL5抑制RIG-I介导的抗病毒免疫应答。感染水疱性口炎病毒的Mll5缺陷小鼠表现出增强的抗病毒天然免疫、降低的发病率和病毒载量。机制上,部分位于细胞质中的MLL5与RIG-I及其E3泛素连接酶STUB1相互作用,促进RIG-I的K48连接多泛素化和蛋白酶体降解。MLL5缺陷减弱RIG-I与STUB1的结合,减少K48连接多泛素化和RIG-I蛋白在细胞中的积累。病毒感染后,核内MLL5蛋白从细胞核转位至细胞质,诱导STUB1介导的RIG-I降解。本研究揭示了MLL5在抗病毒天然免疫应答中前所未有的作用,并为控制病毒感染提示了新靶点。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
MLL5是否在天然抗病毒免疫中发挥作用及其机制。
核心机制
细胞质MLL5与RIG-I及STUB1结合,促进STUB1介导的RIG-I K48连接多泛素化和蛋白酶体降解;病毒感染时核内MLL5转位至细胞质。
主要证据
Mll5缺陷小鼠和细胞中RIG-I蛋白积累、K48多泛素化减少;MLL5缺失减弱RIG-I与STUB1结合;MLL5过表达剂量依赖性增加RIG-I K48多泛素化;体外和体内VSV感染实验。
研究意义
揭示MLL5在抗病毒天然免疫中的新作用,提示其作为控制RNA病毒感染的潜在靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

Mll5缺陷小鼠构建与表型验证

获得Mll5缺陷小鼠并确认其基本表型。

利用CRISPR/Cas9技术构建Mll5-/-小鼠,导致exon 3缺失8个核苷酸,观察围产期致死、生长迟缓、雄性生育力受损和造血重建能力受损。

2

MLL5对RLR介导的天然免疫应答的抑制效应

验证MLL5是否选择性抑制RLR介导的I型干扰素和炎性因子产生。

用poly(I:C)、5′-pppRNA、LPS、CpG-B、R848、Pam3、ISD及VSV、SeV、HSV-1刺激WT和Mll5-/- BMDMs、PMs、MEFs,检测Ifn-β、Tnf-α、Il6 mRNA和蛋白分泌。

3

MLL5对RLR下游信号通路的调控

确定MLL5抑制RLR信号的作用节点。

在WT和Mll5-/- MEFs及HEK293T细胞中检测VSV感染后IRF3和P65磷酸化及核转位;用MAVS、TBK1、IRF3表达质粒与MLL5共转染进行ISRE荧光素酶报告基因实验。

4

MLL5缺陷对RIG-I蛋白积累和降解的影响

明确MLL5是否通过影响RIG-I蛋白稳定性发挥作用。

检测WT和MLL5-/-细胞中RIG-I、MDA5、MAVS蛋白水平;用CHX和MG132处理检测RIG-I半衰期;用RIG-I敲低验证功能依赖性。

5

MLL5对RIG-I K48多泛素化的调控

验证MLL5是否促进RIG-I的K48连接多泛素化。

在WT和MLL5-/- HEK293T细胞中转染RIG-I-FLAG,免疫沉淀检测K48多泛素化;共转染K48-ubi-His进行His pull-down;MLL5剂量依赖性过表达检测RIG-I多泛素化。

6

MLL5与RIG-I、STUB1的相互作用及结构域定位

确定MLL5、RIG-I和STUB1的相互作用及关键结构域。

共免疫沉淀和质谱鉴定RIG-I相互作用蛋白;用截短突变体确定MLL5的SET域和PHD域、RIG-I的CARD域在结合中的作用;核质分离和共聚焦显微镜观察亚细胞定位。

7

MLL5介导RIG-I与STUB1结合及细胞质MLL5的功能

验证MLL5是否作为衔接蛋白促进RIG-I与STUB1结合,以及细胞质MLL5的必要性。

在WT和MLL5-/-细胞中检测RIG-I与STUB1共免疫沉淀;MLL5剂量依赖性过表达检测RIG-I-STUB1结合;构建MLL5-NLS强制核定位,检测RIG-I降解。

8

体内VSV感染模型验证MLL5的抗病毒免疫调控

在体内验证MLL5缺陷对VSV感染和免疫应答的影响。

WT和Mll5-/-小鼠静脉注射VSV-GFP,检测血清和肝脏、肺组织细胞因子、病毒滴度和复制、肺组织病理及生存率。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
5′-三磷酸RNAInvivoGentlrl-3prna
聚肌苷酸-聚胞苷酸SigmaP1503
MG132SelleckchemS2619
抗MLL5抗体AbgentAP14173a
抗FLAG M2抗体SigmaF1804
抗Actin抗体SigmaA5316
抗HA抗体Roche11583816001
抗RIG-I抗体Cell Signaling Technology3743S
抗P65抗体Cell Signaling Technology8242S
抗磷酸化P65抗体Cell Signaling Technology8242S
抗K48泛素抗体Cell Signaling Technology4289
抗V5抗体Santa Cruz BiotechnologySC-271944
抗His抗体Santa Cruz BiotechnologySC-8036
抗Lamin B1抗体Santa Cruz BiotechnologySC-20682
抗磷酸化IRF3抗体Abcamab138449
抗MDA5抗体Proteintech21775-1-AP
抗MAVS抗体Proteintech14341-1-AP
抗IRF3抗体Proteintech11312-1-AP
抗STUB1抗体BBID154048
抗小鼠Alexa Fluor 555InvitrogeneA21422
抗兔Alexa Fluro 488InvitrogeneA110081
小鼠IFN-β ELISA试剂盒BioLegend439407
小鼠IL-6 ELISA试剂盒BioLegend431301
小鼠TNF-α ELISA试剂盒eBioscience88-7324-88
SYBR Green PCR预混液TakaraDRR420A
双荧光素酶报告基因检测试剂盒BeyotimeRG-027
偶联FLAG特异性单克隆抗体的Sepharose珠SigmaA2220
3×FLAG肽SigmaF4799
镍-次氮基三乙酸珠Qiagen--
DAPISigma--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
体外细胞刺激与感染
poly(I:C)和5′-pppRNA的转染浓度、刺激时间;VSV、SeV、HSV-1的MOI;检测指标Ifn-β、Tnf-α、Il6 mRNA和蛋白
阅读提示:Methods Reagents及Fig. 1图注
RIG-I降解实验
CHX 100 μg/ml和MG132 30 μM的处理时间;RIG-I半衰期检测时间点
阅读提示:Methods Reagents及Fig. 4g, h图注
泛素化实验
MG132 5 μM处理12 h;RIG-I-FLAG转染48 h;K48-ubi-His共转染
阅读提示:Methods Ubiquitination assay及Fig. 4i–k图注
体内VSV感染
小鼠周龄6-9周、性别匹配;VSV-GFP剂量1×10^7 pfu/g或1×10^6 pfu/g;静脉注射途径;检测时间12 h、24 h
阅读提示:Methods Viral infection in vivo及Fig. 3b–i图注
MLL5-NLS功能实验
MLL5-NLS-HA转染量;STUB1-V5 0、400、1000 ng;RIG-I蛋白检测
阅读提示:Fig. 7e, f图注及Methods Plasmid