利用单核RNA测序技术探究存档人胰岛的转录组图谱

背景：人类胰岛是代谢研究中的核心焦点。单细胞RNA测序（scRNA-seq）常被用于探究培养人类胰岛细胞的转录组变化。本研究引入单核RNA测序（snRNA-seq）作为研究移植人类胰岛的替代方法。方法：采用Nuclei EZ方案从新鲜及冷冻人类胰岛细胞中获取细胞核样本。首先利用该样本生成snRNA-seq数据集，并与同一供体细胞的scRNA-seq结果进行比较。最后，我们应用snRNA-seq技术获取了移植于免疫缺陷动物体内存档人类胰岛的转录组图谱。结果：在新鲜及冷冻培养或移植的人类胰岛样本中，我们发现scRNA-seq与snRNA-seq在细胞类型鉴定、基因比例分析方面具有高度一致性，且整体及胰岛细胞类型基因特征呈现显著相关性。结论：我们提出snRNA-seq可作为研究新鲜获取或冷冻移植人类胰岛细胞转录组特征的可靠策略，特别是在scRNA-seq不适用的情况下具有独特优势。