体外T辅助细胞分化
评估Cbl-b缺失对不同T辅助细胞亚群分化的影响,特别是Th9和Treg。
从WT和Cblb−/−小鼠脾脏分离初始CD4+ T细胞,在特定细胞因子和抗体组合下极化为Th1、Th2、Th9、Treg和Th17细胞,培养48小时、72小时或5天。
Tumor rejection in Cblb-/- mice depends on IL-9 and Th9 cells
包含体外T细胞分化实验、体内肿瘤模型、抗体中和实验、单细胞RNA测序及功能验证等多个独立证据层级。
Cblb−/−小鼠 OT-II*Cblb−/− Th9细胞 B16-OVA黑色素瘤模型 HCmel3黑色素瘤模型
Cblb−/−小鼠中敲除Cblb对Th9和Treg细胞分化的影响 体外Th9分化条件:3 ng/mL hTGFβ, 20 ng/mL IL-4, 20 µg/mL anti-IFNγ B16-OVA肿瘤模型中过继转移OT-II*Cblb−/− Th9细胞的剂量和时间(3×10^6细胞,第5天和第10天) HCmel3肿瘤模型中抗IL-9抗体的给药方案(200 µg,静脉注射,第-1、0、1天及之后每三天) scRNA测序中Th9细胞分化的时间点(48小时)及测序深度(约80,000 reads/细胞)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估Cbl-b缺失对不同T辅助细胞亚群分化的影响,特别是Th9和Treg。
从WT和Cblb−/−小鼠脾脏分离初始CD4+ T细胞,在特定细胞因子和抗体组合下极化为Th1、Th2、Th9、Treg和Th17细胞,培养48小时、72小时或5天。
确定Cbl-b缺失对Th9和Treg细胞增殖及抑制功能的影响。
使用CFSE染色分析Th9和Treg细胞增殖;通过共培养实验评估Treg细胞的抑制功能。
验证IL-9在Cblb−/− Treg分化抑制中的作用。
在Treg分化过程中添加中和性抗IL-9抗体(5, 10, 20 µg/mL),分析Treg频率及Foxp3表达。
解析Cbl-b缺失对Th9细胞转录组的影响。
从WT和Cblb−/−小鼠脾脏分离初始CD4+ T细胞,体外极化为Th9细胞48小时,进行scRNA测序。
评估Cblb−/− Th9细胞在体内的抗肿瘤效果。
将OT-II或OT-II*Cblb−/− Th9细胞过继转移至B16-OVA荷瘤小鼠,监测肿瘤生长和生存期。
验证IL-9在Cblb−/−小鼠肿瘤排斥中的作用。
在HCmel3肿瘤模型中,用中和性抗IL-9抗体处理Cblb−/−小鼠,观察肿瘤生长和免疫浸润。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Life Technologies | -- |
| 胎牛血清 | Biochrome | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Invitrogen | -- | |
| G418 | Sigma | -- | |
| β-巯基乙醇 | -- | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Life Technologies | -- | |
| 非必需氨基酸 | Life Technologies | -- | |
| HEPES | Life Technologies | -- | |
| T细胞分化 | 重组人TGFβ | -- | -- |
| 重组IL-4 | -- | -- | |
| 抗IFNγ抗体 | -- | -- | |
| 抗IL-9中和抗体 | Bio X Cell | -- | |
| 流式细胞术 | 抗小鼠CD3抗体 | -- | 145-2C11 |
| 抗小鼠CD4抗体 | -- | RM4-5 | |
| 抗小鼠CD8α抗体 | -- | 53-6.7 | |
| 抗小鼠Foxp3抗体 | -- | FJK16s | |
| 抗小鼠IL-9抗体 | -- | RM9A4 | |
| BD FACSCanto II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 蛋白提取 | NP-40 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂(抑肽酶,亮抑酶肽) | -- | -- | |
| Western blot | 抗NFATc1抗体 | Santacruz | 7294 |
| 抗Cbl-b抗体 | Abcam | 54362 | |
| 抗PU.1抗体 | Cell Signaling Technology | 2266 | |
| 抗IRF4抗体 | Cell Signaling Technology | 4964 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| 抗肌动蛋白抗体 | Santacruz | 1615 | |
| 抗lamin B1抗体 | Abcam | 16048 | |
| RT-qPCR | RNeasy试剂盒 | Qiagen | -- |
| Quick-RNA小提试剂盒 | Zymo Research | -- | |
| RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 高容量cDNA反转录试剂盒 | Applied Biosystems | -- | |
| SYBR Green PCR预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| Mastercycler RealPlex2 | Eppendorf | -- | |
| LightCycler 480实时PCR系统 | Roche Diagnostics | -- | |
| NanoDrop 2000 | -- | -- | |
| scRNA-seq | 初始CD4+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | -- |
| CD4 (L3T4) 微珠 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 10x Genomics单细胞3'试剂盒V.3 | 10x Genomics | -- | |
| Illumina NovaSeq 6000测序系统 | Illumina | -- | |
| 细胞因子检测 | BD细胞计数微球阵列Flex Sets | BD Biosciences | -- |
| 组织学 | 锌基固定液 | BD | -- |
| 抗CD45单克隆抗体(30-F11) | BD Pharmingen | -- | |
| Dako Real检测系统 | Dako | -- | |
| 体外杀伤实验 | Zombie可固定活力试剂盒 | BioLegend | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| T辅助细胞分化 | 初始CD4+ T细胞分离方法、极化细胞因子组合及浓度、培养时间(48小时、72小时、5天) 阅读提示:Methods: In vitro differentiation of naïve CD4+ T cells |
| IL-9中和实验 | 抗IL-9抗体浓度(5, 10, 20 µg/mL)、培养时间(72小时、5天) 阅读提示:Results: Increased IL-9 secretion by Cblb−/− T cells suppresses Treg differentiation |
| 单细胞RNA测序 | Th9细胞分化时间(48小时)、测序平台参数、样本数量(3×WT, 3×Cblb−/−) 阅读提示:Methods: Single-cell RNA sequencing; Results: Single-cell RNA sequencing of in vitro generated Th9 cells |
| 肿瘤模型与过继转移 | B16-OVA细胞注射量、Th9细胞过继转移时间及剂量、肿瘤测量频率 阅读提示:Methods: Tumor experiments; Results: Adoptively transferred Cblb−/− Th9 cells exert superior antitumor activity |
| 体内IL-9阻断 | 抗IL-9抗体剂量(200 µg)、给药时间(第-1、0、1天及之后每三天)、HCmel3细胞注射量 阅读提示:Methods: Tumor experiments; Results: IL-9 is critically involved in tumor-rejection in Cblb−/− mice |