体内筛选鉴定出一种SIK抑制剂通过瞬时UPR诱导β细胞增殖

In vivo screen identifies a SIK inhibitor that induces β cell proliferation through a transient UPR

作者信息Jérémie Charbord, Lipeng Ren, Rohit B Sharma, Anna Johansson, Rasmus Ågren, Lianhe Chu, Dominika Tworus, Nadja Schulz, Pierre Charbord, Andrew F Stewart, Peng Wang, Laura C Alonso, Olov Andersson
PMID34031592
期刊Nat Metab
发布时间2021-05
DOI10.1038/s42255-021-00391-x

实验完整度

高

包含体外高通量筛选(LUCCI)、斑马鱼体内模型、小鼠及人类胰岛细胞实验、动物体内实验(野生型小鼠)、单细胞RNA-seq、机制验证(Atf6敲低、IRE1抑制剂)等至少两个独立证据层级,并包含明确的功能验证和机制验证。

主要模型

斑马鱼转基因系Tg(ins:NLuc-gmnn) 小鼠原代胰岛细胞(C57BL/6J) 人类胰岛细胞(尸体供体) MIN6小鼠β细胞系

重点核对

斑马鱼β细胞再生模型中HG的浓度(10 μM) 小鼠胰岛细胞培养中HG的处理时间(48小时和96小时) 小鼠原代胰岛细胞中HG的剂量(从5 μM到0.02 μM的范围) 体内小鼠模型中HG的给药剂量(10 mg/kg/天) 人类胰岛细胞中HG的处理浓度(1 μM)

摘要

已知β细胞增殖在发育过程中以及成体某些高血糖条件下会扩增β细胞团,这一过程可能用于糖尿病的β细胞再生。在此,我们通过在斑马鱼中使用基于发光泛素化的细胞周期指示剂(LUCCI)进行新的高通量筛选,鉴定出HG-9-91-01(以下简称HG)是驱动增殖的因素,并在小鼠和人类β细胞中证实了这一效应。HG-9-91-01是一种盐诱导激酶(SIKs)抑制剂,并且Sik1在β细胞中的过表达阻断了HG-9-91-01对β细胞增殖的作用。对小鼠β细胞的单细胞转录组分析表明,HG-9-91-01在细胞周期进入前诱导了一波激活转录因子(ATF)6依赖的未折叠蛋白反应(UPR)。重要的是,UPR波与胰岛素表达的增加无关。进一步的机制研究表明,HG-9-91-01诱导了SIK抑制下游的多种信号效应因子,包括CRTC1、CRTC2、ATF6、IRE1和mTOR,它们整合在一起共同驱动β细胞增殖。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
如何鉴定能够促进β细胞增殖的化学物质,并阐明其作用机制。
核心机制
HG通过抑制盐诱导激酶(SIKs),触发ATF6和IRE1依赖的瞬时未折叠蛋白反应(UPR),尽管胰岛素表达下调,最终通过整合CRTC1、CRTC2、ATF6、IRE1和mTOR等效应因子,驱动β细胞增殖。
主要证据
通过斑马鱼体内筛选、微量滴定板上的斑马鱼LUCCI实验、组织切片上的β细胞增殖分析、流式细胞术、单细胞RNA-seq、Western blot、免疫荧光等技术,HG被证实可增加β细胞增殖,并鉴定出其作用机制涉及UPR。
研究意义
该研究提出了一种新概念,即小分子HG能够在不通过增加胰岛素表达引起ER应激的情况下激活UPR,从而利用UPR扩增β细胞数量,为糖尿病治疗提供了潜在策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

在斑马鱼中进行化学筛选

鉴定能够促进β细胞增殖的化合物。

建立了表达LUCCI报告基因的转基因斑马鱼系Tg(ins:NLuc-gmnn),使用此模型筛选化学库(包含3119种化合物),寻找在基础状态和β细胞再生状态下能增加LUCCI信号的化合物。

2

在离体小鼠胰岛素瘤细胞中验证增殖效应

验证HG在哺乳动物系统中的促增殖效应。

从小鼠分离胰岛并用Accutase分散,用HG(或对照)处理细胞48小时或96小时,通过Ki67表达和EdU掺入分析评估β细胞增殖。

3

在小鼠和人类胰岛细胞中证实HG的效应

确认HG在更高级物种中对β细胞增殖的影响。

通过免疫荧光和EdU/BrdU掺入,评估HG对小鼠和人类胰岛细胞中β细胞增殖的影响。

4

通过单细胞转录组学分析揭示新机制

识别HG处理β细胞后的早期转录特征。

对离体小鼠胰岛分散细胞进行scRNA-seq(Smart-seq2),在HG处理6小时、48小时和96小时后进行细胞聚类和轨迹分析。

5

验证ATF6和IRE1通路在HG诱导增殖中的作用

验证UPR在HG机制中的必需性。

使用Atf6敲低(通过Ad-Cre转导Atf6 floxed小鼠胰岛)和IRE1抑制剂(4μ8C)处理,评估它们对HG诱导的β细胞增殖的影响。同时,在MIN6细胞中评估了HG对BIP和ATF6-N蛋白水平的影响。

6

在体内评估HG的效果

在活体环境中评估HG对β细胞增殖及UPR激活的影响。

将含有HG(10 mg/kg/天)或赋形剂的微型渗透泵皮下植入野生型C57BL/6J小鼠,通过BrdU掺入评估β细胞增殖,通过免疫组化检测BIP表达评估UPR激活。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
GloMax 96微孔板发光计PromegaGM3000
AccutaseSigma-Aldrich--
RPMI 1640培养基Thermo Fisher Scientific21875034
胎牛血清Thermo Fisher Scientific26140079
青霉素-链霉素Thermo Fisher Scientific10378016
HG-9-91-01MedChemExpressHY-15776
利尼伐尼SelleckchemS1003
哈尔明碱Sigma-Aldrich286044
伊马替尼SelleckchemS2475
IRE1抑制剂4μ8CSigma-Aldrich412512
AA 147Tocris6759
PP 242Tocris4257
4-苯基丁酸Sigma-AldrichSML0309
抗胰岛素抗体DakoA0564
抗Ki67抗体Abcamab15580
DAPISigma-AldrichD9542
Click-iT EdU Alexa Fluor 555成像试剂盒Thermo Fisher ScientificC10338
抗BrdU抗体Abcamab6326
Click-iT TUNEL Alexa Fluor 647成像检测试剂盒Thermo Fisher ScientificC10247
LSM 710共聚焦显微镜Zeiss--
ImageXpress Micro XLS宽场系统Molecular Devices--
抗磷酸化IRE1抗体Abcamab124945
抗sXBP1抗体Cell Signaling Technology12782
抗CHOP抗体Cell Signaling Technology2895
抗磷酸化EIF2抗体Cell Signaling Technology9721
抗肌动蛋白抗体EMD MilliporeMAB1501
抗ATF6抗体Proteintech24169-1-AP
抗BIP抗体Cell Signaling3177
抗组蛋白H3抗体Abcamab1791
抗GAPDH抗体Abcamab8245
SuperScript IV VILO试剂盒Thermo Fisher Scientific11756050
SYBR Green----
RealPlex 2 PCR仪Eppendorf--
Illumina HiSeq 2000Illumina--
7-AADBD Biosciences559925
BD FACSAria IIIBD Biosciences--
MIN6细胞AddexBioC0018008
衣霉素Sigma-AldrichT7765
β-巯基乙醇Sigma-AldrichM3148
抗Flag抗体Sigma-AldrichF7425
蛋白A/G磁珠Thermo Fisher Scientific88803
微型渗透泵Alzet--
抗BIP抗体Cell Signaling3177
抗BrdU抗体Abcam152095
抗胰岛素抗体DakoA0564
柠檬酸盐缓冲液DakoS236984
抗GFP抗体Aves LabsGFP-1020
抗dsRed抗体Clontech632496

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
斑马鱼LUCCI筛选
斑马鱼品系、发育阶段、处理浓度、处理时间
阅读提示:Methods: Luminescence ubiquitination-based cell cycle indicator; 图1及图注
小鼠胰岛细胞离体培养
小鼠品系、胰岛分离消化步骤、培养基组分与浓度、处理时间、检测方法
阅读提示:Methods: Mouse islet isolation and cell culture
人类胰岛细胞培养
人类胰岛供体信息、分离方法、培养基组成、处理时间
阅读提示:Methods: Human islets
体内小鼠实验
小鼠品系、年龄、性别、渗透泵型号、HG给药剂量、治疗时间、BrdU掺入剂量与方式
阅读提示:Methods: In vivo mouse study
MIN6细胞实验
细胞系来源与代数、培养基组成、HG浓度、处理时间、检测蛋白
阅读提示:Methods: Mouse islet isolation and cell culture; 图8
Atf6敲低实验
Atf6 floxed小鼠背景、胰岛分散、腺病毒转导(Ad-Cre或Ad-LacZ)的MOI和时间、HG浓度和处理时间
阅读提示:Methods: Adenovirus transduction of mouse islet cells; 图7e
Western blot
细胞裂解液组成、蛋白上样量、凝胶浓度、转膜条件、一抗浓度、二抗浓度、显色底物
阅读提示:Methods: Western blotting
scRNA-seq
细胞消化方法、细胞数量、文库制备协议(Smart-seq2)、测序平台与读长、数据过滤标准(QC指标)
阅读提示:Methods: Single-cell RNA-seq of islet cells; 扩展数据图3
免疫沉淀
转染质粒、转染试剂、处理时间、裂解缓冲液、抗体、洗涤条件
阅读提示:Methods: Immunoprecipitation; 扩展数据图5b,c