AAV9递送载体构建与生产
生成用于基因递送和沉默的AAV9载体。
构建了表达靶向人SOD1的shRNA、GFP或Rpl22-3xHA的自我互补AAV9载体,并通过HEK293T细胞三重转染、纯化和滴度测定进行生产。
Spinal subpial delivery of AAV9 enables widespread gene silencing and blocks motoneuron degeneration in ALS
包含体外病毒载体构建与生产、小鼠疾病模型的功能与病理学验证、电生理评估、大型动物(猪和非人灵长类)递送验证及转录组分析等多个独立证据层级,并具备明确的功能验证和机制验证。
SOD1G37R转基因小鼠(C57BL/6背景) 成年野生型B6小鼠 成年哥廷根-明尼苏达小型猪 成年食蟹猴
SP与IT AAV9递送在成年小鼠脊髓中表达效率的比较 SP AAV9-shRNA-SOD1在SOD1G37R小鼠中沉默突变SOD1 mRNA的效率(约80%降低) 疾病发作前(约120天)或发作后(约348天)SP AAV9-shRNA-SOD1治疗的效应 SP注射后脑运动中枢的逆行转导 新设计的人用SP注射装置在成年猪中的功能验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
生成用于基因递送和沉默的AAV9载体。
构建了表达靶向人SOD1的shRNA、GFP或Rpl22-3xHA的自我互补AAV9载体,并通过HEK293T细胞三重转染、纯化和滴度测定进行生产。
评估脊髓软膜下(SP)与鞘内(IT)递送AAV9的分布和表达效率。
在成年野生型小鼠中,通过SP(C4和L1)或IT(L1)注射AAV9-UBI-GFP或AAV9-UBI-Rpl22-3xHA,观察脊髓和脑运动中枢的基因表达。在SOD1G37R小鼠中比较SP和IT递送AAV9-shRNA-SOD1的基因沉默效率。在猪和NHP中比较SP和IT递送。
评估SP递送AAV9-shRNA-SOD1在疾病发作前对SOD1G37R小鼠的预防效果。
在约120天龄的SOD1G37R小鼠中,通过SP在颈段和腰段注射AAV9-shRNA-SOD1,并进行长时间的疾病进展、运动功能、电生理、组织学、MRI和转录组学评估。
评估SP递送AAV9-shRNA-SOD1在疾病发作后对SOD1G37R小鼠的治疗效果。
在约348天龄的SOD1G37R小鼠中,通过SP在颈段和腰段注射AAV9-shRNA-SOD1,评估对疾病进展、运动功能、运动神经元存活和病理变化的影响。
在脊髓尺寸与成人相似的猪中验证新设计的SP注射装置和递送效率。
使用新设计的人用SP注射装置,对成年猪进行颈段SP AAV9-UBI-GFP注射,评估脊髓和脑运动中枢的基因表达分布。
在非人灵长类中验证SP AAV9递送的有效性和安全性。
对成年食蟹猴进行颈段SP AAV9-UBI-Rpl22-3xHA注射,评估颈椎脊髓的转导效率和神经元/胶质细胞特异性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 病毒载体生产 | scAAV9-SOD1-shRNA | -- | -- |
| scAAV9-UBI-GFP | -- | -- | |
| scAAV9-UBI-Rpl22-3xHA | -- | -- | |
| 动物手术(SP/IT注射) | 30-G针头 | -- | -- |
| 36-G软膜穿透针 | -- | -- | |
| 36-G注射针头 | -- | -- | |
| Hamilton注射器 | Hamilton | -- | |
| 微量注射泵 MINJ-PD | Tritech Research | -- | |
| SMM 100B | Narishige | -- | |
| 葡聚糖 | -- | -- | |
| 普理灵3/0缝线 | -- | -- | |
| 动物手术(NHP/猪) | 丙泊酚 | -- | -- |
| 异氟烷 | -- | -- | |
| 头孢唑林 | -- | -- | |
| 甲泼尼龙(Depo-Medrol) | -- | -- | |
| 他克莫司 | -- | -- | |
| 行为学测试 | 握力计 | Columbus Instruments | -- |
| EthoVision XT 7.1 | Noldus IT | -- | |
| 电生理记录(MEP) | DS3恒流隔离刺激器 | Digitimer | -- |
| 电生理记录(MEP/EMG) | 30-G铂经皮针电极 | Grass Technologies, Astro-Med | -- |
| 有源头级 3110W | Warner Instruments | -- | |
| DP-311差分放大器 | Warner Instruments | -- | |
| PowerLab 8/30数据采集系统 | ADInstruments | -- | |
| 组织处理 | OCT包埋剂 | Tissue-Tek, Sakura Finetek | -- |
| 免疫组织化学 | ProLong Gold抗淬灭封片剂(含DAPI) | Invitrogen | -- |
| 免疫组织化学(抗体) | 错误折叠hSOD1抗体(小鼠,克隆B8H10) | Medimabs | MM-0070-P |
| NeuN抗体(兔) | Millipore-Sigma | ABN78 | |
| 胆碱乙酰转移酶抗体(山羊) | Millipore-Sigma | AB144P | |
| GFAP-Cy3抗体(小鼠,克隆G-A-5) | Millipore-Sigma | C9205 | |
| Iba1抗体(兔,克隆NCNP24) | Wako | 019-19741 | |
| GFP抗体(鸡) | Abcam | AB13970 | |
| HA抗体(小鼠,克隆HA-7) | Millipore-Sigma | H9658 | |
| α-银环蛇毒素(Alexa Fluor 555偶联物) | Invitrogen | B35451 | |
| 突触素抗体(兔) | Millipore-Sigma | S193 | |
| 神经丝抗体(鸡) | Millipore-Sigma | AB5539 | |
| 酪氨酸羟化酶抗体(兔) | Millipore-Sigma | AB152 | |
| 免疫组织化学(二抗) | 驴抗兔、抗小鼠、抗鸡或抗山羊Cy3、Cy5或Alexa 488偶联二抗 | Jackson ImmunoResearch | -- |
| 半薄切片制备 | 明胶 | BDH Ltd | -- |
| 蔗糖 | -- | -- | |
| 鸡卵清蛋白 | BDH Ltd | -- | |
| Durcupan树脂 | -- | -- | |
| 甲苯胺蓝 | -- | -- | |
| Poly-Mount封片剂 | Polysciences, Inc. | -- | |
| 形态定量分析 | Aperio AT2 | Leica | -- |
| NeuroCounter | -- | -- | |
| FISH | RNAscope Multiplex Fluorescent v.2试剂盒 | Thermo Fisher | 323100 |
| Superfrost Plus载玻片 | Thermo Fisher | -- | |
| TSA Plus Cyanine 3系统 | PerkinElmer | -- | |
| 荧光显微镜 | Zeiss AxioImager M2显微镜 | Carl Zeiss | -- |
| Fluoview FV1000显微镜 | Olympus | -- | |
| 图像分析 | ImageJ | -- | -- |
| 实时定量PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| M-MLV逆转录酶 | Invitrogen | -- | |
| iQSYBR Green supermix | Bio-Rad | -- | |
| iCycler iQ5多色实时PCR检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| 蛋白质印迹 | 4-12% Bis-Tris Plus凝胶 | Invitrogen | -- |
| 聚偏二氟乙烯膜 | -- | -- | |
| SuperSignal West Femto最大灵敏度底物 | Millipore | 34095 | |
| ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 蛋白质印迹(抗体) | 抗SOD1抗体(兔) | Abcam | 16831 |
| 蛋白质印迹(二抗) | 抗兔IgG辣根过氧化物酶标记抗体 | Cell Signaling | 7074S |
| 蛋白质印迹(抗体) | β-肌动蛋白抗体(小鼠,克隆GT5512) | GeneTex | GTX629630 |
| 蛋白质印迹(二抗) | 抗小鼠IgG辣根过氧化物酶标记抗体 | Cell Signaling | 7076S |
| RNA测序 | Qiagen RNeasy Plus Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| TruSeq链式mRNA文库制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| HiSeq4000测序平台 | Illumina | -- | |
| MRI | 9.4-T AVHD 400-MHz Bruker显微成像系统 | Bruker Biospin | -- |
| Amira 3D软件v.6.0.1 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism v.5软件 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 病毒载体生产 | 载体构建和生产方法:HEK293T细胞转染、纯化方法、病毒滴度 阅读提示:Methods: Viral vectors |
| 动物模型 | 小鼠品系和年龄、性别、数量,NHP和猪的品系、体重、数量 阅读提示:Methods: Animals, Experimental design |
| SP注射 | 注射位置、注射量、病毒滴度、注射速度、麻醉药物、术后护理 阅读提示:Methods: SP injections |
| IT注射 | 注射位置、注射量、病毒滴度、注射速度、麻醉药物、术后护理 阅读提示:Methods: IT injections |
| 疾病监测 | 疾病发作标准和终点定义 阅读提示:Methods: Onset and survival analysis |
| 电生理记录 | 麻醉方法、刺激参数、记录电极放置 阅读提示:Methods: Myogenic MEP recording, Resting EMG recording, Hind paw, vagal nerve electrical stimulation and HR recording |
| 组织处理和分析 | 固定、切片、免疫组化抗体和稀释度、FISH探针和步骤、qPCR和western blot条件 阅读提示:Methods: Tissue collection, Immunohistochemistry, FISH, Real-time qPCR, Western immunoblot |
| RNA-seq | RNA提取方法、文库制备、测序平台、分析流程 阅读提示:Methods: RNA-seq |
| MRI | MRI参数、样本准备、图像分析 阅读提示:Methods: MRI |