长期JARID2敲除的安全性评估
评估长期缺失JARID2是否诱导造血病理转化。
用CRISPR/Cas9靶向UCB CD34+细胞JARID2,移植入NSG小鼠并观察1年,检测PB嵌合、谱系分化、血常规及组织病理。
JARID2 inhibition reprograms human hematopoietic progenitor cells to enhance bone marrow transplantation
体外shRNA敲低、CRISPR敲除、原代与二次NSG移植、scRNA-seq、CUT&RUN、CUT&TAG及功能回补验证
人脐带血CD34+造血干/祖细胞 NOD-scid IL2Rγnull (NSG) 小鼠移植模型 NOD.Cg-Prkdcscid Il2rgtm1Wjl (NSGS) 小鼠 HEL细胞系
JARID2 shRNA序列及敲低效率验证(shJARID2#1/#3等) 移植细胞数量:初级约2.5×10^5(CRISPR)或全培养物,二次1.0×10^6或4.0×10^5 CD34+细胞 多西环素诱导浓度200 ng/mL及体内1250 ppm含多西环素饲料 移植后检测时间点:PB约16-20周,BM约20-26周 STAT1敲低回补实验验证功能依赖STAT1
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估长期缺失JARID2是否诱导造血病理转化。
用CRISPR/Cas9靶向UCB CD34+细胞JARID2,移植入NSG小鼠并观察1年,检测PB嵌合、谱系分化、血常规及组织病理。
验证JARID2抑制是否增强人HSPC的体外输出和体内再增殖能力。
UCB CD34+细胞转导组成性shRNA,体外培养8天后检测细胞输出和CFU,移植NSG小鼠评估PB/BM嵌合及HSPC数量,并进行二次移植。
模拟临床短暂暴露并验证JARID2抑制的可逆性及体内直接重编程能力。
使用多西环素诱导型shRNA,体外诱导8天后移植,或在移植后14周通过含多西环素饲料体内诱导,检测PB/BM嵌合及HSPC数量。
确定体外培养后具有再增殖功能的人HSPC表型。
分选不同表型HSPC亚群移植NSG小鼠,结合CFU和CITE-seq分析,鉴定CD34+ EPCR+ CD90+ CD49f− CD71−为功能再增殖组分。
比较JARID2 KD与EZH2 KD的表观遗传效应,判断JARID2是否通过PRC2/H3K27me3发挥作用。
Western blot检测H3K27me3,CUT&RUN和CUT&TAG检测H3K27me3及STAT1结合,结合RNA-seq分析。
验证STAT1上调及MHCII表达是否介导JARID2抑制的功能增强。
检测JARID2-KD HSC中MHCII和STAT1表达,STAT1敲低回补CFU实验,CUT&RUN分析STAT1基因组结合。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| CD34+细胞富集 | MACS CD34磁珠分选试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-100-453 |
| 细胞培养 | SFEM II培养基 | Stemcell Technologies | 09605 |
| CRISPR/Cas9基因敲除 | Cas9核糖核蛋白复合物 | Integrated DNA Technologies | 1074181 |
| 慢病毒转导 | LentiBOOST转导增强剂 | Sirion Biotech | SB-P-LV-101-12 |
| shRNA表达载体 | 优化microRNA慢病毒骨架 | Addgene | 111170 |
| 动物实验 | NOD-scid IL2Rγnull (NSG) 小鼠 | The Jackson Laboratory | 005557 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| UCB CD34+细胞培养与扩增 | 培养基SFEM II、添加因子SCF/TPO/FLT3L均为100 ng/mL、青霉素-链霉素50 U/mL 阅读提示:Methods中Human cord blood samples及HSPC culture and expansion assays小节 |
| 慢病毒转导与shRNA敲低 | shRNA序列、LentiBOOST (1:100)和protamine sulfate (1:1000)用量、转导后培养8天 阅读提示:Methods中Lentiviral vectors for shRNAs及Human HSPC transplantation小节 |
| 多西环素诱导型敲低 | 体外多西环素200 ng/mL诱导8天;体内1250 ppm含多西环素饲料;移植后14周开始诱导 阅读提示:Methods中HSPC culture and expansion assays小节及Figure 4图注 |
| NSG小鼠移植 | 受体鼠龄8-12周、200 rads伽马照射、逆行眶后注射、移植细胞数量 阅读提示:Methods中Animals及Human HSPC transplantation小节 |
| 移植后检测时间点与终点 | PB嵌合检测约16-20周、BM采集约20-26周;二次移植细胞数1.0×10^6或4.0×10^5 CD34+细胞 阅读提示:Results中相关段落及Figure 2、Figure 4图注 |