筛选并鉴定GBM微环境中调控MDSC的神经肽
从CNS来源分泌因子中识别影响MDSC生物学和肿瘤-MDSC共生的关键神经肽。
基于HGNC数据库中63个编码分泌蛋白的神经肽基因,结合TCGA GBM免疫评分相关性、间充质亚型高表达、CD45−肿瘤细胞及单细胞RNA-seq数据分析,鉴定GAL;并用GSEA分析其与免疫细胞特征的关系。
Galanin impairs tumor immunity in glioblastoma by promoting infiltration and ferroptosis resistance of myeloid-derived suppressor cells
含体外MDSC迁移、蛋白泛素化及铁死亡检测,Galr3-KO与骨髓移植小鼠模型、多种GBM原位模型及生存分析,并有多组学与临床样本
U87、U251、CT2A细胞及005 GSC 小鼠骨髓来源MDSC及人外周血来源MDSC C57BL/6、裸鼠及Galr3-KO/ERα-KO小鼠原位GBM模型 GBM患者血浆与肿瘤组织样本
GAL及GALR3配体处理浓度:GAL 10 ng/ml,SNAP 1 μM,M40/M871 1 μM SNAP体内给药:30 mg/kg,腹腔注射,每日一次,第7天起共10次 RSL3体内给药:50 mg/kg,腹腔注射,隔日一次,第7天起共5次 抗PD1给药:10 mg/kg,腹腔注射,第11、14和17天 肿瘤接种量:CT2A 2×10^4细胞,005 GSC 2×10^5细胞,U87 2×10^4细胞,颅内接种
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从CNS来源分泌因子中识别影响MDSC生物学和肿瘤-MDSC共生的关键神经肽。
基于HGNC数据库中63个编码分泌蛋白的神经肽基因,结合TCGA GBM免疫评分相关性、间充质亚型高表达、CD45−肿瘤细胞及单细胞RNA-seq数据分析,鉴定GAL;并用GSEA分析其与免疫细胞特征的关系。
确认GBM来源GAL是否直接促进MDSC尤其是mMDSC的迁移。
使用小鼠骨髓来源MDSC、Raw264.7来源MDSC和人外周血来源MDSC,经GAL蛋白或GBM细胞条件培养基处理后进行Transwell迁移和Incucyte活细胞轨迹分析;并用shRNA敲低GAL及回补实验验证。
明确GAL及GALR3在免疫健全小鼠GBM模型中对生存、mMDSC浸润和T细胞活化的作用。
在裸鼠和C57BL/6小鼠颅内接种shC或shGAL的U87、CT2A、005 GSC细胞,以及使用Galr3-KO小鼠、骨髓移植和SNAP药理抑制,检测生存、mMDSC/gMDSC/巨噬细胞浸润及T细胞活化。
阐明GAL-GALR3轴促进mMDSC迁移的分子机制。
对GAL处理的骨髓MDSC进行RNA-seq和GSEA,检测ERα表达与核转位;通过CHX追踪、免疫共沉淀检测ERα泛素化,筛选去泛素化酶并验证USP51;用shUsp51、Ful和ERα-KO验证通路。
确定GAL信号是否保护mMDSC免于铁死亡并影响其迁移。
利用RSL3诱导铁死亡,检测MDSC活力、FAC诱导的 labile iron、C11-BODIPY脂质过氧化和4-HNE;并进行脂质组学分析及多种细胞死亡抑制剂 rescue 实验。
确认MBOAT1为ERα下游效应分子,并评估GALR3抑制联合铁死亡诱导及anti-PD1的疗效。
用ERα-KO、shMboat1和Mboat1表达检测验证通路;在CT2A和005 GSC荷瘤小鼠中联合SNAP、RSL3或IKE与anti-PD1,评估mMDSC浸润、T细胞活化、生存及再挑战免疫记忆。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 11995-065 |
| 抗生素-抗真菌剂 | Gibco | 15140-122 | |
| 胎牛血清 | Fisher Scientific | 16140071 | |
| 神经干细胞增殖培养基 | Millipore | SCM005 | |
| 表皮生长因子 | PeproTech | AF-100-15 | |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | PeproTech | 100-18B | |
| 小鼠重组GM-CSF | PeproTech | 315-03-100UG | |
| 小鼠重组IL-13 | Miltenyi Biotec | 130-094-070 | |
| 流式分析 | 可固定活性染料 | Invitrogen | 65-0865-14 |
| 抗CD16/CD32封闭抗体 | BioLegend | 101320 | |
| PE/Cy7抗小鼠/人CD11b抗体 | BioLegend | 101216 | |
| AlexaFluor 700抗小鼠Ly6C抗体 | BioLegend | 128024 | |
| PE抗小鼠CD68抗体 | BD Bioscience | 566386 | |
| FITC抗小鼠Ly6G抗体 | BioLegend | 127606 | |
| 免疫印迹 | GAL抗体 | Invitrogen | PA5-95500 |
| ERα抗体 | Invitrogen | MA1-80216 | |
| ERβ抗体 | Invitrogen | PA1-311 | |
| 组蛋白H3抗体 | Cell Signaling Technology | 9715S | |
| USP51抗体 | Invitrogen | PA5-68358 | |
| 肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 4967S | |
| 抗小鼠二抗 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| 抗兔二抗 | Cell Signaling Technology | 7074S | |
| Femto最高灵敏度底物 | Thermo Scientific | 34096 | |
| shRNA敲低 | pLKO.1载体 | Sigma | SHC001 |
| pMD2.G质粒 | Addgene | 12259 | |
| psPAX2质粒 | Addgene | 12260 | |
| 嘌呤霉素 | Millipore | 540411 | |
| 迁移实验 | 5.0 μm可渗透聚碳酸酯膜插入物 | Corning | 07-200-149 |
| GAL重组蛋白 | OriGene | TP307053 | |
| 结晶紫 | Sigma | C-3886 | |
| 细胞活力检测 | 固定缓冲液 | BioLegend | 420801 |
| 脂质过氧化检测 | BODIPY 581/591 C11试剂 | Fisher Scientific | D3861 |
| 不稳定铁检测 | 柠檬酸铁铵 | MedChemExpress | HY-B1645 |
| BioTracker远红不稳定Fe2+活细胞染料 | MilliporeSigma | SCT037 | |
| 免疫荧光 | CD69抗体 | Santa Cruz | sc-373799 |
| CD11b抗体 | Abcam | ab8878 | |
| F4/80抗体 | Cell Signaling | 30325S | |
| 4-HNE抗体 | Invitrogen | MA5-27570 | |
| CD14抗体 | Abcam | ab181470 | |
| CD66b抗体 | NOVUS | NB100-77808 | |
| DAPI抗淬灭封片剂 | Vector Laboratories | H-1200-10 | |
| RT-qPCR | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | 74106 |
| 一体化5×逆转录预混液 | Applied Biological Materials | G592 | |
| SYBR green PCR预混液 | Bio-Rad | 1725275 | |
| 流式分析 | GALR1抗体 | G-Biosciences | ITT1844 |
| GALR2抗体 | G-Biosciences | ITT1845 | |
| GALR3抗体 | Abcam | ab190694 | |
| AlexaFluor 488抗小鼠CD3抗体 | BioLegend | 100210 | |
| PerCP/Cyanine5.5抗小鼠CD45抗体 | BioLegend | 103132 | |
| PE/Cy7抗小鼠CD69抗体 | BioLegend | 104512 | |
| BV711抗小鼠CD8抗体 | BioLegend | 100747 | |
| BUV395抗小鼠CD4抗体 | BD Bioscience | 740208 | |
| ELISA | 人GAL ELISA试剂盒 | MyBioSource | MBS2505508 |
| MDSC-T细胞共培养 | Dynabeads小鼠T细胞激活剂CD3/CD28 | Gibco | 11456D |
| 细胞毒性实验 | Cytotox96非放射性细胞毒性检测试剂盒 | Promega | G1780 |
| 免疫共沉淀 | Invitrogen Dynabeads蛋白G免疫沉淀试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 10007D |
| 泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 43124S | |
| IgG同型对照 | Cell Signaling Technology | 2729 | |
| 人MDSC分离 | Lymphoprep密度梯度分离液 | StemCell Technologies | 07801 |
| SepMate管 | StemCell Technologies | 85450 | |
| 人IL-6 | Miltenyi Biotec | 130-093-929 | |
| 人重组GM-CSF | StemCell Technologies | 78140.1 | |
| EasySep人CD33阳性选择试剂盒II | StemCell Technologies | 17876 | |
| EasySep磁极 | StemCell Technologies | 18000 | |
| 小鼠CD8+ T细胞分离 | CD8+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-104-075 |
| EasySep小鼠CD8+选择试剂盒 | StemCell Technologies | 18953 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| MDSC迁移实验 | GAL蛋白浓度、SNAP/M40/M871浓度、迁移时间24 h、Transwell膜孔径5.0 μm、每组独立样本数n=3或n=6 阅读提示:Methods迁移实验小节及图1、图3、图4图注 |
| GBM原位移植与生存分析 | 细胞接种量(CT2A 2×10^4、005 GSC 2×10^5、U87 2×10^4)、小鼠品系与性别、颅内接种方式 阅读提示:Methods小鼠与颅内异种移植肿瘤模型小节及图2、图3图注 |
| SNAP体内给药 | 剂量30 mg/kg、腹腔注射、每日一次、第7天起共10次 阅读提示:图3h,i和图4i,j图注及Methods |
| 铁死亡检测 | RSL3 20 μM处理16 h(活力)或4 h(脂质过氧化/迁移)、FAC 100 μM、C11-BODIPY染色30 min 阅读提示:图5、图6图注及Methods细胞活力与脂质过氧化检测小节 |
| 联合治疗与anti-PD1 | SNAP 30 mg/kg每日一次共10次;RSL3 50 mg/kg隔日一次共5次;IKE 40 mg/kg每日一次共2周;anti-PD1 10 mg/kg第11、14、17天 阅读提示:图7e,f,i图注及Extended Data Fig. 10图注 |