PRMT6在NAFLD/NASH中的表达验证
确认PRMT6在NAFLD和NASH中是否异常表达
检测HFD、db/db、CDAHFD、GAN饮食小鼠肝脏及NAFLD患者肝组织中PRMT6的mRNA、蛋白和IHC表达;用FFA处理原代肝细胞检测PRMT6表达
Therapeutic targeting of the PRMT6/FOXK1 axis restores lipid homeostasis and ameliorates hepatic steatosis and steatohepatitis in mice
含细胞模型、多种饮食诱导小鼠模型、患者肝组织及体内功能与机制验证
C57BL/6J小鼠HFD/CADHFD/GAN饮食模型 Prmt6−/−及肝脏特异性Prmt6敲除小鼠 AML12、HepG2、HEK-293T、Huh7等细胞系 NAFLD患者及健康对照肝组织
EPZ020411腹腔注射20 mg/kg,每周两次,HFD模型10周、CDAHFD模型6周 HFD(D12492)喂养10–15周建立NAFLD模型,CDAHFD(A06071302)喂养8周建立NASH模型 AAV8-sgPrmt6尾静脉注射1×10^9 PFU,分别配合HFD 12周或CDAHFD 8周 FOXK1四个精氨酸位点R161、R191、R259、R486突变为赖氨酸(4RK) GTT禁食16 h后腹腔注射1.0 g/kg葡萄糖;ITT禁食6 h后腹腔注射1.75 U/kg胰岛素
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认PRMT6在NAFLD和NASH中是否异常表达
检测HFD、db/db、CDAHFD、GAN饮食小鼠肝脏及NAFLD患者肝组织中PRMT6的mRNA、蛋白和IHC表达;用FFA处理原代肝细胞检测PRMT6表达
验证PRMT6缺失是否改善肝脏脂肪变性和脂肪性肝炎
利用CRISPR-Cas9构建Prmt6−/−小鼠及AAV8-sgPrmt6肝脏特异性敲除小鼠,给予HFD或CDAHFD,检测体重、肝重比、肝和血浆TG、AST、ALT、GTT、ITT、组织学及脂代谢基因表达
明确PRMT6是否直接结合并甲基化FOXK1
通过Co-IP、LC–MS/MS、GST pulldown、免疫荧光共定位验证相互作用;用体外甲基化实验结合LC–MS/MS鉴定甲基化位点,构建FOXK1-4RK突变体验证aDMA水平
阐明FOXK1甲基化如何影响其亚细胞定位和转录活性
比较FOXK1与FOXK1-4RK的核质分布、磷酸化水平、与GSK3A和14-3-3e的结合;使用EPZ020411、CHIR99021、LY294002、MK2206、雷帕霉素、Selumetinib处理检测通路依赖
验证FOXK1甲基化缺陷是否抵抗饮食诱导的脂肪性肝炎
AAV8介导小鼠肝脏过表达FOXK1或FOXK1-4RK,给予HFD或CDAHFD,检测体重、肝重比、肝和血浆TG、AST、ALT、GTT、ITT、组织学及脂代谢基因表达
确认PRMT6促NAFLD作用是否依赖FOXK1
在AAV8-sgCon或AAV8-sgPrmt6小鼠中联合过表达FOXK1,给予HFD或CDAHFD,检测肝脏脂质、肝功能、糖代谢、组织学及基因表达
评估PRMT6抑制剂EPZ020411对NAFLD和NASH进展的作用
HFD喂养6周或CDAHFD喂养2周的小鼠腹腔注射EPZ020411或溶剂,检测体重、肝重比、肝和血浆TG、胆固醇、AST、ALT、血糖、GTT、ITT及组织学和基因表达
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | Shanghai BasalMedia Technologies | -- |
| RPMI 1640培养基 | Shanghai BasalMedia Technologies | -- | |
| 药物处理 | EPZ020411 | MedChemExpress | HY-12970A |
| 雷帕霉素 | MedChemExpress | HY-10219 | |
| MK2206 | MedChemExpress | HY-108232 | |
| 司美替尼 | MedChemExpress | HY-50706 | |
| LY294002 | MedChemExpress | HY-10108 | |
| 蛋白纯化 | GST琼脂糖树脂 | Yeasen Biotechnology | 20507ES10 |
| 镍-次氮基三乙酸琼脂糖树脂 | Yeasen Biotechnology | 20502ES10 | |
| Western blot | 抗PRMT6抗体 | Proteintech | 15395-1-AP |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 抗MYC标签抗体 | Proteintech | 60003-2-I | |
| 抗V5标签抗体 | Proteintech | 14440-1-AP | |
| 抗ACADM抗体 | ABclonal | A4567 | |
| 抗PPARα抗体 | ABclonal | A24835 | |
| 抗CPT1α抗体 | ABclonal | A5307 | |
| 抗FOXK1抗体 | ABclonal | A15220 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | ABclonal | A6830 | |
| 抗HA标签抗体 | ABclonal | AE008 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | ABclonal | AC026 | |
| 免疫沉淀 | FLAG M2凝胶 | Sigma–Aldrich | A2220 |
| Western blot | 抗GST标签抗体 | Sigma–Aldrich | G7781 |
| 不对称二甲基精氨酸基序抗体 | Cell Signaling Technology | 13522S | |
| 磷酸丝氨酸抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-81514 | |
| 动物实验 | 正常饮食 | Shanghai SLAC Laboratory Animal Company | -- |
| 高脂饮食 | Research Diet | D12492 | |
| 胆碱缺乏、L-氨基酸限定高脂饮食 | Research Diet | A06071302 | |
| Gubra Amylin NASH饮食 | Research Diet | D09100310 | |
| 细胞培养 | 胎牛血清 | ExCellbio | FSD500 |
| 青霉素-链霉素 | ExCellbio | S110JV | |
| 支原体检测 | 支原体检测试剂盒 | YEASEN | 40611ES25 |
| 细胞转染 | 线性聚乙烯亚胺 | Yeasen Biotechnology | 40816ES02 |
| 免疫荧光 | 抗Flag抗体 | Sigma | F3165 |
| 抗HA抗体 | Sigma | H3663 | |
| DAPI | Servicebio | G1407 | |
| 肝组织学 | 油红O | Servicebio | G1015 |
| 天狼星红 | Servicebio | G1078 | |
| 抗F4/80兔多克隆抗体 | Servicebio | GB11027 | |
| TUNEL染色试剂盒 | Servicebio | G1504 | |
| 免疫印迹 | BCA蛋白定量试剂盒 | Vazyme | E112-01 |
| 核质分离 | NE-PER核质提取试剂 | ThermoScientific | 78833 |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Servicebio | G3013 |
| SYBR Green预混液 | Yeasen Biotechnology | 11201ES08 | |
| 双荧光素酶报告基因 | GloMax® 20/20发光检测仪 | Promega | E5311 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | HFD(D12492)喂养10–15周用于NAFLD;CDAHFD(A06071302)喂养8周用于NASH;GAN饮食喂养24周 阅读提示:Methods 2.2 Animal studies及Figure 1图注 |
| Prmt6敲除与肝脏特异性敲除 | Prmt6−/−小鼠为CRISPR-Cas9构建;AAV8-sgPrmt6尾静脉注射1×10^9 PFU;基因组PCR引物序列 阅读提示:Methods 2.2 Animal studies及Figure 2A、Figure 3A图注 |
| FOXK1-4RK突变体构建 | FOXK1四个保守精氨酸位点R161、R191、R259、R486突变为赖氨酸 阅读提示:Results 3.4及Figure 4J、4K图注;摘要 |
| EPZ020411给药方案 | HFD模型20 mg/kg腹腔注射每周两次持续10周;CDAHFD模型20 mg/kg每周两次持续6周;或40 mg/kg处理24 h验证靶点 阅读提示:Methods 2.2 Animal studies、Results 3.8及Figure 8A、8O图注 |
| GTT与ITT条件 | GTT禁食16 h后腹腔注射1.0 g/kg葡萄糖;ITT禁食6 h后腹腔注射1.75 U/kg胰岛素 阅读提示:Methods 2.7 GTT and ITT |
| 体外甲基化实验 | 重组GST-FOXK1 1 μg与FLAG-PRMT6 2 μg,在含0.1 mmol/L腺苷甲硫氨酸的甲基化缓冲液中30 °C孵育30 min 阅读提示:Methods 2.9 In vitro methylation assay |
| 细胞株来源与培养 | HEK293T、HepG2、AML12、Huh7购自ATCC,HCC-LM3购自上海生科院细胞库;DMEM高糖+10% FBS+100 U/mL青霉素-链霉素,37 °C、5% CO2 阅读提示:Methods 2.4 Cell culture and DNA constructs transduction |