急性DSS结肠炎模型建立与益生菌干预
比较三联BLE与四联BLEB的抗结肠炎效果并确定更优配方。
ICR小鼠随机分为Con、DSS、BLE、BLEB-L、BLEB-H五组,DSS组及干预组给予2.5% DSS饮水,同时每日灌胃生理盐水、BLE或BLEB,连续7天。
Supplementation of Bacillus cereus Enhances Anti-Colitis Effects of Triple Probiotics in Mice: Correlative Evidence for a Gut Microbiota-Spermidine-Related Axis in Quadruple-Probiotic Protection
含DSS小鼠模型、Caco-2细胞模型、16S rRNA测序、代谢组学、转录组学及Treg/Th17等功能验证
急性DSS诱导的ICR小鼠结肠炎模型 DSS损伤的Caco-2结肠上皮细胞模型
DSS浓度2.5%(w/v)饮水,建模与灌胃干预同时进行7天 BLE及BLEB-L灌胃剂量0.92 g/kg/天,BLEB-H为2.77 g/kg/天,灌胃体积0.25 mL,每日一次 粪便样本于干预第4天和第8天收集用于16S rRNA测序 Caco-2细胞以3% DSS处理24 h,亚精胺组为200 μM亚精胺与3% DSS共处理 表型检测每组n=7(结肠长度、16S),部分指标n=6或n=3,详见各图注
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较三联BLE与四联BLEB的抗结肠炎效果并确定更优配方。
ICR小鼠随机分为Con、DSS、BLE、BLEB-L、BLEB-H五组,DSS组及干预组给予2.5% DSS饮水,同时每日灌胃生理盐水、BLE或BLEB,连续7天。
评估益生菌对结肠炎宏观和微观病理的改善作用。
每日记录体重和DAI,第8天处死测量结肠长度,H&E染色观察黏膜结构并进行盲法病理评分,ELISA检测血清IL-1β、IL-6、TNF-α和LPS。
评估BLEB对全身免疫失衡的调节作用。
制备脾脏单细胞悬液,PMA/离子霉素/布雷菲德菌素A刺激后,表面染CD4,胞内染IL-17A,核内染Foxp3,流式检测CD4+Foxp3+ Treg和CD4+IL-17A+ Th17比例并计算比值。
验证BLEB对紧密连接和黏蛋白表达的修复作用。
qRT-PCR检测结肠组织E-cadherin、Occludin、MUC-2、Claudin-1 mRNA表达,Western blot检测对应蛋白表达。
表征BLEB对肠道菌群组成和多样性的动态重塑。
于干预第4天和第8天收集新鲜粪便,提取DNA,扩增16S rRNA V3-V4区,Illumina NovaSeq 6000测序,分析α多样性、PCA β多样性和属/种水平差异丰度。
筛选BLEB调控的核心保护性代谢物并分析其与菌群的相关性。
对结肠内容物进行非靶向LC-MS代谢组学检测,鉴定差异代谢物,KEGG通路富集,并用Spearman相关分析差异菌群与亚精胺等多胺的关联。
探索亚精胺对肠上皮细胞损伤的分子转录反应。
Caco-2细胞设Con、DSS损伤(3% DSS 24 h)、亚精胺干预(200 μM亚精胺+3% DSS)三组,提取RNA构建链特异性文库,Illumina NovaSeq测序,DESeq2筛选DEGs并进行KEGG富集。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 益生菌制剂 | 三联益生菌混合物 | Hangzhou Yuanda Biopharmaceutical Co., Ltd. | -- |
| 四联益生菌混合物 | Hangzhou Yuanda Biopharmaceutical Co., Ltd. | -- | |
| 结肠炎建模 | 葡聚糖硫酸钠 | MP Biomedicals | -- |
| Western blot | 抗Occludin抗体 | Proteintech | 27260-1-AP |
| 抗Claudin-1抗体 | Proteintech | 13050-1 | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| 抗MUC-2抗体 | Yamei Biopharmaceutical Technology Co., Ltd. | R014045 | |
| 抗E-cadherin抗体 | HUABIO | EM0502 | |
| HRP标记二抗 | ABclonal | AS014 | |
| HRP标记二抗 | ABclonal | AS003 | |
| 流式分析 | FITC标记抗CD4抗体 | BioLegend | -- |
| APC标记抗IL-17A抗体 | BioLegend | -- | |
| PE标记抗CD3抗体 | BioLegend | -- | |
| APC标记抗Foxp3抗体 | BioLegend | -- | |
| 细胞处理 | 亚精胺标准品 | Sigma-Aldrich | -- |
| 粪便DNA提取 | 粪便DNA提取试剂盒 | Omega Bio-tek, Inc. | -- |
| 16S rRNA测序 | Illumina NovaSeq 6000测序平台 | Illumina, Inc. | -- |
| LC-MS代谢组学 | Vanquish Flex超高效液相色谱仪 | -- | -- |
| Q Exactive HF-X质谱仪 | -- | -- | |
| Acquity UPLC HSS T3色谱柱 | Waters Corporation | -- | |
| RNA-seq | Illumina NovaSeq测序平台 | Illumina | -- |
| 血清检测 | 酶联免疫吸附测定试剂盒 | Elabscience Biotechnology Co., Ltd. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与分组 | 小鼠品系、周龄、体重、来源、饲养条件、随机分组及每组样本量;DSS浓度2.5%、给药途径与持续时间;益生菌剂量0.92 g/kg和2.77 g/kg、灌胃体积0.25 mL、每日一次连续7天。 阅读提示:Materials and Methods 2.2 Animals and Ethical Approval、2.3 Model Establishment and Drug Intervention;Figure 1 legend |
| 表型与组织病理评估 | 体重记录频率、DAI评分标准、处死时间点、结肠长度测量方法、H&E染色步骤和盲法病理评分;各指标样本量(结肠长度n=7、ELISA n=6、病理n=3)。 阅读提示:Materials and Methods 2.4、2.5、2.6;Figure 1 legend |
| 免疫细胞流式分析 | 脾脏单细胞悬液制备、刺激剂PMA/离子霉素/布雷菲德菌素A、表面和胞内/核内染色抗体克隆号(文中未明确说明)、每组n=3。 阅读提示:Materials and Methods 2.9;Figure 1H legend |
| 肠道菌群16S rRNA测序 | 粪便收集时间点(第4天和第8天)、DNA提取试剂盒、16S V3-V4引物341F/806R、测序平台Illumina NovaSeq 6000、每组n=7、生物信息分析流程。 阅读提示:Materials and Methods 2.10;Figure 3 legend |
| 非靶向代谢组学 | 结肠内容物取样量50 mg、53%甲醇提取、色谱柱和流动相条件、质谱扫描范围m/z 50–1200、正负ESI模式、QC样本和空白设置、每组n=6、仅分析Con/DSS/BLEB-L/BLEB-H组。 阅读提示:Materials and Methods 2.11;Figure 4 legend |
| Caco-2转录组实验 | Caco-2细胞培养条件(DMEM+20% FBS,37 °C、5% CO2)、3% DSS处理24 h、200 μM亚精胺共处理、每组n=3、RNA-seq平台和DESeq2分析参数(|log2FC| ≥ 1,校正p < 0.01)。 阅读提示:Materials and Methods 2.12;Figure 5 legend |
| 统计分析 | 数据以mean ± SEM表示;纵向数据用双因素重复测量ANOVA加Tukey事后检验;终点指标用单因素ANOVA加Tukey多重比较;Spearman相关分析;显著性阈值p < 0.05。 阅读提示:Materials and Methods 2.13 |