成年骨髓中一种CD4谱系红系-髓系祖细胞定义了巨噬细胞生成的替代途径

A CD4-lineage erythro-myeloid progenitor within the adult bone marrow defines an alternative pathway for macrophage generation

作者信息Shweta Tikoo, Rohit Jain, Brendon Martinez, Renhua Song, Matthias Wielscher, Carlos Márquez-Burgoa, Anastasiya Hladik, Simone Rizzetto, Lisa E Shaw, Minoo Ghannadan, Stephanie A Gerhofer, Andrew J Mitchell, Maria Elizabeth Torres-Pacheco, Fabio Luciani, Matthias Farlik, Justin J L Wong, Sylvia Knapp, Philipp Starkl, Stuart T Fraser, Steffen Jung, Wolfgang Weninger
PMID42934292
发布时间2026-11
DOI10.1038/s41590-026-02686-1

实验完整度

高

含流式表型、scRNA-seq、体外克隆形成、BM嵌合与肿瘤模型体内谱系示踪、Ccr2敲除验证等多层证据

主要模型

DPE-GFP及DPE-GFP:mT/mG转基因小鼠骨髓祖细胞 Ptprca受体小鼠骨髓嵌合体 E0771乳腺癌原位移植瘤模型 Ccr2敲除肿瘤模型

重点核对

EMPROR细胞门控:Lin−(CD3e/Ly6G/NK1.1/CD19/Siglec-H)GFP+CD115−CD117+CD135−,分选纯度>95% 体外巨噬细胞分化使用含50 ng/ml M-CSF的完全RPMI或DMEM培养 红系-髓系克隆形成使用MethoCult GF M3434并补充5 ng/ml TPO、3 ng/ml GM-CSF、5 ng/ml M-CSF BM嵌合体经约9 Gy照射后回输10×10^6骨髓细胞,并共注射1%野生型骨髓 E0771细胞0.25–0.5×10^6接种于腹股沟乳腺脂肪垫,肿瘤达0.8–0.9 cm3取材

摘要

组织驻留巨噬细胞来源于不同的发育来源,但人们认为其成年期的补充完全依赖循环单核细胞。在此,我们鉴定出成年骨髓中一种此前未被认识的CD4谱系红系-髓系祖细胞(EMPROR),它提供了巨噬细胞生成的替代途径。EMPROR细胞在表型和转录上均不同于造血干细胞、共同髓系祖细胞和单核细胞前体,其不表达Csf1r和Ccr2,而表达Cd4和Kit。单细胞RNA测序、RNA速度分析和谱系实验揭示了其巨噬细胞、中性粒细胞、巨核细胞和红系潜能。EMPROR细胞不依赖CCR2介导的单核细胞募集即可生成血管周围巨噬细胞和肿瘤相关巨噬细胞,并在炎症和肿瘤条件下参与红系和粒细胞谱系。转录组比较显示EMPROR细胞最接近胚胎红系-髓系祖细胞,提示成年骨髓中持续存在一种胚胎样程序。这些发现揭示了成年髓系生成的替代途径,在经典单核细胞谱系之外维持了巨噬细胞的多样性。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
成年期是否存在不依赖循环单核细胞的骨髓来源祖细胞,能够补充组织巨噬细胞并生成特定巨噬细胞亚群。
核心机制
成年骨髓中存在表型和转录上类似胚胎红系-髓系祖细胞的EMPROR细胞,其不表达Csf1r和Ccr2,可经不依赖CCR2介导单核细胞募集的途径生成血管周围和肿瘤相关巨噬细胞,并具有红系、中性粒、巨核和巨噬谱系潜能。
主要证据
流式表型与scRNA-seq/RNA速度分析显示EMPROR为独立细胞群并具多谱系轨迹;体外MethoCult克隆形成和巨噬分化实验、脑膜巨噬细胞清除后i.t.转移实验,以及E0771肿瘤模型中EMPROR细胞生成TAM、中性粒细胞、巨噬细胞和红细胞;Ccr2敲除小鼠中GFP+血管周围巨噬细胞仍可形成。
研究意义
揭示成年髓系生成除经典单核细胞谱系外存在替代途径,提示胚胎样红系-髓系程序持续至成年,并为研究巨噬细胞个体发生、组织特化和异质性提供新框架。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

识别血管周围巨噬细胞的骨髓来源

确定炎症和肿瘤条件下PVM是否可由成年骨髓前体补充。

利用DPE-GFP:Rag1−/−→Ptprca骨髓嵌合体,在稳态及E0771肿瘤植入后追踪供体来源GFP+巨噬细胞;并用甘露糖化氯膦酸盐脂质体i.t.清除脑膜巨噬细胞后观察骨髓前体补充。

2

鉴定并表型定义成年骨髓EMPROR细胞

在骨髓中寻找区别于经典单核细胞前体的GFP+祖细胞群。

流式分析Lin−GFP+细胞,排除cMoPs、单核细胞、CD135+淋巴祖细胞和CMP,定义Lin−GFP+CD115−CD117+CD135−的EMPROR细胞,并检测CD4、CD11b、Ly6C、CCR2、CX3CR1、CD34、Sca-1、CD150及成熟巨噬细胞标志。

3

转录组刻画EMPROR细胞

确定EMPROR细胞的转录特征、与已知造血前体的关系及预测分化轨迹。

对分选EMPROR、GFP+和CD45+骨髓细胞进行scRNA-seq,结合RNA速度分析;对分选EMPROR、cMoPs、单核细胞和pDC进行bulk RNA-seq及RT–qPCR验证。

4

体外验证EMPROR谱系潜能

检验EMPROR细胞是否具有巨噬细胞、红系-髓系及DC谱系潜能,并比较其与cMoPs和单核细胞。

分选细胞在含M-CSF的液体培养中诱导巨噬细胞;在MethoCult GF M3434中检测克隆形成并用流式及Giemsa染色判定谱系;在GM-CSF条件下检测DC分化;在OP9/OP9-DL1及B细胞MethoCult中检测淋巴潜能。

5

体内验证EMPROR多谱系潜能

在肿瘤 bearing 宿主中追踪EMPROR来源细胞的组织分布和谱系命运。

将DPE-GFP:mT/mG来源的单核细胞、cMoPs或EMPROR细胞与Ptprca骨髓细胞共同回输至照射受体,24 h后植入E0771肿瘤,3周后检测肿瘤、肝、肺、脑、胸腺、骨髓和血液中的供体来源细胞。

6

验证不依赖CCR2的巨噬细胞生成

检验CD4谱系GFP+PVM能否在缺乏CCR2的情况下于肿瘤中形成。

将DPE-GFP小鼠与Ccr2敲除小鼠杂交,在DPE-GFP×Ccr2−/−及DPE-GFP×Ccr2wt/wt同窝小鼠中植入E0771肿瘤,3周后免疫染色检测F4/80+GFP+巨噬细胞。

7

比较成年与胚胎EMPROR及经典EMP转录程序

判断成年EMPROR是否与胚胎EMPROR及经典EMP共享转录程序。

分选E14.5胎肝eEMPROR与cMoPs,以及成年骨髓单核细胞、cMoPs和EMPROR进行bulk RNA-seq,并与公开HSC/祖细胞数据集及EMP、pMac和胚胎/成年巨噬细胞数据集整合比较。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
磺胺甲噁唑/甲氧苄啶----
四甲基罗丹明异硫氰酸酯-葡聚糖----
BD FACSAria II流式细胞分选仪BD--
BD FACSAria Fusion流式细胞分选仪BD--
Qiagen RNeasy Plus Micro RNA提取试剂盒Qiagen--
SensiFAST Probe Lo-ROX试剂盒Bioline--
Stratagene Mx3005P实时定量PCR仪Stratagene--
MethoCult GF M3434甲基纤维素培养基STEMCELL Technologies--
MethoCult M3630甲基纤维素培养基STEMCELL Technologies--
血小板生成素PROSPEC Biotech--
粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子PROSPEC Biotech--
巨噬细胞集落刺激因子PeproTech--
粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子ProSpec--
FMS样酪氨酸激酶3配体R&D--
白细胞介素-7PeproTech--
Giemsa染液Sigma-Aldrich--
Cytospin 3细胞离心涂片机Shandon--
Leica TCS SP5共聚焦显微镜Leica--
Olympus FV3000共聚焦显微镜Olympus--
LaVision BioTec TriMScope多光子显微镜LaVision BioTec--
10x Genomics Chromium平台10x Genomics--
Illumina NovaSeq 6000测序仪Illumina--
Illumina HiSeq 2500测序仪Illumina--
Illumina NextSeq 500测序仪Illumina--
Qubit荧光定量仪InvitrogenQ33231
TapeStation高灵敏度D5000试剂Agilent5067-5592
TapeStation高灵敏度D1000试剂Agilent5067-5582
IV型胶原酶----
Percoll密度梯度分离液GE Healthcare--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
骨髓嵌合体与PVM来源追踪
受体品系、照射剂量、回输骨髓细胞数、是否共注射1%野生型骨髓、观察时间(7–8个月、15个月、肿瘤植入后10周)
阅读提示:Methods 'BM chimera generation';Fig. 1g–i及Extended Data Fig. 1d图注
EMPROR细胞流式门控与分选
谱系标志组合(含/不含CD64的差异)、CD115/CD117/CD135通道、分选纯度>95%、FMO与同型对照
阅读提示:Methods 'Flow cytometric analysis and phenotyping of BM precursors'与'Sorting of BM precursor populations';Extended Data Fig. 3a
脑膜巨噬细胞清除与i.t.前体转移
脂质体剂量10 μl、两次给药间隔24 h、清除后3–4天转移、恢复4–6周后成像
阅读提示:Methods 'Meningeal macrophage depletion and adoptive transfer of sorted precursors';Fig. 3c图注
体外巨噬细胞与红系-髓系克隆形成
M-CSF浓度50 ng/ml、MethoCult GF M3434添加的TPO 5 ng/ml、GM-CSF 3 ng/ml、M-CSF 5 ng/ml、培养约2周
阅读提示:Methods 'Lineage potential assays';Fig. 3d,e,h图注
肿瘤模型体内谱系示踪
各前体回输数量(单核细胞5×10^5,cMoPs/EMPROR 0.5×10^5–2.5×10^5)、共回输Ptprca骨髓细胞数、E0771接种量与取材肿瘤体积0.8 cm3
阅读提示:Methods 'Assessment of in vivo lineage potential';Fig. 4a图注
Ccr2敲除验证
DPE-GFP×Ccr2−/−与同窝野生型对照、E0771移植后3周取材、抗F4/80免疫染色
阅读提示:Fig. 5a,b图注及对应Results段落
单细胞与bulk转录组比较
各样本分选细胞数、测序平台与读长、批次校正方法及公共数据集来源(GSE76140、GSE107495、GSE81686)
阅读提示:Methods 'Single-cell sample preparation and sequencing'、'Bulk RNA-seq of adult BM precursors'、'Integration with publicly available datasets';Extended Data Fig. 10