识别血管周围巨噬细胞的骨髓来源
确定炎症和肿瘤条件下PVM是否可由成年骨髓前体补充。
利用DPE-GFP:Rag1−/−→Ptprca骨髓嵌合体,在稳态及E0771肿瘤植入后追踪供体来源GFP+巨噬细胞;并用甘露糖化氯膦酸盐脂质体i.t.清除脑膜巨噬细胞后观察骨髓前体补充。
A CD4-lineage erythro-myeloid progenitor within the adult bone marrow defines an alternative pathway for macrophage generation
含流式表型、scRNA-seq、体外克隆形成、BM嵌合与肿瘤模型体内谱系示踪、Ccr2敲除验证等多层证据
DPE-GFP及DPE-GFP:mT/mG转基因小鼠骨髓祖细胞 Ptprca受体小鼠骨髓嵌合体 E0771乳腺癌原位移植瘤模型 Ccr2敲除肿瘤模型
EMPROR细胞门控:Lin−(CD3e/Ly6G/NK1.1/CD19/Siglec-H)GFP+CD115−CD117+CD135−,分选纯度>95% 体外巨噬细胞分化使用含50 ng/ml M-CSF的完全RPMI或DMEM培养 红系-髓系克隆形成使用MethoCult GF M3434并补充5 ng/ml TPO、3 ng/ml GM-CSF、5 ng/ml M-CSF BM嵌合体经约9 Gy照射后回输10×10^6骨髓细胞,并共注射1%野生型骨髓 E0771细胞0.25–0.5×10^6接种于腹股沟乳腺脂肪垫,肿瘤达0.8–0.9 cm3取材
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定炎症和肿瘤条件下PVM是否可由成年骨髓前体补充。
利用DPE-GFP:Rag1−/−→Ptprca骨髓嵌合体,在稳态及E0771肿瘤植入后追踪供体来源GFP+巨噬细胞;并用甘露糖化氯膦酸盐脂质体i.t.清除脑膜巨噬细胞后观察骨髓前体补充。
在骨髓中寻找区别于经典单核细胞前体的GFP+祖细胞群。
流式分析Lin−GFP+细胞,排除cMoPs、单核细胞、CD135+淋巴祖细胞和CMP,定义Lin−GFP+CD115−CD117+CD135−的EMPROR细胞,并检测CD4、CD11b、Ly6C、CCR2、CX3CR1、CD34、Sca-1、CD150及成熟巨噬细胞标志。
确定EMPROR细胞的转录特征、与已知造血前体的关系及预测分化轨迹。
对分选EMPROR、GFP+和CD45+骨髓细胞进行scRNA-seq,结合RNA速度分析;对分选EMPROR、cMoPs、单核细胞和pDC进行bulk RNA-seq及RT–qPCR验证。
检验EMPROR细胞是否具有巨噬细胞、红系-髓系及DC谱系潜能,并比较其与cMoPs和单核细胞。
分选细胞在含M-CSF的液体培养中诱导巨噬细胞;在MethoCult GF M3434中检测克隆形成并用流式及Giemsa染色判定谱系;在GM-CSF条件下检测DC分化;在OP9/OP9-DL1及B细胞MethoCult中检测淋巴潜能。
在肿瘤 bearing 宿主中追踪EMPROR来源细胞的组织分布和谱系命运。
将DPE-GFP:mT/mG来源的单核细胞、cMoPs或EMPROR细胞与Ptprca骨髓细胞共同回输至照射受体,24 h后植入E0771肿瘤,3周后检测肿瘤、肝、肺、脑、胸腺、骨髓和血液中的供体来源细胞。
检验CD4谱系GFP+PVM能否在缺乏CCR2的情况下于肿瘤中形成。
将DPE-GFP小鼠与Ccr2敲除小鼠杂交,在DPE-GFP×Ccr2−/−及DPE-GFP×Ccr2wt/wt同窝小鼠中植入E0771肿瘤,3周后免疫染色检测F4/80+GFP+巨噬细胞。
判断成年EMPROR是否与胚胎EMPROR及经典EMP共享转录程序。
分选E14.5胎肝eEMPROR与cMoPs,以及成年骨髓单核细胞、cMoPs和EMPROR进行bulk RNA-seq,并与公开HSC/祖细胞数据集及EMP、pMac和胚胎/成年巨噬细胞数据集整合比较。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 骨髓嵌合体与PVM来源追踪 | 受体品系、照射剂量、回输骨髓细胞数、是否共注射1%野生型骨髓、观察时间(7–8个月、15个月、肿瘤植入后10周) 阅读提示:Methods 'BM chimera generation';Fig. 1g–i及Extended Data Fig. 1d图注 |
| EMPROR细胞流式门控与分选 | 谱系标志组合(含/不含CD64的差异)、CD115/CD117/CD135通道、分选纯度>95%、FMO与同型对照 阅读提示:Methods 'Flow cytometric analysis and phenotyping of BM precursors'与'Sorting of BM precursor populations';Extended Data Fig. 3a |
| 脑膜巨噬细胞清除与i.t.前体转移 | 脂质体剂量10 μl、两次给药间隔24 h、清除后3–4天转移、恢复4–6周后成像 阅读提示:Methods 'Meningeal macrophage depletion and adoptive transfer of sorted precursors';Fig. 3c图注 |
| 体外巨噬细胞与红系-髓系克隆形成 | M-CSF浓度50 ng/ml、MethoCult GF M3434添加的TPO 5 ng/ml、GM-CSF 3 ng/ml、M-CSF 5 ng/ml、培养约2周 阅读提示:Methods 'Lineage potential assays';Fig. 3d,e,h图注 |
| 肿瘤模型体内谱系示踪 | 各前体回输数量(单核细胞5×10^5,cMoPs/EMPROR 0.5×10^5–2.5×10^5)、共回输Ptprca骨髓细胞数、E0771接种量与取材肿瘤体积0.8 cm3 阅读提示:Methods 'Assessment of in vivo lineage potential';Fig. 4a图注 |
| Ccr2敲除验证 | DPE-GFP×Ccr2−/−与同窝野生型对照、E0771移植后3周取材、抗F4/80免疫染色 阅读提示:Fig. 5a,b图注及对应Results段落 |
| 单细胞与bulk转录组比较 | 各样本分选细胞数、测序平台与读长、批次校正方法及公共数据集来源(GSE76140、GSE107495、GSE81686) 阅读提示:Methods 'Single-cell sample preparation and sequencing'、'Bulk RNA-seq of adult BM precursors'、'Integration with publicly available datasets';Extended Data Fig. 10 |