基因工程小鼠肿瘤模型建立与表型分析
验证Bcl-xL缺失对Apc缺陷诱导的胃肿瘤发生和增殖的影响。
构建Mist1-CreERT; bcl-xlflox/flox、Mist1-CreERT; Apcflox/flox、Mist1-CreERT; Apcflox/flox; bcl-xlflox/flox及WT对照小鼠,TAM诱导后比较肿瘤大小、组织病理和Ki67增殖。
Bcl-xL Promotes Gastric Tumorigenesis via Apoptosis-Independent Wnt/β-Catenin Activation and PPARγ Suppression
含基因工程小鼠、类器官、异种移植及人组织/数据库验证,具功能与机制验证
Mist1-CreERT; Apcflox/flox; bcl-xlflox/flox小鼠胃肿瘤模型 Apc缺陷胃类器官及KPA/KPAB类器官 KPA/KPAB类器官裸鼠皮下异种移植瘤
TAM 6 mg/20 g体重,6周龄,间隔1天注射2次,2个月后分析 M-A与M-AB小鼠肿瘤大小比较,每组n=6 A-1155463处理类器官,浓度100 nM和1000 nM KPAB vs KPA类器官在缺乏Wnt3a、R-spondin 3和生长因子培养基中的生长差异 异种移植每只注射1×10^6细胞,第14天和第21天肿瘤大小,每组n=5
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Bcl-xL缺失对Apc缺陷诱导的胃肿瘤发生和增殖的影响。
构建Mist1-CreERT; bcl-xlflox/flox、Mist1-CreERT; Apcflox/flox、Mist1-CreERT; Apcflox/flox; bcl-xlflox/flox及WT对照小鼠,TAM诱导后比较肿瘤大小、组织病理和Ki67增殖。
明确Bcl-xL缺失是否影响Wnt通路激活、干细胞标志和凋亡。
免疫染色检测β-catenin核转位、SOX9、LGR5、AQP5、TROP2、cleaved caspase-3和YAP;RT-PCR检测Wnt靶基因。
在体外验证Bcl-xL对Apc缺陷类器官增殖和Wnt信号的作用。
用Cre慢病毒感染Apcflox/flox类器官生成Apc缺陷类器官,使用Bcl-xL抑制剂A-1155463处理;构建KPA和KPAB类器官,比较标准培养基和缺乏Wnt3a/R-spondin 3/生长因子培养基中的生长。
验证HNF4A和PPARγ是否介导Bcl-xL对Wnt通路和代谢程序的调控。
在KPA类器官中用腺病毒过表达Hnf4a或Pparg,进行RNA测序、GSEA和RT-PCR分析Wnt靶基因及代谢通路。
验证Bcl-xL缺失对体内肿瘤生长和Wnt信号的影响。
将KPA和KPAB类器官皮下注射入裸鼠,监测肿瘤大小,1个月后取材进行免疫染色。
验证Bcl-xL/BCL2L1与Wnt靶基因、PPARG及预后的关系。
人胃癌组织芯片免疫荧光评分;TCGA等数据库分析BCL2L1表达、Wnt靶基因、代谢通路和生存;单细胞RNA测序分析;DPC数据库分析吡格列酮与胃癌发生关联。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | A-1155463 | Selleck | S7800 |
| 类器官培养 | 基质胶 | Corning | -- |
| Advanced DMEM/F12培养基 | Invitrogen | -- | |
| B27添加剂 | Invitrogen | -- | |
| N2添加剂 | Invitrogen | -- | |
| N-乙酰半胱氨酸 | Wako | -- | |
| 烟酰胺 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 表皮生长因子 | Wako | -- | |
| 成纤维细胞生长因子10 | Peprotech | -- | |
| Y-27632 | Wako | -- | |
| 胃泌素 | Tocris | -- | |
| Primocin | Invitrogen | -- | |
| 免疫组织化学 | Bcl-xL抗体 | Cell Signaling Technology | 2764S |
| cyclinD1抗体 | Thermo Fisher Scientific | RM-91004-SO | |
| CD44v抗体 | BIO RAD | MCA1967 | |
| cleaved caspase 3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661S | |
| 免疫荧光 | β-catenin抗体 | BD Biosciences | BD61053 |
| Ki67抗体 | Cell Signaling Technology | 12202S | |
| Sox9抗体 | Merck | AB5535 | |
| YAP抗体 | Cell Signaling Technology | 14074 | |
| 红色荧光蛋白抗体 | ROCKLAND | 600401379 | |
| GFP抗体 | Abcam | ab13970 | |
| E-cadherin抗体 | BD biosciences | 610181 | |
| AQP5抗体 | ATLAS ANTIBODY | HPA065005 | |
| TROP2抗体 | R and D | AF650 | |
| PPARγ抗体 | Cell Signaling Technology | 2435 | |
| RNA原位杂交 | RNAscope 2.5 HD检测试剂盒(棕色) | ACD | -- |
| Lgr5探针 | ACD | 312171 | |
| Western blot | 总caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9662 |
| cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| β-actin抗体 | cell signaling technology | 5125S | |
| ImmunoStar LD化学发光试剂 | Fujifilm Wako Pure Chemicals | -- | |
| RNA提取 | NucleoSpin RNA提取试剂盒 | Macherey-Nagel | -- |
| RNeasy Micro试剂盒 | Qiagen | -- | |
| cDNA合成 | ImProm-ll逆转录系统 | Promega | -- |
| 实时定量PCR | FastStart Universal SYBR Green预混液(Rox) | Roche | -- |
| 慢病毒转导 | pLV-EF1-Cre-2a-vsfGFP-2a-puro慢病毒 | -- | -- |
| Trans Dux MAX转染试剂 | System Biosciences | -- | |
| 腺病毒感染 | Pparg过表达腺病毒 | vectorbuilder | VB210912-1088ebt |
| Hnf4a过表达腺病毒 | vectorbuilder | VB220822-1173ydv |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠肿瘤模型 | TAM剂量6 mg/20 g体重、6周龄、间隔1天注射2次、TAM后2个月分析;肿瘤直径每组n=6 阅读提示:Methods中Mice小节及Figure 1 legend |
| 类器官Bcl-xL抑制 | A-1155463浓度100 nM和1000 nM;处理72小时后传代,传代次日开始测量直径;每组n=10类器官 阅读提示:Methods中Treatment In Vitro小节及Figure 6I legend |
| 类器官Wnt缺陷培养 | 培养基仅含DMEM/F12、B27和N2,缺乏Wnt3a、R-spondin 3和生长因子;培养至第5天 阅读提示:Results中类器官部分及Figure 6H legend |
| 异种移植 | 每只注射1×10^6细胞,Matrigel和DMEM/F12各100 μL,6周龄裸鼠,26 G针;第14天和第21天测量,每组n=5 阅读提示:Methods中Xenograft小节及Figure 7A legend |
| 腺病毒过表达 | 感染复数100;过表达48小时后换无生长因子培养基;RNA测序每组n=3 阅读提示:Methods中Adenovirus Infection小节及Figure 9、Figure 11 legends |