慢性高脂饮食喂养小鼠模型建立与代谢表型验证
验证慢性HFD对小鼠体重、脂肪量和血脂的影响,并确定后续分析性别。
雄性Lgr5-GFP或C57BL6 WT小鼠喂食12周HFD(60% kcal脂肪)或LFD(10% kcal脂肪),测量体重、体成分和血清脂质。
High-fat diet remodels plasma membrane rigidity to potentiate colonocyte stemness in mice
包含体内慢性/急性HFD和db/db小鼠模型、离体类器官、体外细胞实验及单细胞/批量转录组和脂质组分析,并有功能与机制验证。
Lgr5-EGFP-IRES-CreERT2敲入报告小鼠(慢性12周HFD或LFD喂养) Leprdb(db/db)肥胖小鼠与db/+对照小鼠 YAMC永生化小鼠结肠上皮细胞系 人结肠类器官
HFD为60% kcal来自脂肪(Research Diets D12492),LFD为10% kcal来自脂肪(Research Diets D12450B),喂养12周 急性HFD实验喂养1周 db/db与db/+小鼠在11周龄时比较,到达后 acclimated 1周于LFD 体外LDL胆固醇处理YAMC细胞24小时,浓度5、10、20或50 μM PA或POA处理YAMC细胞72小时,浓度50或250 μM;人结肠类器官用30 μM PA处理最长29天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证慢性HFD对小鼠体重、脂肪量和血脂的影响,并确定后续分析性别。
雄性Lgr5-GFP或C57BL6 WT小鼠喂食12周HFD(60% kcal脂肪)或LFD(10% kcal脂肪),测量体重、体成分和血清脂质。
确定慢性HFD是否扩大Lgr5+结肠干细胞库并增强其增殖和再生能力。
对HFD和LFD小鼠结肠组织进行H&E染色评估隐窝长度,免疫荧光和流式细胞术定量Lgr5-GFP+细胞,EdU标记评估增殖,分选Lgr5-GFPhi和Lgr5-GFPlow细胞进行类器官培养。
检测慢性HFD是否改变结肠隐窝和Lgr5+细胞的质膜游离胆固醇和刚性。
用Di-4-ANEPPDHQ(Di4)评估膜刚性,Filipin III评估游离胆固醇,在结肠隐窝和分选Lgr5-GFP+细胞上进行共聚焦或成像流式细胞术分析;用Amplex Red Cholesterol Assay定量脂质提取物中游离、总胆固醇和胆固醇酯。
确定HFD是否广泛改变结肠隐窝膜脂质组成和饱和度。
对分离的结肠隐窝进行HPLC-MS/MS shotgun脂质组学,分析PC、SM、LPC、Cer等脂质种类和磷脂不饱和度指数。
验证HFD是否改变EGFR和LRP6纳米簇集并激活下游β-catenin。
用STORM超分辨率显微镜分析Lgr5-GFP+结肠细胞中LRP6和EGFR纳米簇直径和频率;免疫组化检测核β-catenin积累。
区分饮食与肥胖对膜重塑和受体簇集的影响。
比较雄性db/db和db/+小鼠的体重、体成分、血清脂质、结肠隐窝和单细胞膜刚性、游离胆固醇、LRP6/EGFR纳米簇和核β-catenin。
确定短期HFD是否足以重塑结肠细胞质膜。
小鼠喂食HFD或LFD 1周,检测结肠隐窝和单细胞膜刚性、游离胆固醇,以及脾CD4+和CD8+ T细胞膜性质,并测量体重、体成分和血清脂质。
测试外源性胆固醇或脂肪酸是否足以诱导体外膜刚性和胆固醇变化。
YAMC细胞在脂蛋白 depleted FBS中血清饥饿24小时,然后用LDL胆固醇处理24小时,或用PA/POA处理72小时,用MβCD作为胆固醇去除对照;人结肠类器官用PA处理最长29天。
解析HFD对结肠上皮和ISCs转录程序的影响。
对12周HFD或LFD小鼠结肠隐窝细胞进行scRNA-seq(3只小鼠/条件混合),对结肠上皮细胞进行bulk RNA-seq,并进行IPA、Enrichr和UCell分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | EchoMRI-100H体成分分析仪 | -- | -- |
| 血清分析 | Beckman-Coulter DxC 700 AU化学分析仪 | Beckman Coulter | -- |
| 结肠隐窝分离 | 杜尔贝科磷酸盐缓冲盐水 | Gibco | 14190144 |
| 单细胞分离 | 胰蛋白酶-EDTA | Gibco | 25200056 |
| TrypLE Select酶 | Gibco | A1217701 | |
| 细胞分选 | MoFlo Astrios细胞分选仪 | Beckman Coulter | -- |
| S3e细胞分选仪 | Bio-Rad | -- | |
| 活细胞成像溶液 | Invitrogen | A14291DJ | |
| 免疫组化 | 山羊多克隆抗GFP抗体 | Abcam | ab6673 |
| Alexa Flour Plus 488驴抗山羊二抗 | Invitrogen | A32814 | |
| 小鼠单克隆抗β-catenin抗体 | BD Biosciences | 610154 | |
| CF640R标记的抗小鼠二抗 | Biotium | 20178 | |
| 含DAPI的ProLong Gold抗淬灭封片剂 | Invitrogen | P36931 | |
| 脾T细胞分离 | 磁珠CD4(L3T4)微珠 | Miltenyi Biotec | 130-049-201 |
| CD8(TIL)微珠 | Miltenyi Biotec | 130-116-478 | |
| 细胞培养 | 无谷氨酰胺RPMI 1640培养基 | Gibco | 21870076 |
| 胎牛血清 | Hyclone | SH300084.03 | |
| GlutaMAX | Gibco | 35050061 | |
| 鼠干扰素-γ | Roche | 11276905001 | |
| 细胞处理 | 人LDL胆固醇 | Kalen Biomedical | 770200-1 |
| 甲基-β-环糊精 | Sigma | C4555 | |
| 类器官培养 | Matrigel基质胶 | -- | -- |
| Advanced DMEM/F12培养基 | Gibco | 12634010 | |
| HEPES | Sigma | H0887 | |
| LDN-193189 | Stemgent | 04-0074 | |
| N-乙酰-L-半胱氨酸 | Sigma | A9165 | |
| N2添加剂 | Life Technologies | 17502048 | |
| B27添加剂 | Life Technologies | 17504044 | |
| Y-27632 | Sigma | Y0503 | |
| Jagged-1 | AnaSpec | AS-61298 | |
| 人结肠类器官培养 | 表皮生长因子 | Life Technologies | PMG8041 |
| SB202190 | Sigma | S7067 | |
| A83-01 | Tocris | 2939 | |
| 烟酰胺 | Sigma | N3376 | |
| 胃泌素I | Sigma | G9020 | |
| Primocin | Invitrogen | ant-pm | |
| 膜刚性测量 | Di-4-ANEPPDHQ | Invitrogen | D36802 |
| 8室细胞成像盖玻片 | Eppendorf | 0030742036 | |
| 8孔盖玻片 | Cellvis | C8-1.5H-N | |
| Leica DMi8共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| Amnis FlowSight成像流式细胞仪 | Cytek Biosciences | -- | |
| 游离胆固醇染色 | Filipin III | Sigma | SAE0087 |
| 胆固醇定量 | Amplex Red胆固醇测定试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | A12216 |
| 磷酸盐比色测定试剂盒 | Abcam | ab65622 | |
| 脂质组学 | EquiSPLASH LIPIDOMIX定量质谱内标 | Avanti | 330731-1EA |
| Orbitrap Velos Pro质谱仪 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| Vanquish超高效液相色谱系统 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| Accucore C30色谱柱 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| EdU检测 | Click-iT EdU试剂盒 | Life Technologies | C10340 |
| STORM样品制备 | 多聚-D-赖氨酸 | Gibco | A3890401 |
| 大鼠IgG2B LRP6抗体 | R&D Systems | MAB2960 | |
| 驴抗大鼠CF568二抗 | -- | -- | |
| Alexa Fluor 647标记的鼠EGF配体 | -- | -- | |
| STORM成像 | 半胱胺 | Sigma | 30070 |
| 葡萄糖氧化酶 | Sigma | G2133 | |
| 过氧化氢酶 | Sigma | C40 | |
| Nikon N-STORM 4.0超分辨率系统 | Nikon | -- | |
| RNA提取 | RNeasy裂解缓冲液 | Qiagen | 79216 |
| RNeasy微量试剂盒 | Qiagen | 74004 | |
| DNA-free DNA去除试剂盒 | Invitrogen | AM1906 | |
| RNA测序 | TruSeq Illumina链特异性mRNA试剂盒 | Illumina | -- |
| NextSeq 500测序仪 | Illumina | -- | |
| 单细胞RNA测序 | 10X Genomics Chromium控制器 | 10X Genomics | -- |
| NovaSeq6000测序仪 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 慢性高脂饮食模型 | HFD和LFD配方、喂养时间(12周)、小鼠性别(雄性)、年龄和来源 阅读提示:Methods中的Mice Genetics, Husbandry, and Diet小节及Table 1 |
| 结肠干细胞扩增和增殖检测 | Lgr5-GFP小鼠品系、EdU注射时间(2小时)、流式分选门控、类器官培养条件和重复数 阅读提示:Methods中的Colonic Crypt and Single-Cell Colonocyte Isolation、EdU Administration and Staining和Organoid Culture小节,以及Figure 2图注 |
| 质膜刚性和游离胆固醇定量 | Di4和Filipin III浓度、染色时间、成像设备参数、FlowSight质膜掩膜分析设置 阅读提示:Methods中的Membrane Order Measurement via Confocal Microscopy、Membrane Order Measurement via Image-Based Flow Cytometry和Filipin III Unesterified Cholesterol Staining小节,以及Figure 3图注 |
| 受体纳米簇集分析 | STORM抗体浓度、Voronoi分析参数(最大距离50 nm,最小分子数10)、FOV数量和统计方法 阅读提示:Methods中的Super Resolution Stochastic Optical Reconstruction Microscopy小节和Figure 4图注 |
| 体外LDL胆固醇和脂肪酸处理 | YAMC细胞代次(12-20)、LDL浓度(5-50 μM)和处理时间(24小时)、PA/POA浓度(50或250 μM)和处理时间(72小时)、人结肠类器官PA浓度(30 μM)和处理时长(最长29天) 阅读提示:Methods中的Cell Culture和Organoid Culture小节,以及Figure 10图注 |
| db/db小鼠实验 | db/db和db/+对照小鼠年龄(10周龄购买,11周龄处死)、饮食(到达后 acclimated于LFD)、性别(雄性) 阅读提示:Methods中的Mice Genetics, Husbandry, and Diet小节和Figure 6图注 |