构建糖异生或糖酵解基因缺陷沙门氏菌株
探究细菌葡萄糖代谢基因对葡萄糖摄取能力及抗肿瘤活性的影响
利用CRISPR/Cas9技术构建AISIH菌株的yidA、yigL、glpX、ppsA(糖异生)以及ptsG、pfkB、pykF、cra(糖酵解)单基因敲除株,通过PCR和测序验证,并检测生长曲线、菌落形态和2-NBDG摄取。
Metabolic Competition-Driven Antitumor Immunity of glpX-Deficient Engineered Salmonella via Glucose Deprivation and STING Activation in Bladder Cancer
包含体外细胞模型、皮下及原位膀胱癌动物模型、转录组分析,并进行了STING通路机制验证和免疫细胞功能分析。
MB49小鼠膀胱癌细胞系 MB49皮下膀胱癌同系小鼠模型 MB49原位膀胱癌小鼠模型 C57BL/6J小鼠骨髓来源树突状细胞(BMDCs)
细菌给药剂量:皮下及原位模型为1×10^6或3×10^6 CFU/只,腹腔注射 细菌与肿瘤细胞共培养的感染复数(MOI)为100,处理时间3-8小时或6小时 葡萄糖浓度设置:低(1 mM)、中(5 mM)、高(25 mM) 肿瘤细胞接种量:皮下模型2×10^5 MB49细胞/只;原位模型2×10^5 MB49细胞/只,膀胱内保留>40分钟 TNF-α中和处理:抗小鼠TNFα-InVivo 0.5 mg/只或TNF-αnb 5 mg/kg,腹腔注射
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究细菌葡萄糖代谢基因对葡萄糖摄取能力及抗肿瘤活性的影响
利用CRISPR/Cas9技术构建AISIH菌株的yidA、yigL、glpX、ppsA(糖异生)以及ptsG、pfkB、pykF、cra(糖酵解)单基因敲除株,通过PCR和测序验证,并检测生长曲线、菌落形态和2-NBDG摄取。
验证增强葡萄糖摄取的菌株是否具有更强的肿瘤细胞葡萄糖剥夺和抗肿瘤活性
将各突变株与MB49细胞共培养,检测2-NBDG摄取和肿瘤细胞增殖;在MB49皮下荷瘤小鼠中腹腔注射各菌株(1×10^6 CFU/只),监测肿瘤体积、肿瘤倍增时间和生存期。
探究GLA1通过葡萄糖剥夺诱导线粒体损伤和mtDNA释放,进而激活cGAS/STING通路的机制
在低、中、高葡萄糖浓度下共培养MB49细胞与菌株,检测ROS、线粒体膜电位、线粒体形态(TEM)、胞质mtDNA、STING通路蛋白磷酸化、Ifnb1/Cxcl10/Il-6表达及分泌,并评估肿瘤细胞上清对BMDC成熟的诱导。
实现肿瘤局部血管正常化,增强GLA1的抗肿瘤效果
将TNF-αnb序列置于群体感应启动子pLuxI下游,电转入GLA1构建GLA2,通过免疫印迹验证TNF-αnb表达和分泌;在皮下荷瘤小鼠中比较GLA1和GLA2对肿瘤血管密度、肿瘤生长和生存期的影响。
验证GLA2通过STING激活和免疫细胞重塑增强抗肿瘤免疫,并在原位模型中评估疗效
在皮下荷瘤小鼠中给药后3天,流式细胞术分析肿瘤和引流淋巴结中DC成熟、T细胞亚群和巨噬细胞极化;在MB49原位膀胱癌模型中腹腔注射GLA1或GLA2(3×10^6 CFU/只),活体成像监测肿瘤生长,并分析生存期和膀胱组织病理。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| BMDC诱导 | 白细胞介素-4 | Bioworld | BK0246 |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | MedChemExpress | HY-P7361 | |
| 葡萄糖摄取检测 | 2-NBDG葡萄糖类似物 | MKbio | MX4511 |
| 细胞核染色 | Hoechst染料 | KeyGEN BioTECH | KGA1804-10 |
| 胞质mtDNA提取 | 洋地黄皂苷 | Sigma | D141 |
| 蛋白浓度测定 | BCA蛋白测定试剂盒 | Biosharp | BL521A |
| DNA纯化 | QIAquick核苷酸去除试剂盒 | Qiagen | 28306 |
| ROS检测 | 2',7'-二氯二氢荧光素二乙酸酯 | Solarbio | D6470 |
| 线粒体膜电位检测 | TMRE线粒体膜电位检测试剂盒 | Beyotime | C2001S |
| 细胞活力检测 | CCK-8细胞计数试剂盒 | Vazyme | A311-01 |
| ELISA | IFN-β ELISA试剂盒 | Multi Sciences | EK2236 |
| IL-6 ELISA试剂盒 | BYabscience | BY-EM220188 | |
| CXCL10 ELISA试剂盒 | Multi Sciences | EK268 | |
| 蛋白裂解 | 含蛋白酶抑制剂的RIPA裂解液 | Proteintech | PK10014 |
| 磷酸酶抑制剂 | ABclonal | RM02997 | |
| Western blot | 5×上样缓冲液 | Sangon Biotech | C516031 |
| 抗FLAG一抗 | Sigma | F1804 | |
| 动物实验 | 抗小鼠TNFα体内抗体 | Selleck | A2124 |
| 原位模型 | 生物素示踪剂 | Vazyme | DD1210 |
| 流式细胞术 | 可固定活性染料 | BD Biosciences | 564407 |
| BD Pharmingen转录因子缓冲液套装 | BD Biosciences | 562574 | |
| CD11c-APC抗体 | Selleck | G0093 | |
| CD80-FITC抗体 | Selleck | G0211 | |
| CD86-PE抗体 | Invitrogen | 12-0862-82 | |
| RT-qPCR | FreeZol RNA提取试剂 | Vazyme | R711-01 |
| 逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | M16315 | |
| qPCR预混液 | Vazyme | Q111-02 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细菌与肿瘤细胞共培养 | MOI 100;处理时间3-8小时;葡萄糖浓度1、5、25 mM;培养基为无葡萄糖无酚红DMEM加10 μM 2-NBDG 阅读提示:Methods 'Glucose uptake assay'、'Apoptosis and proliferation assays'、'Mitochondrial damage assessment'及Figure 2、4图注 |
| 皮下膀胱癌模型构建与给药 | MB49细胞2×10^5/只皮下注射;肿瘤体积80-120 mm3时给药;细菌剂量1×10^6或3×10^6 CFU/只腹腔注射;n=7或9 阅读提示:Methods 'Animal models'、Figure 3G、5L、5M图注 |
| 原位膀胱癌模型构建与给药 | MB49细胞2×10^5/只膀胱内灌注,保留>40分钟;第6天给药3×10^6 CFU/只腹腔注射;n=7 阅读提示:Methods 'Animal models'、Figure 7A图注 |
| STING通路激活检测 | 共培养MOI 100,低葡萄糖(1 mM)处理3小时(蛋白磷酸化)或6小时(qPCR/ELISA);Western blot抗体信息见表S3;ELISA检测时间2、4、8小时 阅读提示:Methods 'Western blotting'、'Cytokine quantification'、Figure 4G-4I图注 |
| 免疫细胞分析 | 给药后3天取肿瘤和引流淋巴结;流式抗体panel及浓度见表S3;BMDC成熟实验:肿瘤细胞4×10^6/ml与菌共培养8小时,上清与DC 2×10^5培养24小时 阅读提示:Methods 'FCM analysis'、Figure 6图注 |