mPPL-001的体外生成与基因编辑效率评估
验证CRISPR/Cas9切除hFXN GAA扩增的效率及产品特性
从YG8JR小鼠分离Sca1+ HSPCs,用RNP复合物电转生成mPPL-001;培养7天后检测GAA切除效率,并进行集落形成能力检测。
Edited HSPCs rescue frataxin deficiency and inflammation-driven multisystemic pathology in Friedreich's ataxia mice
包含体外基因编辑、人源化小鼠模型体内移植、多组织植入与功能验证及转录组机制分析等多层级证据。
人源化YG8JR FRDA小鼠模型 YG8JR小鼠来源的Sca1+骨髓造血干祖细胞 mPPL-001基因编辑造血干祖细胞
mPPL-001的hFXN GAA切除效率为7.6%–30.5%,平均20.3% 移植后6.5–7个月分析植入和分布 mPPL-001剂量为每只小鼠1.5–1.75 × 106个细胞,尾静脉注射 受体小鼠2.0–2.5月龄,接受7 Gy致死剂量照射 mPPL-001切除效率>14%与一致的治疗获益相关
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证CRISPR/Cas9切除hFXN GAA扩增的效率及产品特性
从YG8JR小鼠分离Sca1+ HSPCs,用RNP复合物电转生成mPPL-001;培养7天后检测GAA切除效率,并进行集落形成能力检测。
评估单次系统输注后供体细胞在造血组织和FRDA受累组织的植入
2.0–2.5月龄YG8JR受体经7 Gy致死照射后24小时,尾静脉输注mPPL-001或mock HSPCs;移植后6.5–7个月用ddPCR检测各组织嵌合。
验证mPPL-001是否改善FRDA小鼠运动缺陷并保护小脑结构
Catwalk步态分析、H&E和NeuN免疫染色评估小脑GCL和ML厚度,免疫荧光检测小脑hFXN表达并与骨髓植入进行回归分析。
评估mPPL-001对小脑基因表达、微胶质细胞活化和炎症通路的影响
移植后6个月取小脑进行bulk RNA-seq、差异表达分析、GSEA和leading-edge分析;Iba1免疫染色和Sholl分析微胶质细胞形态。
验证mPPL-001对FRDA小鼠心脏病理和线粒体FXN表达的作用
M模式超声心动图检测心脏功能,电镜分析心肌线粒体形态,质谱检测线粒体hFXN,免疫荧光检测CD68+巨噬细胞。
验证mPPL-001是否保护朗格汉斯胰岛β细胞并调节胰腺炎症
H&E评价胰岛细胞结构,胰岛素免疫荧光检测β细胞,免疫荧光检测CD68+和CD206+巨噬细胞。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| HSPC分离 | 抗Sca1+抗体 | Miltenyi Biotec | 130-123-124 |
| HSPC培养 | StemSpan培养基 | Stem Cell Technologies | 9600 |
| 基因编辑 | Alt-R-Cas9电转增强剂 | IDT | 1075915 |
| SpyFi Cas9核酸酶 | Aldevron | 9214-0.25MG | |
| sgRNA UP4和sgRNA DN4 | Synthego Corporation | -- | |
| Neon转染系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 集落形成实验 | MethoCult GF培养基 | StemCell Technologies | M3434 |
| 集落成像 | AWG EVOS显微镜 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 血糖检测 | CVS Health高级血糖仪 | CVS Health | -- |
| 步态分析 | CatWalk系统 | Nodulus Instruments | -- |
| 超声心动图 | Vevo 2100超声系统 | FUJIFILM VisualSonics | -- |
| 组织病理学 | Keyence BZX-800显微镜 | Keyence | -- |
| 电镜样本包埋 | Durcupan树脂 | Sigma-Aldrich | 44610-1EA |
| 电镜成像 | JEOL 1400 Plus透射电子显微镜 | JEOL | -- |
| 基因组DNA提取 | Quick Extract | LGC Biosearch Technologies | QE0905T |
| 组织DNA提取 | DNeasy血液和组织试剂盒 | Qiagen | 69505 |
| ddPCR | HindIII-HF限制酶 | New England Biolabs | R3104S |
| ddPCR探针预混液 | Bio-Rad | 1863024 | |
| QX200微滴生成仪 | Bio-Rad | -- | |
| QX200微滴读取仪 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫荧光 | 抗FXN抗体 | LS-Bio | LS-B15909-50 |
| 抗胰岛素抗体 | Proteintech | 66198-1-Ig | |
| 抗Iba1抗体 | Synaptic Systems | 234-017 | |
| 抗NeuN抗体 | Thermo Fisher Scientific | 702022 | |
| 抗CD68抗体 | Cell Signaling Technology | 97778S | |
| 抗CD206抗体 | Cell Signaling Technology | 76220 | |
| Alexa Fluor Plus二抗 | Thermo Fisher Scientific | A32795, A32773, A48270, A32790 | |
| FXN质谱 | Bullet Blender 24 Gold组织匀浆器 | Next Advance | -- |
| Agilent 1290 Infinity II超高效液相色谱系统 | Agilent Technologies | -- | |
| 6495C三重四极杆质谱仪 | Agilent Technologies | -- | |
| RNA提取 | PureLink RNA小量提取试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 12-183-018A |
| RNA测序 | NovaSeq X Plus测序仪 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| mPPL-001生成 | RNP组成、sgRNA序列、电转参数、细胞数和切除效率 阅读提示:Methods中HSPC isolation, gene editing and transplantation小节 |
| 移植 | 照射剂量、移植细胞数、注射途径、小鼠年龄和性别 阅读提示:Methods中Transplantation小节和图1A |
| 植入分析 | 分析时间、检测方法、组织类型和嵌合率 阅读提示:Results中Transplantation of mPPL-001部分和图1C |
| 小脑转录组分析 | 测序平台、样本量、差异表达阈值和统计方法 阅读提示:Methods中Bulk mRNA sequencing and analysis小节和图3 |
| 心脏线粒体FXN检测 | 质谱方法、组织处理、重复数和检测指标 阅读提示:Methods中FXN mass spectrometry小节和图4C |