AML骨髓基质细胞图谱分析
描绘AML进展中非造血骨髓基质细胞景观并鉴定关键分泌因子。
从MLL-AF9白血病和对照小鼠分离Lin-CD45-CD71-基质细胞,进行scRNA-seq和Smart-seq2,整合分泌组数据鉴定候选因子。
FGF18 mediates fibroblast-leukemia crosstalk to promote acute myeloid leukemia progression
包含scRNA-seq、CRISPR筛选、条件性基因敲除小鼠、PDX模型、共培养、抗体治疗及临床样本等多层级实验,并有功能与机制验证。
MLL-AF9和C1498小鼠AML模型 Molm-13和OCI-AML3人AML细胞系 患者来源异种移植(PDX)AML模型 PdgfraCreERT2;Fgf18flox/flox成纤维细胞特异性Fgf18敲除小鼠
重组FGF18处理剂量:0.01、0.1、1 μg,每两天腹腔注射一次 FGF18中和抗体剂量:100 μg/只,每两天腹腔注射一次 CRISPR-Cas9全基因组筛选在有无FGF18刺激下进行 共培养体系检测FGF18驱动的白血病生长和T细胞调节 FGFR3敲除或FGFR1/2/4敲除对FGF18诱导增殖的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
描绘AML进展中非造血骨髓基质细胞景观并鉴定关键分泌因子。
从MLL-AF9白血病和对照小鼠分离Lin-CD45-CD71-基质细胞,进行scRNA-seq和Smart-seq2,整合分泌组数据鉴定候选因子。
确认FGF18在AML中由成纤维细胞特异性上调并评估临床相关性。
使用多种报告小鼠分选基质细胞亚群,检测Fgf18表达;免疫荧光、ELISA和qRT-PCR检测患者样本FGF18水平。
验证FGF18对AML进展的驱动作用。
重组FGF18处理AML细胞和PDX模型;构建成纤维细胞特异性Fgf18敲除小鼠,移植AML细胞并观察疾病进展。
确定FGF18在AML细胞上的特异性受体及下游信号。
在AML细胞中进行全基因组CRISPR-Cas9筛选,鉴定Fgfr3;共免疫沉淀和免疫荧光验证结合;Western blot检测PI3K-AKT-mTOR通路。
探究FGF18诱导的细胞因子及其在白血病-成纤维细胞串扰中的作用。
检测FGF18处理后AML细胞IL-6分泌;IL-6中和或敲低;分析JAK-STAT3在成纤维细胞中的激活;E2F1-MYC/ID1轴分析。
评估FGF18中和抗体单用及与抗PD-1联用的体内疗效和安全性。
在MLL-AF9 AML小鼠中腹腔注射FGF18抗体,检测白血病负荷、生存期和CD8+ T细胞比例;联合抗PD-1治疗。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 重组FGF18 | -- | -- |
| 重组人IL-6 | -- | -- | |
| IL-6中和抗体 | -- | -- | |
| FGF18中和抗体 | -- | -- | |
| MK-2206 | -- | -- | |
| 雷帕霉素 | -- | -- | |
| itacitinib | -- | -- | |
| 流式分析 | Alexa Fluor 700 | -- | -- |
| 异硫氰酸荧光素 | -- | -- | |
| 藻红蛋白 | -- | -- | |
| 抗PD-1抗体 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| FGF18功能获得实验 | 重组FGF18给药剂量、给药途径、给药频率、起始时间、模型类型、样本量 阅读提示:Methods 'FGF18 promotes AML progression'部分及Figure 3A图注。 |
| FGF18功能缺失实验 | PdgfraCreERT2;Fgf18flox/flox小鼠诱导条件、AML细胞移植数量、对照组设置、生存分析样本量 阅读提示:Methods 'Fibroblast-specific secretion of FGF18 contributes to AML progression'部分及Figure 3H-L图注。 |
| CRISPR-Cas9筛选 | sgRNA文库、筛选时间、FGF18刺激条件、细胞系、测序和分析方法 阅读提示:Methods 'FGF18 binds to FGFR3 and activates the PI3K-AKT-mTOR signaling pathway'部分及Figure 4D-E图注。 |
| FGF18中和抗体治疗实验 | 抗体剂量、给药途径、给药频率、起始时间、模型、生存分析样本量、联合抗PD-1方案 阅读提示:Methods 'Development and testing of an FGF18 Ab to improve survival in AML mice and overcome resistance to aPD-1 therapy'部分及Figure 7D-L图注。 |
| 临床样本分析 | 患者样本来源、数量、分组、FGF18检测方法和阈值 阅读提示:Methods 'Fibroblast-specific secretion of FGF18 contributes to AML progression'部分及Figure 2F-I图注。 |