建立并验证转移性mKPC-GB-Luc细胞系
获得具有高转移潜能的鼠源PDAC细胞系以模拟PDAC转移生物学
将KPC-Luc细胞在PANC-1细胞过滤条件培养基中培养,建立mKPC-GB-Luc细胞系;通过STR分析确认鼠源;bulk RNA测序分析转移、干性、间充质和血管生成标志物;与KPC-ML1-Luc转录组比较
Reprogramming the pancreatic ductal adenocarcinoma microenvironment: a novel integrin-targeted cytotoxin, ProAgio, potentiates chemotherapy
包含体外细胞实验、两种原位小鼠模型、KPC GEM模型及scRNA-seq/流式/免疫荧光等多层级功能与机制验证。
mKPC-GB-Luc原位小鼠PDAC模型 KPC-ML1-Luc原位小鼠PDAC模型 KPC基因工程小鼠模型(KPC GEM) Rag1-/-敲除小鼠KPC-ML1-Luc原位模型
mKPC-GB-Luc细胞系通过STR分析确认小鼠来源,bulk RNA测序验证转移、干性、间充质和血管生成标志物上调 原位模型分组:假对照、FOI、ProAgio、FOI+ProAgio,每组n=5 GPTx模型使用C57BL/6J野生型和Rag1-/-敲除小鼠,每组n=10 KPC GEM生存研究使用吉西他滨联合ProAgio,比较假对照、Gem、ProAgio和Gem+ProAgio pimonidazole检测缺氧,免疫组化/免疫荧光检测HIF-1α、整合素β3、E-cadherin、Ki67、CD31、VEGF
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得具有高转移潜能的鼠源PDAC细胞系以模拟PDAC转移生物学
将KPC-Luc细胞在PANC-1细胞过滤条件培养基中培养,建立mKPC-GB-Luc细胞系;通过STR分析确认鼠源;bulk RNA测序分析转移、干性、间充质和血管生成标志物;与KPC-ML1-Luc转录组比较
验证ProAgio是否增强化疗对肿瘤生长和转移的抑制
使用mKPC-GB-Luc和KPC-ML1-Luc原位小鼠模型,分别给予FOI或GPTx方案,单独或联合ProAgio;通过生物发光成像、离体肿瘤重量、肝肺转移评估疗效
验证ProAgio是否通过减少缺氧和调节血管生成增强化疗效果
使用pimonidazole检测缺氧,免疫组化和免疫荧光检测HIF-1α、integrin β3、E-cadherin、Ki67、CD31和VEGF
验证ProAgio是否重编程CAFs并影响支持肿瘤的代谢物分泌
通过流式细胞术和scRNA-seq分析CAF亚群;体外检测TGFβ刺激的PSC分泌甘氨酸和丝氨酸;scRNA-seq分析CAF轨迹
验证联合治疗是否诱导抗肿瘤免疫激活
通过流式细胞术、scRNA-seq、免疫荧光和COMET分析T细胞、NK细胞、巨噬细胞亚群和细胞因子表达;使用PMA和ionomycin刺激T/NK细胞检测胞内细胞因子
验证联合治疗是否延长生存并重编程TME
使用两组KPC GEM:第一组用于生存分析;第二组提前终止用于scRNA-seq和COMET;检测肿瘤重量、肝转移、HIF1α、integrinβ3、E-cadherin、Ki67、CD31和VEGF
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| mKPC-GB-Luc细胞系建立 | PANC-1条件培养基制备方法:文中未明确说明;STR分析确认鼠源;bulk RNA测序验证转移相关标志物 阅读提示:Results中'Establishment of metastatic KPC-Ganji & Bassel-Luc (mKPC-GB-Luc) cell lines'及Fig. 1A-B、Suppl. Figure 1A-D |
| 原位小鼠模型和分组 | mKPC-GB-Luc模型每组n=5;KPC-ML1-Luc模型每组n=10;Rag1-/-敲除小鼠每组n=10;FOI和GPTx具体剂量和给药途径:文中未明确说明 阅读提示:Fig. 1C、Fig. 3A及图注 |
| 缺氧和EMT检测 | pimonidazole给药剂量和时间:文中未明确说明;检测时间点:Day 5和Day 29(或Day 26)生物发光成像,终止时取材 阅读提示:Fig. 1F-G、Fig. 4D及Methods |
| 免疫细胞功能分析 | PMA和ionomycin刺激浓度、brefeldin A浓度:文中未明确说明;刺激时间5小时 阅读提示:Results中'Combinational effects of ProAgio plus chemo regimens on immune cells'及Suppl. Figure 4K-L |
| KPC GEM生存和机制研究 | 吉西他滨剂量和给药方案:文中未明确说明;ProAgio剂量和给药方案:文中未明确说明;生存研究样本量:文中未明确说明 阅读提示:Fig. 4A-B及Results中'Effect of gemcitabine (Gem) combinations with ProAgio on PDAC growth and survival in KPC GEMMs' |