人AAA和鼠AAA模型中MOF表达及炎症通路分析
验证MOF在AAA单核/巨噬细胞中表达升高及其与炎症转录程序的关联。
对人AAA和对照组织进行scRNA-seq,分析MOF在单核/巨噬细胞中的表达;在AngII和弹性蛋白酶诱导的小鼠AAA模型中检测Mof mRNA水平;再分析鼠scRNA-seq数据。
Acetyltransferase MOF Regulates Macrophage Inflammation in Abdominal Aortic Aneurysms
含人AAA scRNA-seq、两种小鼠AAA模型、巨噬细胞特异性基因敲除、药物抑制、ChIP和流式验证
人AAA主动脉组织单细胞RNA测序样本 AngII诱导的C57BL/6J小鼠AAA模型 弹性蛋白酶诱导的小鼠AAA模型 巨噬细胞特异性Mof敲除小鼠(Mofflox/floxLys2Cre+)
小鼠AAA模型:AngII输注1000 ng/min/kg,持续28天;弹性蛋白酶局部应用30 μl(5 U/mg蛋白) MOF药理抑制:MG-149 1 mg/kg,每3天腹腔注射,从泵植入前3天或植入后8天开始,持续28天 巨噬细胞特异性Mof敲除:Mofflox/floxLys2Cre+小鼠,对照为Mofflox/floxLys2Cre- 体外刺激:BMDMs用TNF-α 25 ng/mL,有或无MG-149 20 μM处理4-10小时 检测终点:主动脉最大直径、AAA发生率、H4K16ac在Il1b/Tnfa启动子NF-κB结合位点的ChIP、炎症细胞因子表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证MOF在AAA单核/巨噬细胞中表达升高及其与炎症转录程序的关联。
对人AAA和对照组织进行scRNA-seq,分析MOF在单核/巨噬细胞中的表达;在AngII和弹性蛋白酶诱导的小鼠AAA模型中检测Mof mRNA水平;再分析鼠scRNA-seq数据。
验证MOF是否通过增加H4K16ac在NF-κB结合位点驱动炎症基因转录。
在AngII诱导的AAA小鼠主动脉组织中,通过免疫荧光检测F4/80+巨噬细胞中H4K16ac;通过ChIP分析Il1b和Tnfa启动子NF-κB位点的H4K16ac水平;检测Il1b和Tnfa基因表达。
验证TNF-α是否诱导MOF表达,以及MOF抑制是否逆转炎症细胞因子表达和H4K16ac。
分离BMDMs,用TNF-α处理6和10小时检测Mof表达;用TNF-α或TNF-α+MG-149处理4-10小时,检测Il1b和Tnfa表达及H4K16ac。
验证MG-149抑制MOF能否减少AAA形成和巨噬细胞炎症。
在AngII诱导的AAA小鼠模型中,从泵植入前3天或植入后8天开始每3天腹腔注射MG-149或PBS,持续28天;超声测量主动脉直径和AAA发生率;流式分析巨噬细胞表型;qPCR和ChIP分析炎症基因表达和H4K16ac;组织学分析弹性蛋白断裂。
验证巨噬细胞特异性Mof缺失能否减少AAA形成和巨噬细胞炎症。
使用Mofflox/floxLys2Cre+和Mofflox/floxLys2Cre-小鼠,在弹性蛋白酶和AngII诱导的AAA模型中评估主动脉直径、炎症细胞因子表达、H4K16ac水平和组织学变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 血管紧张素II | Bachem | H-1706 |
| MG-149 | Selleckchem | S7476 | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| 肿瘤坏死因子-α | -- | -- | |
| 流式分析 | 抗F4/80抗体 | BioLegend | 123149 |
| 抗CD11b抗体 | BioLegend | 101206 | |
| 抗CD45抗体 | BioLegend | 103106 | |
| 抗Ly6C抗体 | BioLegend | 128028 | |
| 抗Ly6G抗体 | BioLegend | 127624 | |
| Western blot | 抗H4K16ac抗体 | Cell Signaling | E2B8W |
| ChIP | 抗H4K16ac抗体 | Active Motif | 39167 |
| 蛋白A-琼脂糖珠 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| RT-qPCR | iScript逆转录试剂盒 | Biorad | -- |
| 2X Taqman PCR预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| 组织学 | Verhoeff–van Gieson染色 | Newcomer Supply | 9116B |
| 流式分析 | 可固定LIVE/DEAD活力染料 | BioLegend | 564406 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠AAA模型构建 | 小鼠品系、性别、年龄、AAV注射剂量、饮食类型、AngII输注速率和时间、弹性蛋白酶浓度和用量 阅读提示:Methods中EXPERIMENTAL MODEL AND SUBJECT DETAILS、Osmotic Mini Pump Implantation and AngII Infusion、Elastase treatment model of aneurysm formation |
| MOF药理抑制 | MG-149剂量、给药途径、给药频率、开始时间、持续时间、对照组溶剂 阅读提示:Methods中Osmotic Mini Pump Implantation and AngII Infusion,Figure 5A |
| 巨噬细胞特异性Mof敲除 | Mofflox/floxLys2Cre+小鼠构建方法、对照小鼠基因型、验证方法 阅读提示:Results中AAA formation is inhibited in macrophage-specific MOF-deficient mice,Supplemental Figure 9 |
| 体外巨噬细胞刺激 | BMDMs分离培养方法、TNF-α浓度和处理时间、MG-149浓度、LPS浓度和处理时间 阅读提示:Methods中Cell culture and cytokine analysis、Inflammatory cytokine ELISA |
| ChIP分析 | 抗体品牌和货号、细胞固定方法、超声条件、引物序列、qPCR条件 阅读提示:Methods中ChIP assay |
| 流式细胞术 | 组织消化酶浓度和时间、抗体克隆号和稀释比例、设门策略、活性染料 阅读提示:Methods中Flow cytometry |