ABI3在AD模型中的表达验证
确定ABI3在AD小鼠脑内的表达细胞类型和水平。
对8月龄APP/PS1小鼠脑组织进行scRNA-seq和空间转录组,免疫荧光共染ABI3与Iba1、NeuN、GFAP,RT-qPCR检测Abi3 mRNA。
Aberrant phase separation from a rare ABI3 mutation drives microglial dysfunction and Alzheimer's risk
含体外模型(细胞系、原代小胶质细胞、重组蛋白)和体内模型(5×FAD、APP/PS1小鼠),并进行了功能验证(迁移、吞噬)和机制验证(LLPS、FRAP、光遗传学、1,6-己二醇实验)。
5×FAD转基因小鼠(小胶质细胞特异性ABI3/S209F过表达或敲低) APP/PS1转基因小鼠(小胶质细胞特异性ABI3敲低) 原代小鼠小胶质细胞 HMC3人小胶质细胞系
ABI3 S209F突变破坏LLPS,减少小胶质细胞迁移和吞噬 小胶质细胞特异性ABI3敲低加剧Aβ斑块负荷 ABI3过表达减少Aβ斑块并改善5×FAD小鼠认知,S209F无此效果 Ser209磷酸化(S209D)促进LLPS,S209A抑制LLPS FUS IDR融合可恢复S209F的LLPS缺陷及小胶质细胞功能
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定ABI3在AD小鼠脑内的表达细胞类型和水平。
对8月龄APP/PS1小鼠脑组织进行scRNA-seq和空间转录组,免疫荧光共染ABI3与Iba1、NeuN、GFAP,RT-qPCR检测Abi3 mRNA。
验证ABI3缺失是否加剧AD病理。
向6月龄APP/PS1小鼠海马注射AAV6-Iba1p-EGFP-miR155-Abi3或对照,12月龄取材,免疫荧光检测Aβ斑块和DAPI,共聚焦成像分析斑块数量、直径、面积及小胶质细胞聚集。
验证ABI3过表达的保护作用是否依赖S209位点。
向6月龄5×FAD小鼠海马注射AAV6-Iba1p-EGFP-ABI3或ABI3 S209F或对照,8月龄进行行为学测试(Y迷宫、新物体识别、Morris水迷宫),9月龄取材检测Aβ斑块和小胶质细胞聚集。
在体外验证ABI3和S209F对小胶质细胞功能的影响。
在HMC3、BV2和原代小胶质细胞中过表达ABI3或ABI3 S209F,进行划痕实验(0-48小时)和荧光乳胶珠吞噬实验,用共聚焦显微镜成像并定量。
确定ABI3是否发生LLPS以及S209F突变的影响。
在HEK293T、HMC3和SH-SY5Y细胞中过表达ABI3-EGFP或ABI3 S209F-EGFP,共聚焦成像观察液滴;进行FRAP、融合/分裂实时成像、1,6-己二醇处理、光遗传学optoDroplet实验;体外使用重组蛋白和crowding agents(PEG 8000, Ficoll 400, NaCl)进行浊度测定和FRAP。
研究S209F突变如何通过磷酸化和IDR结构影响LLPS。
构建ABI3 S209A、S209D、IDR缺失突变体(ΔIDR1, ΔIDR2, ΔIDR3, ΔIDR4, ΔSH3, ΔAbi)和FUS IDR融合体,转染HEK293T细胞,共聚焦成像定量液滴数量、直径、面积;使用PONDR预测IDR,分子动力学模拟分析相互作用。
通过功能丧失和功能获得实验建立LLPS与小胶质细胞功能的因果联系。
用1,6-己二醇处理过表达ABI3或ABI3 S209F的HMC3和BV2细胞,检测迁移和吞噬;将ABI3 IDR2或FUS IDR融合到S209F,检测功能恢复;光遗传学激活ABI3 IDR[89-132]-mCherry-Cry2,检测迁移和吞噬。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| AAV生产 | AAV6血清型 | Shanghai Genechem Co., Ltd. | -- |
| 细胞培养 | Dulbecco改良Eagle培养基 | -- | -- |
| 最低必需培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher | -- |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | -- | -- | |
| 相分离破坏 | 1,6-己二醇 | Sigma-Aldrich | #240117 |
| 细胞活力检测 | CCK-8检测试剂盒 | Dojindo | #CK04 |
| 免疫荧光 | 抗ABI3抗体 | Biorbyt | Orb221333-100 |
| 抗Iba1抗体 | Wako | 019-19741 | |
| 抗Aβ抗体 | Abcam | ab11132 | |
| Western blot | 抗ABI3抗体 | Abcam | ab214318 |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| 麻醉 | 2,2,2-三溴乙醇 | -- | -- |
| 蛋白质纯化 | Superdex 20柱 | -- | -- |
| MBP柱 | -- | -- | |
| 镍柱 | -- | -- | |
| 吞噬实验 | 红色荧光乳胶珠 | -- | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与AAV注射 | 小鼠品系(APP/PS1或5×FAD)、性别(雄性)、年龄(6月龄注射,12月龄或9月龄取材)、AAV血清型(AAV6)、滴度(5.52×10^12 TU/mL)、注射体积(1 µL)、注射坐标(AP -2.0 mm, ML ±1.5 mm, DV -1.8 mm)、注射速率(0.1 µL/min)、样本量(n=12/组) 阅读提示:Methods 2.1 Animals, 2.16 AAV construct, 2.17 Stereotactic injection |
| 细胞培养与转染 | 细胞系(HMC3, BV2, HEK293T, SH-SY5Y, 原代小胶质细胞)、培养基(DMEM+10% FBS+1% P/S, MEM+NEAA)、转染试剂(Lipofectamine 2000/3000)、质粒用量(1-2 µg)、原代小胶质细胞纯度(>95%) 阅读提示:Methods 2.2 Cell culture, 2.3 Plasmid construction and transfection, 2.25 Primary microglia isolation |
| LLPS体外重组实验 | 重组蛋白浓度(5-25 µM)、crowding agents(PEG 8000 10%, Ficoll 400 5%)、NaCl浓度(50 mM-0.5 M)、1,6-己二醇浓度(2.5%或5%)、孵育时间(5分钟至过夜)、温度(室温)、FRAP参数(488 nm激光,3秒漂白,每20秒拍摄,140秒) 阅读提示:Methods 2.5-2.9, Figure 5 |
| 细胞功能实验 | 迁移实验:划痕时间点(6, 9, 24 h或12, 24, 36, 48 h)、血清浓度(1%)、Aβ浓度(100 nM);吞噬实验:乳胶珠直径(1.0 µm)、稀释比例(1:10,000)、孵育时间(3小时)、细胞数量(2×10^5) 阅读提示:Methods 2.14 Cell migration, 2.15 Cell phagocytosis, Figure 3, Figure S7 |
| 行为学测试 | 测试月龄(8月龄)、测试顺序、设备尺寸、训练时长、探针试验参数、样本量(n=12/组) 阅读提示:Methods 2.18-2.21, Figure 2F-I |