建立可重复的局部NM角膜损伤模型
在小鼠中实现局限于中央角膜、可重复的化学损伤。
利用3D打印模具将滤纸塑形成帽状,贴合小鼠角膜曲率,比较帽状与平铺滤纸在碱烧伤中的接触和损伤形态;随后用不同浓度和时间NM处理角膜筛选损伤条件。
BRD4 inhibition mitigates acute and chronic corneal injury following topical nitrogen mustard exposure
小鼠与兔角膜损伤模型,结合活体成像、组织学、RNA-seq及BD1/BD2选择性抑制剂功能验证
C57BL/6J小鼠角膜NM损伤模型 New Zealand White兔角膜NM损伤模型
小鼠角膜损伤诱导条件:2% NM,1 μL,暴露5分钟 兔角膜损伤诱导条件:2% NM,16 μL,暴露5分钟 JQ1局部处理:1 mM,伤后2小时开始,每日5次,急性研究3天或慢性研究14天 GSK778和GSK620局部处理浓度分别为1 mM和3 mM,给药频次同JQ1 主要检测终点:角膜浑浊评分、AS-OCT中央角膜厚度、IVCM、CD45+/CD3+免疫细胞、H3K122ac、DHE、8-OHdG、ZO-1、Col1a1及RNA-seq
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在小鼠中实现局限于中央角膜、可重复的化学损伤。
利用3D打印模具将滤纸塑形成帽状,贴合小鼠角膜曲率,比较帽状与平铺滤纸在碱烧伤中的接触和损伤形态;随后用不同浓度和时间NM处理角膜筛选损伤条件。
刻画NM诱导角膜损伤的时间和组织分层变化。
在伤前及伤后多个时间点进行裂隙灯、AS-OCT和IVCM成像,评估角膜透明度、中央角膜厚度、上皮、基质和内皮变化。
确认活体成像观察到的炎症细胞浸润和持续性内皮损伤。
对伤后第3天角膜切片进行CD45和CD3免疫荧光染色;对伤后第84天角膜全片进行ZO-1染色并进行内皮形态计量分析。
确定BRD4是否在NM角膜损伤早期上调并激活。
重分析SM处理兔角膜RNA-seq数据;对小鼠伤后第3天角膜切片进行BRD4和H3K122ac免疫荧光染色;局部JQ1后检测H3K122ac。
检验局部JQ1是否减轻NM诱导的急性免疫细胞浸润和炎症基因表达。
NM损伤后局部给予JQ1或vehicle 3天,伤后第3天免疫荧光检测中央和角膜缘CD45+、CD3+细胞,并检测炎症因子和趋化因子表达。
明确JQ1在NM损伤角膜中逆转的基因程序和通路。
从Sham+Vehicle、Sham+JQ1、NM+Vehicle、NM+JQ1四组伤后第3天中央角膜提取RNA并进行bulk RNA-seq,开展DESeq2差异表达、GO、GSVA和PPI网络分析。
验证转录组提示的氧化应激通路变化。
伤后第3天进行DHE染色检测超氧阴离子,并用SOD预孵育验证特异性;同时检测8-OHdG免疫荧光。
检验急性期短期JQ1处理是否长期保护角膜结构并减少慢性重塑。
NM损伤后局部JQ1或vehicle处理14天,纵向活体成像至第84天,并组织学检测慢性炎症、基质细胞密度、Col1a1和内皮ZO-1。
判断JQ1保护作用是否可由选择性抑制BD1或BD2重现。
NM损伤后局部给予GSK778或GSK620,分别在第3天和第84天通过裂隙灯和AS-OCT评估角膜浑浊和中央角膜厚度。
在更具临床相关性的角膜模型中验证JQ1疗效。
兔中央角膜暴露于2% NM,伤后2小时开始局部JQ1或vehicle处理14天,裂隙灯和AS-OCT评估角膜透明度、水肿、上皮-基质界面和新生血管。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| BET抑制剂处理 | JQ1 | MedChemExpress | HY-13030 |
| GSK778 | MedChemExpress | HY-136570 | |
| GSK620 | MedChemExpress | HY-137892 | |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 羟丙基-β-环糊精 | -- | -- | |
| 局部麻醉 | 盐酸丙美卡因 | Sandoz, Alcon Laboratories | -- |
| 兔麻醉 | 布比卡因 | Hospira Inc. | -- |
| 免疫荧光染色 | 大鼠抗小鼠CD45抗体 | BD Pharmingen | 550539 |
| ZO-1多克隆抗体 | Invitrogen | 61-7300 | |
| CD3抗体 | eBioscience | 11-0031-82 | |
| Col1a1抗体 | Cell Signaling Technology | 72026 | |
| BRD4抗体 | Abcam | ab128874 | |
| 乙酰化组蛋白H3K122抗体 | Abcam | ab33309 | |
| 8-OHdG抗体 | Bioss | BS1278R | |
| Alexa Fluor偶联二抗 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| DAPI | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 含DAPI的Fluoroshield封片剂 | MilliporeSigma | F6057 | |
| 超氧阴离子检测 | 二氢乙锭 | Thermo Fisher Scientific | D11347 |
| 超氧化物歧化酶 | MilliporeSigma | S9549 | |
| HEPES缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | J61275 | |
| RT-qPCR | miRNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | 217004 |
| High-Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 4368813 | |
| SYBR Green预混液 | Thermo Fisher Scientific | 4368708 | |
| StepOnePlus实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| RNA-seq | NEBNext Ultra II RNA文库构建试剂盒 | New England Biolabs | E7775L |
| NanoDrop 2000 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 活体成像 | Topcon SL-D701裂隙灯生物显微镜 | Topcon | -- |
| Bioptigen Envisu R2200 SD-OCT系统 | Bioptigen | -- | |
| Heidelberg HRT3 RCM系统 | Heidelberg Engineering | -- | |
| 共聚焦成像 | LSM800共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠NM角膜损伤诱导 | NM浓度2%、体积1 μL、暴露时间5分钟;滤纸帽直径2 mm、曲率半径1.5 mm;伤后充分生理盐水冲洗至少2分钟 阅读提示:Materials and methods中Establishment of a localized corneal chemical injury model及Figure 1 legend |
| 兔NM角膜损伤诱导 | NM浓度2%、体积16 μL、暴露时间5分钟;滤纸帽直径8 mm、曲率半径7 mm;麻醉和镇痛方案 阅读提示:Materials and methods中Establishment of a localized corneal chemical injury model及Figure 8 legend |
| BET抑制剂局部处理 | JQ1 1 mM、GSK778 1 mM、GSK620 3 mM;vehicle为含1% DMSO和10% HPβCD的PBS;小鼠5 μL/次、兔50 μL/次;伤后2小时开始,每日5次,急性3天或慢性14天 阅读提示:Materials and methods中BET inhibitor treatment及Figure 3C、Figure 6、Figure 8 legend |
| 纵向活体成像 | 小鼠成像时间点为伤前5天及伤后第3、7、14、21、42、84天;兔成像时间点为伤后第3、7、14、28、42天;AS-OCT使用18-mm telecentric lens;IVCM视野300 × 300 μm 阅读提示:Materials and methods中Multimodal, longitudinal, non-invasive live imaging及Figure 1A、Figure 8 legend |
| RNA-seq与数据分析 | 四组Sham+Vehicle、Sham+JQ1、NM+Vehicle、NM+JQ1,每组n=6;伤后第3天取材;单批次处理24个样本;DESeq2差异基因阈值 阅读提示:Materials and methods中Bulk RNA sequencing and data processing及Figure 5 legend |
| 组织学与形态计量 | 第3天和第84天取材;CD45、CD3、ZO-1、Col1a1、BRD4、H3K122ac、8-OHdG抗体信息;内皮形态分析排除面积<100 μm2细胞;样本量n=4–9 阅读提示:Materials and methods中Tissue collection and histology、Image processing and quantitative analysis及Figure 2、Figure 4、Figure 7 legend |