人类队列中ABCs与新发冠状动脉事件的关联分析
验证ABCs是否随年龄增加并与新发CE相关。
在Malmö Diet and Cancer队列嵌套病例对照研究中,用流式细胞术对604名个体基线PBMC进行B细胞表型分析,随访中位14年,CE病例与对照按年龄和性别1:1匹配,分析ABCs计数与CE关联。
Age-associated B-cells predict coronary events in humans and aggravate murine atherosclerosis
包含人类病例对照队列、单细胞RNA/BCR测序、流式细胞术及两种小鼠过继转移模型,并进行了功能与机制验证。
Malmö Diet and Cancer队列嵌套病例对照人群(302例CE病例与302例对照) 雌性Ldlr−/−小鼠(年轻2–5个月,年老18–22个月) 雌性Ldlr−/−Rag1−/−小鼠(2–3个月) 雌性Tcrα−/− Ldlr−/−小鼠(44–51周)
人类队列中ABCs计数按四分位分组,条件logistic回归比较第四分位与第一分位,并校正总胆固醇、HDL、收缩压、糖尿病和当前吸烟。 ABCs定义:人CD21lowCD27−CD24−;小鼠CD19+CD23−CD21lowCD11b+/CD11c+。 过继转移剂量为5 × 105 FACS分选ABCs或PBS,在T = 0和T = 4周静脉注射,WD喂养8周。 受体小鼠分组:Ldlr−/− n = 8/组;Ldlr−/−Rag1−/− n = 13–14/组。 scRNA-seq样本:CD喂养雌性Ldlr−/−小鼠年轻5个月(合并n = 7)和年老21个月(合并n = 8)。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证ABCs是否随年龄增加并与新发CE相关。
在Malmö Diet and Cancer队列嵌套病例对照研究中,用流式细胞术对604名个体基线PBMC进行B细胞表型分析,随访中位14年,CE病例与对照按年龄和性别1:1匹配,分析ABCs计数与CE关联。
验证ABCs是否在年老小鼠中积聚并具有独特转录和克隆特征。
对CD喂养雌性Ldlr−/−小鼠年轻(5个月)和年老(21个月)脾CD45+细胞进行scRNA-seq、Total-seq和BCR-seq,并用流式细胞术和免疫荧光验证ABCs。
验证ABCs是否直接促进动脉粥样硬化病变发展。
从年老雌性Ldlr−/−小鼠分选ABCs,过继转移至年轻雌性Ldlr−/−和Ldlr−/−Rag1−/−小鼠,WD喂养8周后评估主动脉根病变、胶原和坏死核心。
验证ABCs是否分化为PCs并分泌抗体。
分析转移后受体小鼠脾、BM和腹膜中B细胞表型,检测血清抗体;体外用IL-21、CD40L、CpG和/或anti-IgM刺激ABCs,检测PC分化和抗体分泌。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 流式分析 | 可固定活力染料-eFluor 780 | -- | -- |
| CD45-PE抗体 | -- | -- | |
| 单细胞测序 | 10x Chromium单细胞控制器 | 10x Genomics | -- |
| Next GEM单细胞5′试剂盒V2 | 10x Genomics | -- | |
| 单细胞V(D)J富集试剂盒,小鼠B细胞 | 10x Genomics | -- | |
| Illumina HiSeq2500测序仪 | Illumina | -- | |
| 细胞分选 | FACS Aria II SORP流式细胞分选仪 | BD Biosciences | -- |
| 抗体检测 | LEGENDplex多因子检测试剂盒 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人类病例对照研究 | 队列来源Malmö Diet and Cancer study;302例CE病例与302例对照按年龄和性别1:1匹配;中位随访14年;ABCs定义为CD21lowCD27−CD24−;回归模型校正总胆固醇、HDL、收缩压、糖尿病和当前吸烟。 阅读提示:Methods 2.1 Human cohort study design;Figure 2 legend;Table 1和Table 2。 |
| 小鼠ABCs过继转移 | 供体为18–21个月雌性Ldlr−/−小鼠;受体为2–3个月雌性Ldlr−/−(n = 8/组)或Ldlr−/−Rag1−/−(n = 13–14/组);剂量5 × 105 ABCs或PBS;静脉注射T = 0和T = 4周;WD喂养8周。 阅读提示:Methods 2.4 Adoptive transfer of ABCs;Figure 4 legend。 |
| 单细胞RNA和BCR测序 | CD喂养雌性Ldlr−/−小鼠;年轻5个月(合并n = 7),年老21个月(合并n = 8);脾CD45+活细胞分选;10x Genomics平台;Illumina HiSeq2500测序。 阅读提示:Methods 2.3 Single-cell RNA sequencing of CD45+ splenocytes;Figure 3 legend。 |
| 小鼠动脉粥样硬化病变评估 | 主动脉根横截面;Oil-Red-O和Masson三色染色;病变大小、胶原含量、坏死核心和血管闭塞定量;统计使用t检验、Mann–Whitney、ANOVA或Kruskal–Wallis。 阅读提示:Methods 2.5 Statistics;Figure 4 legend。 |