人iPSC兴奋性神经元模型建立与SORL1敲除
获得同基因型SORL1 KO和WT人兴奋性皮层神经元以研究SORL1功能。
使用CRISPR-Cas9在CV细胞系(GM2530, Coriell)中生成SORL1 KO克隆,并通过双SMAD抑制将hiPSC分化为兴奋性皮层神经元。
The Alzheimer's disease risk gene SORL1 is a regulator of excitatory neuronal function
使用SORL1 KO人iPSC兴奋性神经元,结合QMI蛋白质互作、免疫细胞化学、MEA电生理、cLTP及Aβ检测,体外多层级功能与机制验证。
SORL1敲除的人iPSC来源兴奋性皮层神经元 同基因型野生型人iPSC来源兴奋性皮层神经元 APPSwe+/+同基因型人iPSC神经元
SORL1 KO与同基因型WT对照相比,使用两个克隆/基因型,来自多次分化 QMI检测约400个突触蛋白二元相互作用,仅在CNA和ANC均显著时报告 免疫细胞化学分析突触前SYNAPSIN和突触后HOMER1及AMPA受体亚基GLUR1、GLUR2 MEA记录神经元放电和网络爆发活动,SORL1 KO与WT比较 谷氨酸受体拮抗剂NBQX 10 µM和APV 50 µM处理及洗脱,验证兴奋性传递驱动
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得同基因型SORL1 KO和WT人兴奋性皮层神经元以研究SORL1功能。
使用CRISPR-Cas9在CV细胞系(GM2530, Coriell)中生成SORL1 KO克隆,并通过双SMAD抑制将hiPSC分化为兴奋性皮层神经元。
检测SORL1缺失是否改变兴奋性突触蛋白相互作用网络。
在确认网络爆发后约DPP 35收集神经元裂解液,使用QMI分析约400个突触蛋白二元相互作用。
验证SORL1缺失是否改变突触结构和AMPA受体亚基表达。
在约DPP 30固定神经元,免疫染色HOMER1、SYNAPSIN1/2、GLUR1、GLUR2,并用共聚焦显微镜和Imaris进行三维定量。
评估SORL1缺失对自发放电和网络爆发活动的影响。
将分化神经元接种于Matrigel包被的MEA板,使用Axion Maestro Pro系统每周记录两次,持续约60天。
检验SORL1 KO过度兴奋是否依赖兴奋性谷氨酸能神经传递。
在网络爆发形成后,用NBQX和APV阻断AMPA和NMDA受体,或用gabazine阻断GABAA受体,记录基线和洗脱后活动。
研究SORL1缺失是否影响网络活动增强能力。
使用forskolin和rolipram诱导cLTP,记录诱导后4、24、48和72小时的MEA活动。
确定SORL1 KO神经元过度兴奋是否由分泌Aβ增加导致。
从48孔MEA培养板收集条件培养基,使用MSD V-PLEX ELISA测量Aβ1-40和Aβ1-42浓度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Matrigel基质胶 | -- | -- |
| Brainphys神经元培养基 | -- | -- | |
| QMI | NP40裂解缓冲液 | -- | -- |
| 蛋白酶/磷酸酶抑制剂混合物 | Sigma | -- | |
| 二辛可宁酸测定 | Pierce | -- | |
| Luminex微珠 | -- | -- | |
| 链霉亲和素-藻红蛋白 | -- | -- | |
| Bio-Plex 200 | -- | -- | |
| 免疫细胞化学 | 脑源性神经营养因子 | -- | -- |
| 胶质细胞系来源神经营养因子 | -- | -- | |
| 二丁酰环腺苷酸 | -- | -- | |
| 层粘连蛋白 | -- | -- | |
| MEA | MEA培养板 | Axion Biosystems | #M384-tMEA-6W and #M768-tMEA-48W |
| Maestro Pro系统 | Axion Biosystems | -- | |
| 受体拮抗剂实验 | NBQX | Tocris | 0373 |
| APV | Tocris | 0106 | |
| cLTP | 佛司可林 | LC Laboratories | F-9929 |
| 咯利普兰 | Tocris | 0905 | |
| Aβ检测 | MSD Aβ V-PLEX酶联免疫吸附测定 | MesoScale Discovery | #151200E-2 |
| scRNAseq | Accutase细胞解离液 | Innovative Cell Technologies | AT-104 |
| 40 µm细胞筛网 | Stellar Scientific | TC70-SWM-40 | |
| Parse Evercode WT v3 | Parse Biosciences | ECWT3300 | |
| Evercode细胞固定v3 | Parse Biosciences | ECFC3300 | |
| Qubit 4荧光计 | ThermoFisher | -- | |
| Agilent Tapestation | Agilent Technologies | -- | |
| Ultima UG100系统 | -- | -- | |
| 细胞培养 | MycoScope支原体检测 | AMS Bio | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| SORL1 KO人iPSC神经元模型 | 细胞系来源、基因编辑方法、分化方案、克隆数和分化批次 阅读提示:Methods 2.1 Human cell lines and CRISPR-Cas9 genome editing;2.2 Neuronal differentiation |
| QMI突触蛋白互作分析 | 裂解缓冲液组成、抗体-探针配对、技术重复数、ANC和CNA显著性阈值 阅读提示:Methods 2.3 Quantitative multiplex immunoprecipitation;Table S1;Supplementary Materials and Methods |
| 免疫细胞化学和共聚焦定量 | 接种密度、培养基补充因子、固定时间点、抗体信息、成像参数和Imaris分析流程 阅读提示:Methods 2.4 Immunocytochemistry;2.5 Confocal microscopy and image analysis;Supplementary Materials and Methods |
| MEA神经元活动记录 | MEA板型号、接种密度、记录频率、滤波参数、分析软件和混合效应模型设计 阅读提示:Methods 2.6 Multiple electrode array culture;2.7 MEA recordings and analysis;Supplementary Materials and Methods |
| 受体拮抗剂和cLTP处理 | 药物浓度、处理时间、洗脱流程、对照设置和记录时间点 阅读提示:Methods 2.8 Neurotransmitter receptor antagonist experiments;2.9 Chemical long-term potentiation |
| 分泌Aβ检测 | 条件培养基收集时间、ELISA试剂盒、技术重复数和归一化方式 阅读提示:Methods 2.10 Measurements of secreted Aβ1-40 and Aβ1-42 |