组织学形态学分析
评估AVF建立后静脉壁的形态学变化
对23例患者配对术前静脉和AVF样本进行组织学染色,测量内膜和中膜面积及细胞密度
The single-cell landscape of the human vein after arteriovenous fistula creation and implications for maturation failure
包含人静脉和AVF组织单细胞RNA测序、组织学、免疫荧光、原位杂交及原代细胞培养验证,多层级验证。
人术前静脉和AVF组织样本(20例scRNA-seq,23例免疫荧光验证) 人脐静脉内皮细胞(HUVEC) 人AVF原代成纤维细胞
单细胞RNA测序样本:术前静脉n=6,早期AVF n=2,二期AVF n=12(6例成熟,6例失败) 免疫荧光验证样本:23例患者纵向静脉和二期AVF样本(11例成熟,12例失败) HUVEC处理:IL-1β刺激、层流暴露、NF-κB抑制剂或p65 siRNA 原代人AVF成纤维细胞处理:IL-1β、TGF-β1、NF-κB和TGFβRI抑制剂 形态学定量:MYH11/SMA/DAPI共染色,ImageJ测量,Image-Pro v11.1细胞计数
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估AVF建立后静脉壁的形态学变化
对23例患者配对术前静脉和AVF样本进行组织学染色,测量内膜和中膜面积及细胞密度
验证AVF中不同细胞类型的密度变化
使用confocal IF检测SMC、肌成纤维细胞、成纤维细胞和巨噬细胞标志物
在单细胞分辨率解析AVF建立后静脉壁的细胞和转录组变化
对20例患者的术前静脉、早期AVF和二期AVF样本进行scRNA-seq,分析70,281个细胞
评估AVF建立后不同细胞类型的功能程序变化
使用基因特征评分分析细胞增殖、炎症、ECM沉积、粘附和迁移等程序
推断AVF建立后细胞间信号网络及其在成熟失败中的作用
使用CellChat v2分析细胞间配体-受体相互作用
验证炎症和血流刺激对内皮细胞和成纤维细胞表型的影响
HUVEC和原代AVF成纤维细胞分别接受IL-1β、TGF-β1、层流或抑制剂处理,检测基因表达
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 人脐静脉内皮细胞 | Lonza | -- |
| 形态学分析 | ImageJ | National Institutes of Health | -- |
| 细胞计数 | Image-Pro v11.1 | Media Cybernetics | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 10.1.1 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 单细胞RNA测序 | 样本分组:术前静脉n=6,早期AVF n=2,二期AVF n=12(6例成熟,6例失败);患者特征:CKD5或ESKD,年龄≥21岁 阅读提示:Methods: Study subjects and tissue collection;Supplementary Table S1 |
| 免疫荧光验证 | 验证样本:23例患者(11例成熟,12例失败);抗体类型和稀释比例:文中未明确说明 阅读提示:Methods: Morphometry, immunofluorescence, and in situ hybridization;Supplementary Table S2 |
| 原代细胞实验 | HUVEC来源:Lonza;刺激条件:IL-1β、TGF-β1、层流、抑制剂浓度和时间:文中未明确说明 阅读提示:Methods: Primary cell culture;Supplementary Methods;Supplementary Figure S19 |
| 细胞间通讯分析 | CellChat v2参数:文中未明确说明;输入数据:scRNA-seq数据 阅读提示:Methods: Single-cell RNA sequencing;Supplementary Methods |
| 组织学形态学 | 染色方法:MYH11/SMA/DAPI共染色;测量指标:内膜和中膜面积、细胞密度 阅读提示:Methods: Morphometry, immunofluorescence, and in situ hybridization;Figure 1 |