建立小鼠实验性牙周炎并评估MDL-800体内效果
验证MDL-800对牙周组织破坏和牙槽骨吸收的治疗作用。
采用结扎诱导小鼠牙周炎模型,给予MDL-800后通过micro-CT、H&E、Masson、TRAP和IL-1β IHC评估牙槽骨和牙周组织。
SIRT6 activator MDL-800 alleviates periodontal inflammation by inhibiting AIM2 pathway
含小鼠结扎牙周炎模型、HGFs体外LPS模型、siRNA与CRISPR敲除、RNA-seq、Western blot及功能验证
结扎诱导的小鼠实验性牙周炎模型 LPS刺激的人牙龈成纤维细胞(HGFs) SIRT6 siRNA/CRISPR敲除HGFs
小鼠牙周炎模型:8周龄雄性C57BL/6J小鼠,右侧下颌第一磨牙5-0缝线结扎,n=8,MDL-800 60 mg/kg灌胃,每2天1次,持续4周 Sirt6体内沉默:Sirt6 siRNA每侧注射0.05 nmol/g体重,每3天1次,共2周,n=5 HGFs体外炎症模型:E. coli LPS(O55:B5)1 μg/mL刺激,MDL-800浓度5–25 μmol/L AIM2炎症小体激活:LPS 1 μg/mL处理2 h后,poly(dA:dT) 1.5 μg/mL转染6 h SIRT6抑制对照:SIRT6抑制剂compound 11e 30 mg/kg,给药频率同MDL-800
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证MDL-800对牙周组织破坏和牙槽骨吸收的治疗作用。
采用结扎诱导小鼠牙周炎模型,给予MDL-800后通过micro-CT、H&E、Masson、TRAP和IL-1β IHC评估牙槽骨和牙周组织。
在体外模拟牙周炎症,验证MDL-800对促炎因子和ROS的影响。
使用E. coli LPS刺激HGFs,给予不同浓度MDL-800,通过CCK-8、RT-qPCR、ROS探针和ICC检测增殖、炎症因子、ROS及NRF2核转位。
明确MDL-800的抗炎作用是否依赖SIRT6。
在HGFs中使用SIRT6 siRNA和CRISPR/Cas9 RNP敲除SIRT6,检测炎症因子;在小鼠中使用Sirt6 siRNA和SIRT6抑制剂compound 11e验证体内效应。
筛选MDL-800抗炎作用的潜在下游通路。
对LPS和LPS+MDL-800处理的HGFs进行RNA-seq,分析差异表达基因、KEGG通路和PPI网络。
确认AIM2炎症小体是否为MDL-800抗炎作用的下游机制。
使用LPS和poly(dA:dT)激活AIM2炎症小体,通过Western blot和ELISA检测AIM2、pro IL-1β和IL-1β;并在体内检测AIM2表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 阿佛丁 | -- | -- |
| 细胞培养 | 青霉素/链霉素 | Gibco | -- |
| 1型胶原酶 | Biofroxx | -- | |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 炎症刺激 | 大肠杆菌脂多糖(O55:B5) | InvivoGen | -- |
| 细胞增殖检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Dojindo Laboratories | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| CRISPR/Cas9基因敲除 | 4D-Nucleofector™ X电转仪 | Lonza | -- |
| P3原代细胞核转染溶液 | Lonza | -- | |
| Nucleocuvette™电转条 | Lonza | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录 | 逆转录试剂盒 | TaKaRa Bio | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green混合液 | Bio-Rad | -- |
| LightCycler96®仪器 | Roche | -- | |
| RNA-seq | RNA Nano 6000检测试剂盒 | Agilent Technologies | -- |
| Bioanalyzer 2100系统 | Agilent Technologies | -- | |
| Illumina NovaSeq平台 | Illumina | -- | |
| ROS检测 | 荧光探针 | Beyotime | -- |
| DCFH-DA | Beyotime | -- | |
| 免疫细胞化学 | AlexaFluor-488 | -- | -- |
| DAPI | -- | -- | |
| AIM2炎症小体激活 | poly(dA:dT) | Invivogen | -- |
| Western blot | 蛋白提取试剂盒 | Signalway Antibody | PE001 |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 抗IL-1β兔多克隆抗体 | Abcam | ab205924 | |
| 抗AIM2兔多克隆抗体 | Boster | PB9683 | |
| 过氧化物酶偶联二抗 | Signalway Antibody | -- | |
| ELISA | ELISA试剂盒 | Multi Sciences | -- |
| TRAP染色 | TRAP染色试剂盒 | Sigma–Aldrich | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠实验性牙周炎模型建立与给药 | 小鼠品系、年龄、性别、结扎牙位、缝线规格、麻醉剂与剂量、分组、样本量、MDL-800剂量与给药频率、实验周期 阅读提示:Methods 2.1;Figure 1B |
| 体内Sirt6沉默验证 | Sirt6 siRNA序列、注射剂量0.05 nmol/g、注射部位、注射频率、分组、样本量、给药与取材时间 阅读提示:Methods 2.1;Figure 4D、4F–H |
| SIRT6抑制剂体内验证 | compound 11e剂量30 mg/kg、分组、样本量、给药频率、取材时间 阅读提示:Methods 2.1;Supporting information Fig. S2 |
| HGFs体外炎症模型与MDL-800处理 | HGFs来源与代次、LPS类型与浓度1 μg/mL、MDL-800浓度5–25 μmol/L、处理时间、重复数n=3 阅读提示:Methods 2.5、2.6、2.9;Figure 3 |
| SIRT6沉默和CRISPR敲除 | siRNA序列与浓度20 nmol/L、转染试剂与时间48 h、sgRNA序列、Cas9和sgRNA浓度、电转程序FF-120和CM-137、敲除后检测时间 阅读提示:Methods 2.7;Figure 4B |
| AIM2炎症小体激活与检测 | LPS 1 μg/mL处理2 h、poly(dA:dT) 1.5 μg/mL转染6 h、细胞密度5×10^5/孔、Western blot抗体稀释比1:1000、ELISA检测对象 阅读提示:Methods 2.11、2.12、2.13;Figure 6D、6E |
| RNA-seq与数据分析 | LPS/MDL-800处理条件、测序平台、参考基因组hg38、DEG阈值P<0.05且|log2FoldChange|>1、分析软件 阅读提示:Methods 2.8;Figure 5 |