B 细胞对肿瘤免疫的影响验证
明确总 B 细胞在肿瘤微环境和抗肿瘤 T 细胞应答中的作用。
使用 anti-CD20 抗体清除荷瘤小鼠 B 细胞,检测肿瘤浸润白细胞、T 细胞及 dLN/MLN 中效应分子表达。
CMTM6 maintains B cell-intrinsic membrane CD40 stability to regulate anti-tumor immunity
包含体外B细胞、A20细胞系、多种基因敲除小鼠模型、肿瘤移植模型、患者PBMC及公共组学数据等多层级证据,并进行功能与机制验证。
C57BL/6 与 BALB/c 小鼠 CT26、MC38、B16F10 皮下肿瘤模型 Cmtm6 全身敲除与 B 细胞条件性敲除(BKO)小鼠 小鼠 A20 B 淋巴瘤细胞与 HEK293T 细胞 人 PBMC B 细胞与肿瘤浸润 B 细胞单细胞测序数据
Cmtm6 KO 与 WT 小鼠中脾脏及淋巴结 B 细胞亚群比例、CD40 膜水平与 CD40 下游磷酸化 p65/p38 的检测 CD40 激动剂 FGK45 处理后的 B 细胞活化、增殖、存活与生发中心 B 细胞分化 B 细胞过继回输模型(WT、Cmtm6 KO、Cd40 KO、Cmtm6&Cd40 DKO)以验证 CD40 依赖性 CD40L 阻断抗体处理后的 T/B 细胞共培养与体内肿瘤模型中 GC B 细胞和 CD8+ T 细胞效应分子检测 A20 细胞中 CMTM6 KO 后 MG132、CLQ、CHX、ConA 处理下 CD40 膜水平及泛素化修饰分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确总 B 细胞在肿瘤微环境和抗肿瘤 T 细胞应答中的作用。
使用 anti-CD20 抗体清除荷瘤小鼠 B 细胞,检测肿瘤浸润白细胞、T 细胞及 dLN/MLN 中效应分子表达。
确定 CMTM6 在 B 细胞的表达并初步评估其对 B 细胞抗肿瘤功能的影响。
利用公共单细胞测序数据、流式细胞术及 RNA-seq 分析 CMTM6 表达;比较 WT 与 Cmtm6 KO 小鼠脾脏和肿瘤模型。
在 B 细胞特异性水平验证 CMTM6 对肿瘤进展和 T 细胞效应的影响。
构建 Cmtm6fl/flCd19cre+(BKO)小鼠,接种 B16F10 或 MC38 肿瘤,检测肿瘤生长、dLN T 细胞效应分子。
评估 CMTM6 缺失对 B 细胞促进 T 细胞活化和 B 细胞亚群分化的影响。
OT-II CD4+ T 细胞与 OVA 负载 B 细胞共培养,流式检测 T 细胞 CD69、CD25、Ki67;流式分析脾脏和淋巴结 B 细胞亚群。
确定 CMTM6 是否通过 CD40 信号影响 B 细胞活化、增殖、存活和分化。
使用五种 B 细胞激动剂筛选,重点检测 CD40 激动剂 FGK45 刺激后 B 细胞活化标志物、磷酸化 p65/p38、7-AAD 存活、CCK8 增殖及 GC B 细胞分化。
验证 CMTM6 与 CD40 的直接相互作用及其对 CD40 稳定性的调控机制。
Co-IP 检测小鼠脾细胞、A20 细胞及 HEK293T 过表达体系中的 CMTM6/CD40 互作;A20 细胞中 CMTM6 KO 后行 CD40 降解实验、CHX chase、泛素化 IP 及 E3 抑制剂处理;AlphaFold2 预测复合物结构并做丙氨酸突变扫描。
评估 B 细胞 CMTM6 对 CD40 激动剂和 PD-1 抑制剂抗肿瘤疗效的影响。
在 B16F10、MC38、CT26 模型中比较 B 细胞清除、Cmtm6 KO 或 BKO 对 anti-CD40 和 anti-PD-1 疗效的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM 培养基 | Meilunbio | -- |
| RPMI1640 培养基 | Meilunbio | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Invitrogen | -- | |
| 胎牛血清 | Life Technologies | -- | |
| B 细胞分离 | EasySep™ 小鼠 B 细胞分离试剂盒 | Stemcell | 19854 |
| B 细胞培养 | IL-2 | GenScript | Z02764 |
| IL-4 | MCE | HY-P70653 | |
| IL-21 | MCE | HY-P700199AF | |
| BAFF | MCE | HY-P700161AF | |
| B 细胞活化 | 脂多糖 | Merck | L6529 |
| 咪喹莫特 | MCE | HY-B0180 | |
| Agatolimod | MCE | HY-150218 | |
| 抗 IgM 抗体 | CST | 46315S | |
| FGK45 抗体 | BioXcell | BE0016-2 | |
| 细胞增殖 | CCK8 | Yeasen | 40203ES60 |
| 细胞存活 | 7-AAD | BD Pharmingen | 559925 |
| T/B 细胞共培养 | 小鼠 CD4+ T 细胞分离试剂盒 | Stemcell | 19852 |
| OVA323–329 肽 | MCE | HY-P0286 | |
| CD40L 阻断抗体 | BioXcell | BE0017 | |
| 转录因子缓冲液套装 | BD Pharmingen | 562725 | |
| 磷酸化蛋白检测 | Cytofix 固定缓冲液 | BD Pharmingen | 554655 |
| Perm Buffer III | BD Pharmingen | 558050 | |
| B 细胞清除 | 抗 CD20 抗体 | BioXcell | BE0356 |
| 免疫表型分析 | IV 型胶原酶 | Yeasen | 40510ES60 |
| 透明质酸酶 | Yeasen | 20426ES60 | |
| 抗 CD16/CD32 抗体 | BD Biosciences | 553141 | |
| BD Cytofix/Cytoperm 缓冲液 | BD | 554714 | |
| 免疫共沉淀 | Protein G 磁珠免疫沉淀试剂盒 | Beyotime | P2177S |
| 电转染 | Neon NxT 电转染系统 | Thermo Fisher | -- |
| 膜 CD40 降解实验 | MG132 | MCE | HY-13259 |
| 氯喹 | MCE | HY-17589 | |
| CHX chase 实验 | 刀豆球蛋白 A | MCE | HY-N1724 |
| 体内治疗研究 | 抗 PD-1 抗体 | BioXcell | BE0273 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| B 细胞清除与过继回输 | anti-CD20 给药时间与剂量:Day −2 和 Day 2 各 150 μg i.p.;过继回输时 Day −12 和 Day −10 各 150 μg;回输 B 细胞数量 6 × 106 每只,肿瘤体积约 100 mm3 时瘤周注射。 阅读提示:Methods 2.9 B cell depletion study、2.13 Adoptive transfusion of B cells 及 Fig. 1F–H 图注 |
| CD40 激动剂体外功能实验 | B 细胞接种数量、CD40 激动剂浓度(2、5、10、15 μg/mL)及处理时间(15 min、36 h、72 h);增殖实验使用 CCK8 于 0、36、72 h 检测 OD450。 阅读提示:Methods 2.4–2.6、2.8 及 Fig. 3、Fig. 4 图注 |
| T/B 细胞共培养 | B 细胞与 OT-II CD4+ T 细胞比例 0.5:1 和 2:1;OVA323–329 浓度 25 μg/mL 预处理 2 h;anti-CD40L 抗体 50 μg/mL;检测时间点 24 h(CD69/CD25)和 72 h(Ki67)。 阅读提示:Methods 2.7 T/B cells co-culture 及 Fig. 2E–G、Fig. 5A–B 图注 |
| CMTM6-CD40 相互作用与降解机制 | A20 细胞 CMTM6 KO 与 Cas9 对照;MG132、CLQ、ConA 均为 50 μmol/L,CHX 50 μg/mL;CD40 膜降解检测时间点 0、2、4、6 h;泛素化 IP 中 MG132 处理条件。 阅读提示:Methods 2.18–2.19 及 Fig. 6D–F 图注 |
| 体内肿瘤模型与 CD40 激动剂疗效 | 肿瘤细胞接种量 1 × 106 每只右侧前肢皮下;B16F10 模型 n = 8–10,MC38 模型 n = 8,CT26 模型 n = 8;anti-CD40 和 anti-PD-1 给药方式详见各图流程图。 阅读提示:Methods 2.10–2.11 及 Fig. 7A–G 图注 |