MSAD患者脑转录组和临床样本分析
鉴定MSAD患者脑内炎症和神经营养因子表达特征。
分析GSE48350中MSAD、年龄匹配对照和年轻对照的四个脑区转录组;检测临床队列血清Aβ40/Aβ42、炎症因子和神经营养因子。
Neutrophil-mediated BDNF delivery for the treatment of moderate to severe Alzheimer's disease
含患者转录组和血清样本、小鼠模型、体外BBB模型、3D脑类器官及体内行为与机制验证
18月龄雄性APP/PS1双转基因MSAD小鼠 MSAD患者脑组织转录组数据(GSE48350)及临床血清样本 人诱导多能干细胞来源3D脑类器官 bEnd.3与SH-SY5Y细胞系
MSAD小鼠静脉注射NE-LNP@BDNF剂量为1×10^6细胞/只,BDNF等效剂量0.25 mg/kg,每周1次连续4周 MSAD患者分组依据:MoCA≤13且CDR≥2 体外BBB模型以bEnd.3细胞跨膜电阻≥300 Ω cm2确认紧密连接成熟 NE-LNP@BDNF制备条件:NE与LNP@BDNF在37 ℃共孵育2 h,BDNF浓度75 μg/mL 行为学与病理终点:筑巢评分、NOR偏好指数、MWM目标象限时间和平台穿越次数、18F-AV45 PET/CT的SUVR
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定MSAD患者脑内炎症和神经营养因子表达特征。
分析GSE48350中MSAD、年龄匹配对照和年轻对照的四个脑区转录组;检测临床队列血清Aβ40/Aβ42、炎症因子和神经营养因子。
验证MSAD小鼠是否存在炎症因子升高和BDNF降低。
使用8月龄和18月龄雄性APP/PS1小鼠及年龄匹配野生型,进行筑巢、NOR和MWM行为测试,并用Luminex检测海马、前额叶皮质和血清细胞因子及神经营养因子。
构建并表征可被中性粒细胞摄取且保留炎症响应功能的BDNF递送系统。
微流控混合脂质与BDNF制备LNP@BDNF,与骨髓来源中性粒细胞共孵育形成NE-LNP@BDNF,检测粒径、表面电荷、包封率、摄取、活性和炎症响应。
评估炎症条件下NE-LNP@BDNF穿过血脑屏障和脑组织深部递送能力。
使用bEnd.3细胞Transwell构建体外BBB模型,并在hiPSC来源3D脑类器官中检测不同BDNF制剂的穿透深度。
验证NE-LNP@BDNF在MSAD小鼠脑内富集、改善认知、减少Aβ沉积并恢复机制通路。
18月龄雄性APP/PS1小鼠静脉注射不同制剂,进行活体/离体成像、行为学测试、PET/CT、RNA测序、免疫荧光和Western blot。
评估hNE-LNP@BDNF的神经毒性和NE-LNP@BDNF的全身安全性。
42天3D脑类器官重复给予hNE-LNP@BDNF后进行转录组分析;18月龄雄性C57BL/6小鼠每周静脉注射NE-LNP@BDNF连续4周,检测肝肾功能和组织病理。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 血清生物标志物检测 | Aβ40酶联免疫吸附测定试剂盒 | Novus Biologicals | NBP2-69909 |
| Aβ42酶联免疫吸附测定试剂盒 | Novus Biologicals | NBP2-69913 | |
| 人预混多分析物试剂盒 | R&D Systems | L151846 | |
| 中性粒细胞分离 | Percoll密度梯度介质 | Pharmacia | -- |
| 中性粒细胞纯度检测 | FITC标记抗小鼠Ly-6G/Ly-6C(Gr1)抗体 | -- | -- |
| PE标记抗小鼠MAIR-IV(CLM-5)抗体 | -- | -- | |
| LNP@BDNF制备 | 脑源性神经营养因子 | Absin | -- |
| LNP@BDNF表征 | BeNano 90 Zeta纳米粒度及Zeta电位分析仪 | Bettersize | -- |
| X射线光电子能谱仪 | Thermo Scientific | -- | |
| Bruker ARX 400 MHz核磁共振波谱仪 | Bruker | -- | |
| BDNF浓度测定 | BCA蛋白浓度测定试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| LNP形态观察 | JEM-1400透射电子显微镜 | JEOL | -- |
| 中性粒细胞形态染色 | 瑞氏-吉姆萨染液 | Sigma–Aldrich | -- |
| 中性粒细胞形态观察 | Olympus BX53显微镜 | Olympus | -- |
| 流式细胞分析 | BD Fortessa X20流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 活率检测 | FVS700活性染色剂 | BD Biosciences | -- |
| 炎症响应检测 | PE标记抗CD11b抗体 | BioLegend | -- |
| 超氧阴离子检测 | 二氢乙锭 | Beyotime | -- |
| 荧光检测 | Synergy H1酶标仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | -- | |
| 支原体检测 | MycoAlert PLUS支原体检测试剂盒 | Lonza | -- |
| 细胞活力检测 | Cell Counting Kit-8细胞活力检测试剂盒 | Dojindo Laboratories | CK04 |
| Aβ42神经毒性建模 | Aβ42寡聚体 | Merck | A9810 |
| 体外BBB模型构建 | Millicell ERS-2电阻仪 | Millipore | -- |
| 体外BBB穿透实验 | WKYMVm | Tocris | -- |
| 细胞计数 | Countess II FL自动细胞计数仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 活体荧光成像 | IVIS Lumina III成像系统 | PerkinElmer | -- |
| 人中性粒细胞分离 | 人中性粒细胞分离试剂盒 | STEMCELL Technologies | -- |
| 人中性粒细胞纯度检测 | APC标记抗CD16抗体 | -- | -- |
| FITC标记抗CD66b抗体 | -- | -- | |
| hiPSC培养 | mTeSR™1培养基 | STEMCELL Technologies | -- |
| Matrigel基质胶 | Corning | -- | |
| hiPSC传代 | ReLeSR™传代试剂 | STEMCELL Technologies | -- |
| 类器官诱导 | AggreWell™800培养板 | STEMCELL Technologies | -- |
| 类器官培养 | Accutase细胞解离液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 表皮生长因子 | PeproTech | -- | |
| 成纤维细胞生长因子2 | PeproTech | -- | |
| BDNF标记 | 异硫氰酸荧光素 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 高内涵成像 | 高内涵成像系统 | PerkinElmer | -- |
| 行为学追踪 | EthoVision 7.0行为追踪系统 | Noldus | -- |
| ANY-maze软件 | Stoelting | -- | |
| PET/CT成像 | 小动物PET/CT系统 | Mediso | -- |
| RNA提取和建库 | NEBNext Ultra RNA文库构建试剂盒 | -- | -- |
| RNA测序 | Illumina NovaSeq 6000测序平台 | Illumina | -- |
| 冰冻切片 | Leica CM1950冰冻切片机 | Leica Microsystems | -- |
| 免疫荧光成像 | Leica SP8共聚焦显微镜 | Leica Microsystems | -- |
| 蛋白提取 | 总蛋白提取试剂盒 | Solarbio | BC3710 |
| 蛋白浓度测定 | Bradford试剂 | Vazyme | E211-01 |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | IPVH00010或ISEQ00010 |
| Western ECL底物 | Millipore | WBKLS0500 | |
| 肝肾功能检测 | 肝肾功能标志物检测试剂盒 | Sigma–Aldrich | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| MSAD患者分类与样本采集 | MSAD分类阈值:教育校正MoCA≤13且CDR≥2;血清采集后2 h内处理,3000×g、15 min、4 ℃离心,−80 ℃保存。 阅读提示:参见Materials and methods 2.2 Clinical data and biospecimen collection in MSAD patients及Figure 2D图注。 |
| LNP@BDNF和NE-LNP@BDNF制备 | 脂质摩尔比HSPC:DSPE-PEG2000:DOPE:胆固醇=5:2:2:1;微流控体积比3:1;NE与LNP@BDNF孵育浓度75 μg/mL、37 ℃、2 h。 阅读提示:参见Materials and methods 2.6 Preparation and characterization of LNP@BDNF和2.7 Preparation and characterization of NE-LNP@BDNF。 |
| 体外BBB穿透实验 | bEnd.3细胞1×10^5细胞/孔,培养7天,TEER≥300 Ω cm2;WKYMVm 10 nmol/L;NE-LNP@FITC-BDNF为1×10^5细胞,BDNF等效剂量;孵育3 h。 阅读提示:参见Materials and methods 2.12 BBB penetration及Figure 4B、4C图注。 |
| MSAD小鼠体内治疗实验 | 18月龄雄性APP/PS1小鼠;NE-LNP@BDNF剂量1×10^6细胞/只,BDNF等效0.25 mg/kg,100 μL;每周静脉注射1次连续4周;对照组包括Saline、NE-LNP、BDNF、LNP@BDNF。 阅读提示:参见Materials and methods 2.17 Animal grouping and interventions及Figure 5A图注。 |
| 行为学与Aβ沉积评估 | 行为学包括筑巢评分、NOR偏好指数、MWM探针试验目标象限时间和平台穿越次数;PET/CT使用18F-AV45 6.5–7.5 MBq/只,以小脑为参考区计算SUVR;行为学每组n=10。 阅读提示:参见Materials and methods 2.18 Behavioral tests、2.19 PET/CT imaging of cerebral Aβ deposition及Figure 5B–5F图注。 |
| 3D脑类器官神经毒性评估 | 42天脑类器官,每4天给予hNE-LNP@BDNF 1次共4次,剂量1×10^5细胞/类器官,BDNF等效0.75 μg/mL;对照为Saline。 阅读提示:参见Materials and methods 2.20 Genome-wide RNA-sequencing及3.6 Neurotoxicity and systemic biosafety of engineered NE。 |