建立MPXV Ib支鼻内感染BALB/c小鼠模型并确定致病剂量
确认Ib支在BALB/c小鼠中的感染性和致死剂量范围
以经验剂量2×10⁵ PFU鼻内感染,随后进行梯度剂量(2×10⁴、5×10⁴、1×10⁵ PFU)感染,每日监测体重和生存,计算LD50;并与IIb支(2×10⁵、5×10⁵、1×10⁶ PFU)比较
Differential pathogenesis and antiviral treatment outcomes of MPXV clade Ib and clade IIb in a BALB/c mouse model
含体外细胞系、BALB/c小鼠体内感染模型、单细胞转录组、ELISA及抗病毒药物评价,并具功能验证。
雌性BALB/c小鼠鼻内感染模型 A549人肺上皮细胞 MRC-5人肺成纤维细胞 Vero非洲绿猴肾上皮细胞
MPXV Ib支与IIb支鼻内接种剂量:Ib支2×10⁴、5×10⁴、1×10⁵ PFU;IIb支2×10⁵、5×10⁵、1×10⁶ PFU,每组n=6 抗病毒治疗自1 dpi开始,tecovirimat 20 mg/kg每日口服灌胃,cidofovir 10或30 mg/kg每日腹腔注射,连续6天,n=5 肺组织病毒载量:Ib支于5 dpi、IIb支于7 dpi采集;鼻甲、气管、肺于1、3、5 dpi采集,n=4 单细胞RNA测序:Ib支1×10⁵ PFU、IIb支1×10⁶ PFU感染,5 dpi采集肺组织,n=3 细胞因子ELISA:1、3、5 dpi采集肺组织,每个时间点每组3只小鼠
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认Ib支在BALB/c小鼠中的感染性和致死剂量范围
以经验剂量2×10⁵ PFU鼻内感染,随后进行梯度剂量(2×10⁴、5×10⁴、1×10⁵ PFU)感染,每日监测体重和生存,计算LD50;并与IIb支(2×10⁵、5×10⁵、1×10⁶ PFU)比较
评估两支在肺部的复制动态和组织损伤差异
在致死剂量感染后于1、3、5 dpi采集肺组织,用蚀斑试验检测感染性病毒、qPCR检测基因组拷贝,并进行H&E染色和IHC检测A29抗原;Ib支于5 dpi、IIb支于7 dpi另检测肺病毒滴度
确定病毒在呼吸道组织的分布及是否存在残留接种物
采集鼻甲、气管、肺及口咽拭子,qPCR检测病毒DNA,蚀斑试验检测感染性病毒;在中等剂量感染下于1、3、5、7、14 dpi检测呼吸道组织
确定小鼠肺内高病毒载量是否可在体外肺来源细胞中重现
在A549和MRC-5细胞中进行一步生长(MOI=5,48 hpi)和多步生长(MOI=0.05,0、24、48 hpi)曲线分析,分别定量细胞相关病毒和细胞外病毒
比较Ib支与IIb支感染后肺部免疫细胞组成和病毒阳性细胞分布差异
在5 dpi采集肺组织制备单细胞悬液,使用GEXSCOPE™ Single-Cell RNA Library Kit建库,Illumina HiSeq X测序,Seurat v5分析,检测MPXV mRNA阳性细胞
评估两支感染后肺部炎症介质表达的差异
在1、3、5 dpi采集肺组织,ELISA检测IFN-α、TNF-α、IL-10、IL-6、CXCL1、CCL2蛋白水平;qRT-PCR检测IFN-α2、IFN-β、TNF-α、IL-6、IL-10转录水平
确定两种药物对Ib支和IIb支的体外抑制浓度
Vero细胞感染MPXV(MOI=0.1),加入系列稀释的cidofovir或tecovirimat,72 hpi收集上清qPCR定量细胞外MPXV DNA,计算IC50
比较两种药物在Ib支和IIb支致死感染模型中的保护效果
感染后1 dpi开始给药,tecovirimat 20 mg/kg每日口服灌胃,cidofovir 10或30 mg/kg每日腹腔注射,连续6天,监测体重和生存,7 dpi检测肺病毒载量和病理
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Dulbecco改良Eagle培养基 | -- | -- |
| 最低必需培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| HEPES | -- | -- | |
| 非必需氨基酸 | -- | -- | |
| 动物麻醉 | 三溴乙醇 | -- | -- |
| 病毒DNA提取 | Smart 32自动化核酸提取系统 | Daan Gene | -- |
| 达安基因核酸提取试剂盒 | Daan Gene | -- | |
| qPCR | TransScript®探针一步法qRT-PCR SuperMix | TransGen Biotech | -- |
| 组织病理学 | H&E染色试剂盒 | Servicebio | -- |
| 免疫组织化学 | 兔多克隆抗痘苗病毒一抗 | Abcam | ab35219 |
| IHC试剂盒D | Servicebio | -- | |
| Western blot | 抗VACV A27抗体 | -- | -- |
| 抗β-actin抗体 | -- | -- | |
| RIPA裂解液 | -- | -- | |
| Bio-Rad ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 单细胞悬液制备 | Hank平衡盐溶液 | -- | -- |
| GEXSCOPE™组织解离液 | -- | -- | |
| GEXSCOPE™红细胞裂解液 | -- | -- | |
| 单细胞RNA测序 | GEXSCOPE™单细胞RNA文库试剂盒 | -- | -- |
| Illumina HiSeq X测序平台 | Illumina | -- | |
| ELISA | IFN-α ELISA试剂盒 | Cloud-Clone Corp. | SEA033Mu |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Lianke Biotech | EK282HS | |
| IL-10 ELISA试剂盒 | Cloud-Clone Corp. | SEA056Mu | |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Cloud-Clone Corp. | SEA079Mu | |
| CXCL1 ELISA试剂盒 | Cloud-Clone Corp. | SEA041Mu | |
| CCL2 ELISA试剂盒 | Invitrogen | 88-7391 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Servicebio | G2026 | |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | Solarbio | -- |
| HiScript II一步法qRT-PCR SYBR Green试剂盒 | Vazyme | Q221-01 | |
| 病理图像采集 | 光学显微镜 | Olympus | -- |
| 病理图像分析 | Slide Viewer软件 | -- | -- |
| 免疫组化扫描 | 3DHISTECH扫描系统 | 3DHISTECH | -- |
| 免疫组化定量分析 | AIpathwell软件 | Servicebio | -- |
| 数据分析 | GraphPad Prism 10.4版 | GraphPad Software | -- |
| qRT-PCR数据分析 | CFX Maestro 2.3软件 | Bio-Rad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| MPXV Ib支和IIb支鼻内感染BALB/c小鼠剂量-反应实验 | 小鼠品系、性别和年龄:雌性BALB/c小鼠6–8周龄;接种剂量:Ib支2×10⁴、5×10⁴、1×10⁵ PFU,IIb支2×10⁵、5×10⁵、1×10⁶ PFU;每组n=6;接种体积50 μL;麻醉剂1.25% tribromoethanol 0.2 mL/10 g;终点标准体重下降>30% 阅读提示:查阅Materials and methods中Experimental design小节及Figure 1图注 |
| 抗病毒治疗体内评价 | 感染剂量:Ib支1×10⁵ PFU,IIb支1×10⁶ PFU;治疗起始时间1 dpi;tecovirimat 20 mg/kg每日口服灌胃,cidofovir 10或30 mg/kg每日腹腔注射;给药体积200 μL;治疗持续6天;每组n=5;终点为7 dpi或体重下降>30% 阅读提示:查阅Materials and methods中Assessment of the antiviral efficacy of cidofovir and tecovirimat against MPXV小节及Figure 4图注 |
| 肺组织病毒载量和病理检测 | 感染剂量:Ib支1×10⁵ PFU,IIb支1×10⁶ PFU;检测时间点:Ib支于5 dpi、IIb支于7 dpi;样本量n=4;检测方法:蚀斑试验和qPCR;H&E染色和IHC使用Abcam ab35219 1:200 阅读提示:查阅Materials and methods中Virus titration from organs and swab samples、Quantification of viral DNA及Histopathology and Immunohistochemistry小节,Figure 1e–f、Figure 2图注 |
| 单细胞RNA测序 | 感染剂量:Ib支1×10⁵ PFU n=3,IIb支1×10⁶ PFU n=3;采样时间5 dpi;肺组织不合并;GEXSCOPE™组织解离液37°C消化15 min;测序平台Illumina HiSeq X,150 bp双端;数据分析使用Seurat v5,质控标准为少于200个基因或线粒体 reads>10%的细胞被去除 阅读提示:查阅Materials and methods中Single-cell suspension preparation、Single-cell RNA library construction and sequencing及Single-cell RNA-seq data processing and analysis小节,Figure 3图注 |
| 细胞因子和趋化因子检测 | ELISA:每组每时间点n=3,检测时间点1、3、5 dpi,检测指标IFN-α、TNF-α、IL-10、IL-6、CXCL1、CCL2;qRT-PCR:致死剂量Ib支1×10⁵ PFU、IIb支1×10⁶ PFU,非致死剂量Ib支5×10⁴ PFU、IIb支5×10⁵ PFU,每组每时间点n=3 阅读提示:查阅Materials and methods中ELISA和Cytokine profile小节及Figure 3f、Figure S8图注 |