中性粒细胞选择性消融
验证中性粒细胞在脊髓再生中的作用。
使用mpx:NTR-mCherry; mpx:gfp幼体,损伤前8 h预孵育MTZ消融中性粒细胞,在损伤后不同时间点计数损伤部位中性粒细胞。
A reparative neutrophil subpopulation accelerates spinal cord regeneration in zebrafish by controlling macrophage inflammation via Il-4
包含中性粒细胞消融、il4突变、il4过表达及il1b干预等多层功能与机制验证,结合在体成像、行为学与转录分析。
幼体斑马鱼(3 dpf脊髓完全横断模型) mpx:NTR-mCherry; mpx:gfp中性粒细胞报告与消融品系 il4umc18/umc18生殖系突变体 mpeg1:mCherry巨噬细胞报告品系
中性粒细胞消融:mpx:NTR-mCherry幼体于损伤前8 h预孵育Metronidazole 5 mM,DMSO为对照 il4功能缺失:il4umc18/umc18生殖系突变体及体细胞CRISPR突变体,靶向il4第4外显子 Il-1β处理抑制:Ac-YVAD-cmk 10、25、50 µM,DMSO终浓度1%,用于挽救轴突桥厚度 il4过表达:热休克诱导pTol-hsp70l:il4-T2a:mCherry质粒,损伤前2 h 38 °C热休克30 min 轴突再生评估:抗乙酰化微管蛋白标记,于24和48 hpl测量轴突桥最窄处厚度,至少三次独立实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证中性粒细胞在脊髓再生中的作用。
使用mpx:NTR-mCherry; mpx:gfp幼体,损伤前8 h预孵育MTZ消融中性粒细胞,在损伤后不同时间点计数损伤部位中性粒细胞。
检测中性粒细胞消融对轴突桥形成、再生性神经发生和游泳行为的影响。
在24和48 hpl测量抗乙酰化微管蛋白标记的轴突桥厚度;用EdU标记mnx1:gfp运动神经元;用振动刺激后游泳距离评估行为恢复。
确定中性粒细胞消融后损伤部位细胞因子环境变化。
通过qRT-PCR检测损伤部位富集组织中il1b、tnfa、tgfb1a、tgfb3表达;通过HCR检测il1b与mpeg1.1或mpx共表达。
验证中性粒细胞消融后il1b表达升高是否导致再生延迟。
使用caspase-1抑制剂YVAD降低Il-1β加工,或注射il1b CRISPR gRNA体细胞突变,检测轴突桥厚度和il1b表达。
验证il4对脊髓再生的必要性和充分性。
使用il4体细胞突变体和il4umc18/umc18生殖系突变体检测轴突再生和游泳行为;通过热休克诱导il4过表达挽救中性粒细胞消融后的再生缺陷。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 脊髓损伤手术 | MS-222 | Sigma-Aldrich | A5040 |
| 30G x ½″注射针 | Becton Dickinson | 613–3942 | |
| CRISPR/Cas9注射 | Tracer | Merck KGaA | TRACRRNA05N |
| Cas9 | New England Biolabs | M0386M | |
| 酚红 | Sigma-Aldrich | P0290 | |
| HCR-FISH | 甲醇 | Carl Roth | 4627.1 |
| 蛋白酶K | Roche Diagnostics GmbH | 3115828001 | |
| DAPI | Sigma-Aldrich | D9564 | |
| 甘油 | Carl Roth | 3783.1 | |
| EdU与运动神经元标记 | Click-iT™ Plus EdU细胞增殖试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | C10640 |
| 鸡抗GFP抗体 | Abcam | Ab13970 | |
| Alexa Fluor® 488驴抗鸡IgY | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 703-545-155 | |
| 免疫组化 | 兔多克隆抗Mfap4抗体 | GeneTex | GTX132692 |
| 兔多克隆抗Mpx抗体 | GeneTex | GTX128379 | |
| 小鼠单克隆抗乙酰化微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | T6793 | |
| qRT-PCR | Direct-zol RNA微量提取试剂盒 | Zymo Research | R2060 |
| Transcriptor高保真cDNA合成试剂盒 | Sigma-Aldrich | 5091284001 | |
| FastStart通用SYBR Green预混液 | Sigma-Aldrich | 4913914001 | |
| 吖啶橙标记 | 吖啶橙 | Sigma-Aldrich | A6014 |
| 药物处理 | Ac-YVAD-cmk | Sigma-Aldrich | SML0429 |
| 二亚苯基碘鎓氯化物 | Sigma-Aldrich | D2926 | |
| 中性粒细胞消融 | 甲硝唑 | MedChemExpress | HY-B0318 |
| 低熔点琼脂糖包埋 | 低熔点琼脂糖 | Carl Roth | 6351.1 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 中性粒细胞消融 | MTZ浓度5 mM,损伤前8 h预孵育;DMSO对照;消融效率验证:mCherry与吖啶橙共标记89.7%,Mpx抗体确认中性粒细胞减少 阅读提示:Methods中Drug treatment and heat shock;Fig. 1A-C;Suppl. Figure 1 |
| 脊髓损伤模型 | 3 dpf幼体,30G针在尿生殖孔水平完全横断脊髓,不损伤脊索;仅完全横断且脊索完整者纳入 阅读提示:Methods中Spinal cord lesion |
| 轴突再生评估 | 抗乙酰化微管蛋白标记,测量轴突桥最窄处厚度;24和48 hpl;至少三次独立实验 阅读提示:Methods中Measurement of axonal regrowth;Fig. 1E-F |
| YVAD挽救实验 | YVAD浓度10、25、50 µM;10 µM可挽救轴突桥厚度;DMSO终浓度1%;24 hpl检测 阅读提示:Methods中Drug treatment and heat shock;Fig. 3A-C;Fig. 5I |
| il4过表达 | pTol-hsp70l:il4-T2a:mCherry质粒注射;损伤前2 h 38 °C热休克30 min;qRT-PCR验证il4过表达约100倍 阅读提示:Methods中Generation of heat shock plasmid and treatment;Suppl. Figure 13 |