HIF1A+CSF3R+中性粒细胞主导的缺氧生态位诱导代谢重编程导致NSCLC新辅助治疗耐药

HIF1A+CSF3R+ neutrophils-dominated hypoxic niche induced metabolic reprogramming for neoadjuvant therapy resistance in NSCLC

作者信息Yaoyao Zhou, Ziyun Liu, Parhat Kaysar, Yuxi Han, Yijian Ma, Xiaozhou Yu, Bo Ni, Zuoyu Chen, Yongjie Xie, Haoling Zhang, Yueguo Li
PMID42711068
发布时间2026-09-08
DOI10.1136/jitc-2026-014772

实验完整度

包含患者空间/单细胞转录组、体外细胞实验、TCR测序、小鼠皮下及原位肿瘤模型和CSF3R条件敲除验证

主要模型

NSCLC患者肿瘤组织及外周血样本 LA-795、LLC、CMT167细胞系 T739和C57BL/6小鼠皮下及原位肿瘤模型 csf3rfl/fl × Ly6G-cre条件敲除小鼠

重点核对

HIF1A+CSF3R+中性粒细胞在无应答患者中的比例及其与缺氧评分的相关性 HIF1A+中性粒细胞糖酵解相关酶基因表达、ECAR及乳酸分泌水平 HIF1A+中性粒细胞衰老相关蛋白p16、p21、Bcl-2、PD-L1的表达 联合治疗中navitoclax 50 mg/kg/day p.o.、platycodin-D2 10 mg/kg/day p.o.、anti-PD-1 12.5 mg/kg/week i.p.的剂量与给药方式 CSF3R通过JAK1-STAT3轴调控HIF1A表达的验证

摘要

背景:非小细胞肺癌(NSCLC)是一种常见的恶性肿瘤,具有分子异质性和多种免疫细胞浸润模式,与治疗敏感性和耐药性相关。然而,导致患者治疗耐药的具体微环境细胞及其机制仍需深入探索。方法:基于本中心接受新辅助治疗的患者,纳入多中心、多队列NSCLC空间转录组、单细胞转录组、T细胞受体库测序、bulk RNA转录组、磷酸化蛋白质组、基因组突变和临床数据,综合评估HIF1A+ CSF3R+中性粒细胞在NSCLC中的治疗和预后影响。体外实验验证了HIF1A+ CSF3R+中性粒细胞的功能表型及其与其他细胞亚群的共定位相互作用。梯度提升机(GBM)构建感兴趣区域(ROI)模型进行评估。计算机辅助药物设计(CADD)用于预测靶向小分子药物,并构建体内小鼠模型评估联合治疗方案的有效性。结果:以HIF1A+ CSF3R+中性粒细胞为中心,募集的耗竭T细胞和基质细胞在肿瘤区域内形成缺氧生态位,该生态位在无应答患者中富集。由这些特定细胞亚群组成的ROI,与衰老和糖酵解相关,能够准确预测NSCLC进展、预后和微环境组成。CADD分析发现,platycodin-D2特异性靶向CSF3R,降低HIF1A表达并抑制中性粒细胞活性。将navitoclax、platycodin-D2与抗程序性细胞死亡蛋白1(PD-1)联合使用可显著抑制肿瘤增殖并改善免疫抑制微环境。结论:我们的研究强调了HIF1A+ CSF3R+中性粒细胞在NSCLC免疫治疗耐药中的作用,构建了以HIF1A+ CSF3R+中性粒细胞为中心的缺氧生态位中的微环境免疫失调网络。Platycodin-D2特异性靶向HIF1A+ CSF3R+中性粒细胞,增强NSCLC中抗PD-1治疗的疗效。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
NSCLC中新辅助治疗耐药相关的关键微环境细胞亚群及其调控机制是什么。
核心机制
HIF1A+CSF3R+中性粒细胞在肿瘤缺氧生态位中通过糖酵解代谢重编程诱导衰老表型,上调PD-L1和VEGF信号通路,促进T细胞耗竭和新生血管形成,导致免疫抑制微环境和治疗耐药。
主要证据
多中心单细胞/空间转录组显示HIF1A+CSF3R+中性粒细胞在无应答患者中富集并与缺氧评分正相关;体外实验证实其糖酵解活性升高、乳酸分泌增加及衰老相关蛋白高表达;TCR测序和共培养实验表明其促进CD8+Tex和CD4+Tex克隆扩增及CAF浸润;小鼠体内实验显示联合navitoclax、platycodin-D2和anti-PD-1可抑制肿瘤生长并改善免疫微环境。
研究意义
本研究揭示了以HIF1A+CSF3R+中性粒细胞为中心的NSCLC免疫治疗耐药新机制,为治疗反应预测、生物标志物开发和精准联合治疗提供了新思路。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

临床样本采集与多组学测序

探究NSCLC新辅助治疗耐药患者的微环境特征。

收集本中心接受抗PD-1治疗的患者样本,进行空间转录组测序、单细胞RNA测序和bulk RNA测序,并整合多中心公共数据集。

2

空间生态位与细胞亚群分析

鉴定与治疗耐药相关的空间生态位和关键细胞亚群。

使用ISCHIA进行生态位分析,RCTD解卷积注释空间转录组,CellChat分析细胞通讯,TCR测序分析T细胞克隆动态。

3

HIF1A+CSF3R+中性粒细胞功能验证

验证HIF1A+CSF3R+中性粒细胞的代谢和功能表型。

分离患者外周血中性粒细胞,进行ECAR测定、乳酸检测、Western blot检测糖酵解和衰老相关蛋白;与CAF共培养评估基质重塑。

4

体内联合治疗评估

评估靶向HIF1A+CSF3R+中性粒细胞的联合治疗方案效果。

构建小鼠皮下和原位肿瘤模型,给予navitoclax、platycodin-D2和anti-PD-1联合治疗,监测肿瘤生长、免疫细胞浸润和毒性。

5

药物预测与机制验证

预测靶向HIF1A+CSF3R+中性粒细胞的小分子药物并验证机制。

使用Beyondcell和cMAP进行药物敏感性分析,CADD分子对接预测platycodin-D2靶向CSF3R,SPR验证结合,构建CSF3R条件敲除小鼠验证机制。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
多重试剂盒Akoya BiosciencesNEL871001KT
RPMI 1640培养基Gibco11875093
DMEM培养基GibcoC11995500BT
胎牛血清GibcoA5670701
青霉素/链霉素Gibco15140122
人中性粒细胞分离试剂盒Miltenyi Biotec130-104-434
I型胶原酶Gibco17100017
透明质酸酶Sigma-Aldrich--
高糖DMEMGibco11965092
Matrigel基底膜基质Corning354234
自动血液分析仪MindrayBC-5000 Vet
全自动生化分析仪Beckman CoulterAU480
TUNEL检测试剂盒BeyotimeC1091
台盼蓝Gibco15250061

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
患者样本与分组
治疗有效定义为病理缓解和主要病理缓解,无效定义为疾病稳定和疾病进展;HIF1A高/低表达分组依据中位数
阅读提示:Results第一段及Figure 1图注
中性粒细胞分离与培养
使用Human Neutrophil Isolation Kit阴性选择,纯度>90%;培养于RPMI 1640+10% FBS+1% Pen-Strep,37°C,5% CO2
阅读提示:Methods中Isolation of PBMCs and neutrophil enrichment小节
ECAR测定
细胞接种密度1×10⁵/孔,葡萄糖10mM、寡霉素1µM、2-DG 50mM依次注射
阅读提示:Methods中Seahorse XF analysis小节
小鼠体内治疗实验
皮下接种1×10⁶ LLC或LA-795细胞,每组6只;navitoclax 50 mg/kg/day p.o.;platycodin-D2 10 mg/kg/day p.o.;anti-PD-1 12.5 mg/kg/week i.p.,治疗1周后给药
阅读提示:Methods中Subcutaneous tumor implantation小节及Figure 7图注
分子对接
对接网格尺寸30×30×30 Å,使用MOE 2020和AutoDock Vina,化合物库来自ZINC数据库
阅读提示:Methods中Computer-aided drug design小节