B-RAF抑制剂在角质形成细胞中激活ERK
验证B-RAF抑制剂是否反常激活ERK
NHEK处理dabrafenib或vemurafenib±trametinib,Western blot检测pERK;ERK-KTR生物传感器活细胞成像。
ERK hyperactivation in epidermal keratinocytes impairs intercellular adhesion and drives Grover disease pathology
包含NHEK体外模型、器官型表皮、患者活检多个证据层级,并有ERK机制验证及MEK抑制功能挽救实验。
正常人表皮角质形成细胞(NHEK) 器官型人类表皮筏培养 vemurafenib诱导Grover病患者皮肤活检 自发性Grover病患者皮肤活检
NHEK中dabrafenib(1 μM)或vemurafenib(10 μM)±trametinib(1 μM)处理24小时,Western blot检测pERK ERK-KTR-mClover生物传感器转导NHEK,1.2 mM钙条件下处理24小时,计算细胞质/核荧光比值 NHEK单层机械解离实验,dabrafenib(1 μM)、vemurafenib(10 μM)、trametinib(1 μM)处理24小时,dispase处理后倒置10次计数碎片 器官型表皮培养8–12天,vemurafenib(10 μM)处理48小时,免疫染色DSG1、PG、pERK 患者皮肤活检(vemurafenib诱导GD n=5,自发性GD n=17)免疫染色pERK和PG
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证B-RAF抑制剂是否反常激活ERK
NHEK处理dabrafenib或vemurafenib±trametinib,Western blot检测pERK;ERK-KTR生物传感器活细胞成像。
验证ERK激活是否损害细胞间黏附蛋白定位
NHEK处理B-RAF抑制剂±trametinib,免疫荧光染色DSG3和PG,共聚焦显微镜观察及线扫描分析。
验证MEK抑制能否恢复B-RAF抑制剂削弱的细胞黏附
NHEK单层处理B-RAF抑制剂±MEK抑制剂(trametinib、U0126、PD98059、cobimetinib),机械解离实验计数碎片。
在3D人类表皮组织中验证B-RAF抑制剂对细胞间连接和ERK的影响
器官型表皮培养成熟后,vemurafenib处理48小时,免疫染色DSG1、PG、pERK。
在Grover病患者皮肤活检中验证ERK过度激活和桥粒破坏
vemurafenib诱导GD(n=5)和自发性GD(n=17)患者活检,免疫染色pERK、DSG1、PG。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 曲美替尼 | Cell Signaling Technology | 62206 |
| U0126 | Cell Signaling Technology | 9903 | |
| PD98059 | Cell Signaling Technology | 9900 | |
| PD184352 | Cell Signaling Technology | 12147 | |
| 达拉非尼 | Cell Signaling Technology | 91942 | |
| 维莫非尼 | Cell Signaling Technology | 17531 | |
| Western blot | 磷酸化ERK1/2 (D13.14.4E) | Cell Signaling Technology | 4370 |
| 泛钙黏蛋白 | Cell Signaling Technology | 4068 | |
| 斑珠蛋白 | Cell Signaling Technology | 75550 | |
| ERK1/2 (L34F12) | Cell Signaling Technology | 4696 | |
| 角蛋白10 | Abcam | ab76318 | |
| 桥粒芯蛋白1 | Santa Cruz Biotechnologies | sc-137164 | |
| 桥粒芯蛋白2 | Santa Cruz Biotechnologies | sc-80663 | |
| 桥粒芯蛋白3 | Santa Cruz Biotechnologies | sc-53487 | |
| 斑珠蛋白 | Santa Cruz Biotechnologies | sc-514115 | |
| GAPDH | Santa Cruz Biotechnologies | sc-47724 | |
| β-肌动蛋白 (C4) | Santa Cruz Biotechnologies | sc-47778 | |
| MEK1/2 (L38C12) | Cell Signaling Technology | 4694 | |
| GAPDH (D16H11) | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| 鸡抗PG (no. 1408) | gift from Kathleen Green | -- | |
| IRDye 800CW山羊抗兔IgG | LI-COR Biosciences | 926-32211 | |
| IRDye 680RD山羊抗鼠IgG | LI-COR Biosciences | 926-68070 | |
| 免疫荧光 | 山羊抗鼠IgG AlexaFluor-405 | Thermo Fisher Scientific | A31553 |
| 山羊抗鼠IgG AlexaFluor-488 | Thermo Fisher Scientific | A11001 | |
| 山羊抗鼠IgG AlexaFluor-594 | Thermo Fisher Scientific | A11005 | |
| 山羊抗鼠IgG AlexaFluor-633 | Thermo Fisher Scientific | A21050 | |
| 山羊抗兔IgG AlexaFluor-405 | Thermo Fisher Scientific | A31556 | |
| 山羊抗兔IgG AlexaFluor-488 | Thermo Fisher Scientific | A11008 | |
| 山羊抗兔IgG AlexaFluor-594 | Thermo Fisher Scientific | A11012 | |
| 山羊抗兔IgG AlexaFluor-633 | Thermo Fisher Scientific | A21070 | |
| Hoechst 33342 | Thermo Fisher Scientific | H1399 | |
| ERK生物传感器成像 | pLenti-CMV-Puro-DEST-ERK-KTR-mClover | Addgene | 59150 |
| 细胞培养 | Medium 154培养基 | Thermo Fisher Scientific | M154CF500 |
| 人角质形成细胞生长补充剂 | Thermo Fisher Scientific | S0015 | |
| 庆大霉素/两性霉素 | Thermo Fisher Scientific | R01510 | |
| DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11965092 | |
| 胎牛血清 | Hyclone, Thermo Fisher Scientific | SH3039603 | |
| GlutaMAX | Thermo Fisher Scientific | 35050061 | |
| 胰蛋白酶-EDTA | Thermo Fisher Scientific | 15400054 | |
| 器官型表皮培养 | DMEM:Ham's F12培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11765054 |
| 腺嘌呤 | Sigma-Aldrich | A2786 | |
| 氢化可的松 | Sigma-Aldrich | H0888 | |
| 人胰岛素 | Sigma-Aldrich | 91077C | |
| 霍乱毒素 | Sigma-Aldrich | C8052 | |
| 脱铁转铁蛋白 | Sigma-Aldrich | T1147 | |
| 3,3',5-三碘-L-甲状腺原氨酸 | Sigma-Aldrich | T6397 | |
| Transwell小室 | Corning | 353091 | |
| 10× DMEM | Sigma-Aldrich | D2429 | |
| 大鼠尾胶原I | Corning | CB354249 | |
| 深孔6孔细胞培养板 | Corning | 08-774-183 | |
| 10%中性缓冲福尔马林 | Thermo Fisher Scientific | 22-026-435 | |
| Western blot | NuPAGE 12% Bis-Tris凝胶 | Thermo Fisher Scientific | NP0343BOX |
| NuPAGE MES SDS电泳缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | NP0002 | |
| Immobilon-FL膜 | Sigma-Aldrich | IPFL85R | |
| 免疫荧光 | 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | A9647 |
| 正常山羊血清 | Sigma-Aldrich | G9023 | |
| 荧光组织染色 | 二甲苯 | Thermo Fisher Scientific | X3P |
| Prolong Gold抗淬灭封片剂 | Thermo Fisher Scientific | P36934 | |
| 机械解离实验 | 中性蛋白酶 | Stemcell Technologies | 07913 |
| ERK生物传感器成像 | FuGENE 6转染试剂 | Promega | E2691 |
| Opti-MEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | 31985070 | |
| 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | H9268 | |
| RNAi基因沉默 | AllStars阴性对照siRNA | Qiagen | 1027280 |
| 靶向MEK1的siRNA | Qiagen | 1027417; ID no. SI00300699 | |
| 靶向MEK2的siRNA | Qiagen | 1027417; ID no. SI02225090 | |
| FuGENE SI转染试剂 | -- | SI-1000 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| NHEK中B-RAF抑制剂处理及ERK检测 | dabrafenib浓度(1 μM)、vemurafenib浓度(10 μM)、trametinib浓度(1 μM)、处理时间(24小时)、独立实验重复数(Dab n=4,Vem n=6) 阅读提示:Figure 1A和1B图注;Methods中Immunoblotting小节 |
| NHEK机械解离实验 | dabrafenib浓度(1 μM)、vemurafenib浓度(10 μM)、trametinib浓度(1 μM)、处理时间(24小时)、dispase浓度(5 U/ml)、消化时间(30分钟)、倒置次数(最多10次)、重复数(Dab n=6,Vem n=4) 阅读提示:Figure 3A和3B图注;Methods中Monolayer mechanical dissociation assay小节 |
| 器官型表皮培养及vemurafenib处理 | 器官型表皮培养时间(8–12天)、vemurafenib浓度(10 μM)、处理时间(48小时)、空气暴露起始时间 阅读提示:Figure 4图注;Methods中Organotypic epidermal culture小节 |
| 患者活检免疫染色 | 患者数量:vemurafenib诱导GD n=5,自发性GD n=17,对照皮肤;pERK和PG抗体稀释比例(pERK 1:400,PG 1:100) 阅读提示:Figure 5和Figure 6图注;Methods中Fluorescent tissue staining小节 |
| ERK生物传感器成像 | ERK-KTR-mClover转导方法、钙浓度(低钙0.31 mM,高钙1.3 mM)、高钙处理时间(24小时) 阅读提示:Figure 1C–E图注;Methods中ERK biosensor imaging小节 |