Lcn13表达分析
确定LCN13在MASLD/MASH中的表达水平及其与疾病的相关性
利用GEO数据集(GSE35961、GSE200409)分析小鼠MASH模型中Lcn13 mRNA水平;使用HFD喂养小鼠模型验证Lcn13 mRNA和蛋白水平;ELISA检测血清LCN13水平;分析人类GEO数据集(GSE106737、GSE48452)中肝脏LCN13表达。
Lipocalin 13 Mitigates Metabolic Dysfunction-Associated Steatotic Liver Disease Through Inhibiting the ADRB2/ERK Signalling Pathway
包含基因敲除小鼠、两种饮食诱导模型、重组蛋白治疗、细胞实验、Co-IP/MS机制验证及功能验证等多层级证据。
C57BL/6J小鼠HFD诱导MASLD模型 C57BL/6J小鼠MCD诱导MASH模型 LCN13基因敲除小鼠 HepG2和THLE-2人肝细胞系
LCN13敲除小鼠背景为C57BL/6J HFD喂养20周诱导MASLD模型 MCD喂养6周诱导MASH模型 rLCN13给药剂量为5 mg/kg,每3天腹腔注射 细胞实验中使用LCN13过表达质粒或siRNA处理48小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定LCN13在MASLD/MASH中的表达水平及其与疾病的相关性
利用GEO数据集(GSE35961、GSE200409)分析小鼠MASH模型中Lcn13 mRNA水平;使用HFD喂养小鼠模型验证Lcn13 mRNA和蛋白水平;ELISA检测血清LCN13水平;分析人类GEO数据集(GSE106737、GSE48452)中肝脏LCN13表达。
评估LCN13缺失对MASLD/MASH进展的影响
使用LCN13全球敲除小鼠和WT小鼠,分别给予HFD(20周)或MCD(6周)饮食,分析体重、肝脏脂质、血清ALT/AST、胰岛素敏感性及肝脏组织学变化,并检测相关基因表达。
评估rLCN13蛋白对MASLD/MASH的治疗效果
对HFD或MCD诱导的小鼠腹腔注射rLCN13蛋白或PBS,评估体重、肝脏脂质、血清ALT/AST、葡萄糖耐量和胰岛素敏感性,以及肝脏组织学变化。
鉴定LCN13的相互作用蛋白并验证下游信号通路
通过Co-IP结合质谱鉴定与LCN13互作的候选蛋白ADRB2;在293T细胞中验证LCN13与ADRB2的相互作用;构建ADRB2 ECL结构域缺失突变体,定位关键结合域;在HepG2/THLE-2细胞及小鼠肝脏中检测ERK磷酸化水平和CD36表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | C11965500BT |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Invitrogen | -- | |
| 动物实验 | 高脂饮食 | Guangdong Medical Laboratory Animal Center | -- |
| 蛋氨酸-胆碱缺乏饮食 | Guangdong Medical Laboratory Animal Center | -- | |
| 药物处理 | 重组小鼠LCN13蛋白 | Shanghai Sangon Biotech Co. Ltd. | -- |
| 质粒提取 | 无内毒素大提质粒试剂盒 | TIANGEN | -- |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 病毒感染 | 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | -- |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| ELISA | LCN13 ELISA试剂盒 | Cloud-Clone | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | HiScript II Q Select RT SuperMix逆转录试剂盒 | Vazyme | -- |
| ChamQ SYBR qPCR预混液 | Vazyme | -- | |
| AceQ qPCR探针预混液 | Vazyme | -- | |
| Co-IP | 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- |
| 生化检测 | 甘油三酯检测试剂盒 | Solarbio | BC0620 |
| 总胆固醇检测试剂盒 | Solarbio | BC1985 | |
| 组织染色 | 油红O染料 | Sigma | -- |
| Western blot | 二抗 | ABclonal | -- |
| ELISA | TMB底物溶液 | 文中未明确说明 | -- |
| 生化分析 | 全自动生化分析仪 | Hitachi | -- |
| ELISA | 酶标仪 | BioTek | -- |
| 质谱分析 | 液相色谱-串联质谱系统 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物实验 | 小鼠品系、性别、年龄、饮食成分及喂养时长、环境条件(温度、光照周期) 阅读提示:Methods 2.1、2.2,Table S1 |
| LCN13敲除小鼠模型 | 敲除策略(基因打靶)、基因型确认方法、繁殖策略、确认敲除效率的方法 阅读提示:Methods 2.1,Figure S3 |
| MASLD/MASH诱导 | HFD和MCD饮食的营养成分、喂养持续时间(HFD 20周,MCD 6周) 阅读提示:Methods 2.2,Table S1 |
| 重组蛋白治疗 | rLCN13蛋白的剂量(5 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、给药频率(每3天一次)、治疗起始时间点 阅读提示:Methods 2.2,Figure 5A,Figure 6A |
| 细胞实验 | 细胞系类型(HepG2、THLE-2、293T)、培养条件(DMEM、10% FBS、37°C、5% CO2)、转染试剂(Lipofectamine 2000)及用量、siRNA或质粒浓度及处理时间 阅读提示:Methods 2.3、2.4 |
| 蛋白互作分析 | Co-IP裂解缓冲液成分、抗体类型(anti-Flag、anti-HA)、蛋白G珠、质粒构建(Flag-LCN13、HA-ADRB2) 阅读提示:Methods 2.9,Figure 7 |
| 基因表达分析 | RNA提取方法(TRIzol)、逆转录试剂盒(HiScript II Q Select RT SuperMix)、qPCR预混液(ChamQ SYBR qPCR Master Mix)、内参基因(β-actin)、引物序列 阅读提示:Methods 2.8,Table S2,Table S4 |