筛选HBS1L分子胶降解剂
鉴定能够诱导HBS1L降解并与CRBN形成三元复合物的化合物。
使用HiBiT细胞降解分析和TR-FRET三元复合物试验进行平行筛选,发现苗头化合物TNG-6266,经药物化学优化得到TNG961。
TNG961 Is a Selective Oral HBS1L Molecular Glue Degrader for the Treatment of FOCAD-Deleted Cancers
包含多种独立证据层级:体外细胞活力实验、异种移植瘤模型、基因组数据分析、功能验证(蛋白降解、CRISPR)和机制验证(UPR激活、翻译抑制)。
FOCAD等基因细胞系对(如NCIH1755、MIAPACA2、MDA-MB-231) FOCAD敲除细胞系(HeLa、HAP1) 异种移植瘤模型(MIAPACA2、NCIH838、RS411、NCIH1755) 基于TCGA的泛癌数据集
FOCAD缺失状态(通过cDNA再表达或基因敲除) TNG961处理剂量及时间(例如24小时处理用于降解检测) 细胞活力测定使用CellTiter-Glo 异种移植瘤模型中TNG961的口服给药剂量 HBS1L和PELO蛋白水平检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定能够诱导HBS1L降解并与CRBN形成三元复合物的化合物。
使用HiBiT细胞降解分析和TR-FRET三元复合物试验进行平行筛选,发现苗头化合物TNG-6266,经药物化学优化得到TNG961。
确证TNG961通过CRBN依赖性方式降解HBS1L,并评估其对GSPT1等蛋白的选择性。
通过免疫印迹评估多种细胞系中内源性HBS1L降解;验证CRBN敲除和MLN4924处理对降解的影响;进行全蛋白质组学分析。
验证TNG961对FOCAD缺失细胞的选择性毒性。
在FOCAD等基因细胞系对及多种亲本细胞系中进行细胞活力测定,分析TNG961的效能与选择窗口。
评估口服TNG961的体内抗肿瘤活性。
在多种FOCAD阴性异种移植瘤模型中,每日两次口服TNG961,测量肿瘤体积。
阐明TNG961诱导FOCAD缺失细胞死亡的分子机制。
通过嘌呤霉素掺入检测翻译抑制,通过Western blot和qPCR检测UPR标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞活力测定 | CellTiter-Glo试剂盒 | Promega | G9241 |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | Life Technologies | 89901 |
| 抗嘌呤霉素抗体 | Sigma-Aldrich | MABE343 | |
| CRISPR敲入 | Alt-R Cas9 crRNA | IDT | -- |
| 蛋白质纯化 | Ni-NTA树脂 | QIAGEN | 30230 |
| Superdex 200 10/300 色谱柱 | Cytiva | 28990944 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 药物处理 | TNG961浓度、处理时间(如24小时、48小时、7天等) 阅读提示:图例和结果部分 |
| 细胞模型 | 细胞系、FOCAD状态(阴性或阳性)、是否使用等基因对 阅读提示:图例和补充表S2 |
| 异种移植瘤实验 | 小鼠品系、接种细胞数、给药剂量和频率、肿瘤测量方法 阅读提示:方法部分'Xenograft Studies' |
| 蛋白检测 | 抗体、裂解液、归一化方法 阅读提示:补充表S1 |