NFATC4在S213/S217位点的机械敏感性磷酸化驱动成纤维细胞向肌成纤维细胞转化及纤维化

Mechanosensitive phosphorylation of NFATC4 at S213/S217 drives fibroblast-to-myofibroblast transition and fibrosis

作者信息Safwen Kadri, Laura F Mattner, Zhen Zeng, Sai Rama Sridatta Prakki, Arun Kumar Verma, Umut Cetin, Christoph H Mayr, Meshal Ansari, Xin Wei, Sara Asgharpour, Anita A Wasik, Nikolaus Kneidinger, Mircea-Gabriel Stoleriu, Jürgen Behr, Julien Polleux, Ali Önder Yildirim, Laurens J De Sadeleer, Wim A Wuyts, Gerald Burgstaller, Matthias Mann, Martin Mück-Häusl, Herbert B Schiller
PMID42677834
发布时间2026-09-01
DOI10.1172/JCI195121

实验完整度

包含磷酸化蛋白质组学、细胞功能实验(siRNA敲低)、位点特异性磷酸化突变体功能验证以及人肺组织与多队列单细胞数据的整合分析,多层级证据支持。

主要模型

CCL-151人肺成纤维细胞系 原代人肺成纤维细胞(pHLFs) IPF患者来源的成纤维细胞(MLT-018) 微CT分期IPF患者肺组织

重点核对

基质刚度范围:0.5, 2, 8, 16, 32 kPa的纤维连接蛋白包被PDMS底物 细胞处理时间:120分钟(磷酸化蛋白质组学)或96小时(侵袭实验) 药物处理:TGFB(1或5 ng/mL)、FK-506、环孢素A、JNK抑制剂VIII 关键突变:NFATC4 S213D/S217D(磷酸化模拟)和S213A/S217A(磷酸化缺陷) NFATC4敲低效率:siRNA介导的敲低>70%持续2-3天

摘要

组织硬度与细胞收缩力之间的机械敏感反馈决定细胞身份。为了表征磷酸化介导的机械感知,我们绘制了原代人肺成纤维细胞在纤维连接蛋白包被的、具有确定硬度的聚二甲基硅氧烷底物上的全局磷酸化蛋白质组动态。我们确定了一个关键信号阈值(2–8 kPa),高于此阈值,细胞激活细胞骨架重塑、ECM分泌,并转变为CTHRC1+/ACTA2+肌成纤维细胞状态,同时伴有转录因子NFATC4在S213/S217位点的硬度依赖性磷酸化。在微CT分期的肺纤维化组织中,NFATC4表达逐渐增加,并与肌成纤维细胞中的CTHRC1和ACTA2共定位。来自多队列肺纤维化图谱的转录因子调控子推断证实了NFATC4在疾病成纤维细胞中的活性升高,揭示了一个以CTHRC1为顶级靶点的核心的119基因NFATC4依赖性纤维化程序。磷酸化模拟S213D/S217D突变体在软底物上独立于TGFB驱动肌成纤维细胞分化,而磷酸化缺陷S213A/S217A突变体即使在硬基质上存在TGFB的情况下也阻断分化,确立了该磷酸化开关既必要又充分。硬基质和TGFB汇聚于这个依赖于JNK和钙调磷酸酶的开关上,以放大纤维化反应。这将NFATC4 S213/S217定位为CTHRC1+肌成纤维细胞命运的机械敏感检查点,并作为多器官纤维化的候选治疗靶点。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
基质硬度如何通过磷酸化信号调控成纤维细胞向肌成纤维细胞的转变?
核心机制
基质硬度(>8 kPa)激活JNK,导致NFATC4在S213/S217位点磷酸化,促进其核转位并激活CTHRC1+/ACTA2+肌成纤维细胞基因程序,同时TGFB信号通过平行途径增强该程序。
主要证据
磷酸化蛋白质组学鉴定NFATC4 S213/S217为硬度敏感位点;NFATC4敲低减少肌成纤维细胞标志物、胶原沉积和收缩;磷酸化模拟突变体在软基质上独立于TGFB驱动分化,而磷酸化缺陷突变体阻断分化;人IPF组织中NFATC4与肌成纤维细胞标志物共表达且随疾病严重程度增加。
研究意义
揭示NFATC4 S213/S217磷酸化开关作为机械感知检查点,是阻断纤维化进展的潜在治疗靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

建立机械敏感磷酸化蛋白质组图谱

鉴定基质硬度依赖的磷酸化位点和信号通路。

将CCL-151细胞和原代人肺成纤维细胞(pHLFs)在纤维连接蛋白包被的PDMS底物(不同硬度)上培养120分钟,并进行定量磷酸化蛋白质组学分析。

2

机械敏感转录因子的功能验证

验证磷酸化蛋白质组学预测的转录因子(包括NFATC4)在纤维化中的活性。

利用多队列IPF scRNA-seq数据进行pySCENIC调控子分析,评估NFATC4等转录因子的活性,并分析其靶基因。

3

人肺组织中的NFATC4表达与严重程度关联分析

评估NFATC4在IPF患者肺组织中的表达及其与疾病严重程度的关系。

对健康供体和IPF患者(轻度IPF1、中度IPF2、重度IPF3)的肺组织切片进行免疫荧光染色,检测NFATC4、CTHRC1和ACTA2的表达和共定位。

4

NFATC4敲低的功能研究

确定NFATC4在成纤维细胞激活中的功能必要性。

使用siRNA敲低NFATC4,检测肌成纤维细胞标志物表达、胶原凝胶收缩、细胞侵袭能力及细胞骨架形态。

5

NFATC4磷酸化位点的功能验证

验证NFATC4 S213/S217磷酸化对成纤维细胞向肌成纤维细胞转化的充分性和必要性。

过表达野生型、磷酸化模拟(S213D/S217D)和磷酸化缺陷(S213A/S217A)的NFATC4,在不同硬度基质和TGFB存在与否下检测肌成纤维细胞标志物表达。

6

上游信号通路验证

确认JNK和钙调磷酸酶信号是NFATC4磷酸化开关的上游。

使用JNK抑制剂VIII、FK-506和环孢素A处理细胞,检测肌成纤维细胞标志物表达和NFATC4的核转位。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM/F-12培养基Thermo Fisher Scientific31330038
胎牛血清Sigma-AldrichS0615-500ML
青霉素/链霉素Thermo Fisher Scientific15140122
纤连蛋白Sigma-AldrichF1141-1MG
Titansphere TiO2 微珠GL Sciences5010-21315
Q Exactive Orbitrap 质谱仪Thermo Fisher Scientific--
GAPDH抗体Cell Signaling Technology5174S
CK IIα抗体Abcamab70774
磷酸化CK2底物抗体Cell Signaling Technology8738
磷酸化MLC2 Thr18/Ser19抗体Cell Signaling Technology3674
磷酸化FOXO3a S7抗体Cell Signaling Technology14724S
磷酸化Paxillin S126抗体Life Technologies441022G
磷酸化CBX3 Ser93抗体Cell Signaling Technology2600
抗兔IgG-HRP二抗Cell Signaling Technology7074
抗小鼠IgG-HRP二抗Cell Signaling Technology7074
Lipofectamine RNAiMAX转染试剂Invitrogen13778100
Opti-MEM培养基Thermo Fisher Scientific31985062
Quick-RNA 微量提取试剂盒ZymoR1050
GoScript逆转录酶PromegaA5000
GoTaq PCR预混液PromegaA6001
DAPI核染色剂----
AF647标记鬼笔环肽Thermo Fisher ScientificA22287
桩蛋白抗体BD Biosciences610051
鼠尾I型胶原Thermo Fisher ScientificA1048301
CytoSoft 6孔板Advanced BioMatrix--
Bioruptor超声破碎仪Diagenode--
C18色谱柱Dr. Maisch--
EASY-nLC 1000纳升液相色谱仪Thermo Fisher Scientific--
SpeedVac浓缩仪Thermo Fisher Scientific--
Zeiss LSM 710共聚焦显微镜Zeiss--
AXIO荧光显微镜Zeiss--
CellCarrier 384孔板PerkinElmer6007550

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
磷酸化蛋白质组学(细胞培养)
CCL-151和pHLF细胞的代数;纤维连接蛋白包被浓度(10 μg/mL);PDMS底物硬度(0.5 kPa至32 kPa)及培养时间(120分钟);细胞接种密度(50万个/孔);重复数(文中未明确说明)
阅读提示:Methods: Phosphoproteome sample preparation
NFATC4敲低实验
siRNA序列(s9484+s9483)和浓度(未明确说明);转染试剂Lipofectamine RNAiMAX用量;敲低效率验证(>70%下调持续2-3天);实验时间点(未明确说明)
阅读提示:Methods: RNAi and Figure 5
NFATC4突变体过表达实验
质粒构建(WT, S213D/S217D, S213A/S217A);转染方法(未明确说明);转染后培养时间(未明确说明);基质硬度(0.5 kPa和32 kPa);TGFB浓度(5 ng/mL)
阅读提示:Methods: Plasmid generation and Figure 7
抑制剂处理
JNK抑制剂VIII的浓度(未明确说明);FK-506和CsA的处理参数(未明确说明);TGFB浓度(5 ng/mL)及处理时间(未明确说明)
阅读提示:Methods: Cell culture and Figure 8; 补充图14
ECM沉积实验
细胞接种密度(6000个/孔);siRNA处理时间(过夜);血清饥饿时间(24小时);TGFB浓度(1 ng/mL)和处理时间(3天)
阅读提示:Methods: ECM deposition
胶原凝胶收缩实验
每组细胞数(1.5×10^5个/mL);胶原类型(I型)及来源(未明确说明);TGFB浓度(1.5 ng/mL和1 ng/mL);凝胶体积(500 μL);观察时间点(12-120小时)
阅读提示:Methods: Collagen gel contraction