样本收集与EV分离
从AD患者和对照中获取CSF和血浆EV,用于后续蛋白组学和功能分析。
收集21例AD和22例对照的CSF以及30例AD和30例对照的血浆;通过超速离心分离CSF中的EV,通过PEG沉淀分离血浆EV。
HSPA8 orchestrates SNARE complex assembly to drive extracellular vesicle-mediated spread of p-tau217 in Alzheimer's disease
结合空间转录组、EV蛋白质组学、体外细胞模型、体内小鼠模型及功能/机制验证,包括shRNA敲低、肽抑制剂和行为学测试。
SH-SY5Y细胞(Aβ42处理) HEK293T细胞 APP/PS1小鼠 5×FAD小鼠 人脑脊液和血浆样本
Aβ42处理浓度:5 μM HSPA8敲低:shRNA (#19757-1) 25-mer肽(SNAP29 156-180)处理 小鼠品系:APP/PS1(6月龄注射shRNA,8月龄注射肽)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从AD患者和对照中获取CSF和血浆EV,用于后续蛋白组学和功能分析。
收集21例AD和22例对照的CSF以及30例AD和30例对照的血浆;通过超速离心分离CSF中的EV,通过PEG沉淀分离血浆EV。
评估AD条件下p-tau217+ EVs从CNS到外周的转运是否受损。
利用原代星形胶质细胞、脑微血管内皮细胞和周细胞建立体外三细胞BBB模型,用Aβ42处理,并测量EV穿越率。
验证Aβ42处理对p-tau217+ EV合成和分泌的影响。
SH-SY5Y细胞用5 μM Aβ42处理,检测p-tau217水平、CD9标记的EV、溶酶体活性、细胞活力和毒性。
鉴定与p-tau217+ EVs减少相关的关键分子和通路。
从AD和HC CSF中免疫捕获p-tau217+ EVs,进行质谱分析,结合空间转录组数据,通过GO、KEGG和PPI分析筛选候选基因。
验证HSPA8对p-tau217+ EV分泌的调控作用。
在SH-SY5Y细胞中敲低HSPA8,检测p-tau217+ EVs比例、SNARE组分表达和相互作用。
评估HSPA8敲低对AD小鼠认知和p-tau217+ EV分泌的影响。
向APP/PS1小鼠海马立体定位注射sh-HSPA8,进行行为学测试和血浆EV分析。
开发并测试靶向HSPA8-SNAP29相互作用的肽抑制剂对AD病理的改善作用。
基于分子对接设计SNAP29 156-180肽,在HEK293T和SH-SY5Y细胞中验证其结合和内化,并在APP/PS1小鼠中评估其疗效。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Peiyuan Biotechnology | L310KJ |
| 胎牛血清 | Gibco | 30044333 | |
| 青霉素-链霉素 | Peiyuan | S110JV | |
| 0.25%胰蛋白酶/EDTA | Peiyuan | S310KJ | |
| BBB模型建立 | Transwell小室 | Corning | 3470 |
| 细胞活力检测 | CCK-8检测试剂盒 | Abcam | ab228554 |
| 细胞毒性检测 | LDH检测试剂盒 | Beyotime | C0017 |
| EV分离 | PEG8000 | Sigma-Aldrich | 89510 |
| 流式分析 | 抗p-tau217抗体 | Thermo | 44-744 |
| 抗p-tau181抗体 | Thermo | MN1050 | |
| 抗p-tau231抗体 | Thermo | MN1040 | |
| 抗p-tau396抗体 | Thermo | 35-5300 | |
| 抗总tau抗体 | Thermo | MA5-12808 | |
| Zenon Alexa Fluor 647标记试剂盒 | Invitrogen | Z25308 | |
| 小鼠IgG1标记试剂盒 | Invitrogen | Z25008 | |
| 小鼠IgG2b标记试剂盒 | Invitrogen | Z25208 | |
| 免疫捕获 | 抗p-tau217抗体 | Invitrogen | 44744 |
| Dynabeads抗体偶联试剂盒 | Invitrogen | 14311D | |
| 质谱分析 | 尿素 | Sigma | 33247 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Invitrogen | 23227 | |
| Orbitrap Exploris 480质谱仪 | -- | -- | |
| RNA提取与qPCR | Trizol试剂 | Invitrogen | 15596018CN |
| RT-qPCR | PrimeScript RT试剂盒 | Takara Bio | RR047A |
| TB Green Premix Ex Taq | Takara Bio | RR420A | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 通用抗体稀释液 | NCM Biotech | WB100D | |
| IRDye 800CW标记二抗 | LI-COR Biosciences | 926-32210 | |
| 免疫共沉淀 | Pierce经典磁性免疫共沉淀试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 88804 |
| 抗HSPA8抗体 | Abcam | ab51052 | |
| ELISA | PathScan磷酸化Tau(Thr217) ELISA试剂盒 | Cell Signaling Technology | 87749C |
| 免疫荧光染色 | DAPI | Vector Laboratories | H-1400 |
| STELLARIS 8共聚焦显微镜 | Leica Microsystems | -- | |
| 溶酶体染色 | LysoTracker Red DND-99 | Thermo Fisher | L7528 |
| 立体定位注射 | Hamilton注射器 | -- | -- |
| 分子克隆 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000150 |
| Lipo8000转染试剂 | Beyotime Biotechnology | C0533 | |
| 免疫沉淀 | 抗Flag磁珠 | Thermo Fisher Scientific | A36797 |
| 免疫印迹 | 抗HA抗体 | Thermo Fisher Scientific | 26183 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞处理 | Aβ42处理浓度:5 μM;处理时间:文中未明确说明 阅读提示:见Methods 'Cell culture' 和 'Results' 图1 |
| HSPA8敲低 | shRNA序列:HSPA8 RNAi (#19757-1);转染方法:文中未明确说明 阅读提示:见Methods 'Cell transfection' 和 'Results' 图2 |
| 肽处理 | 25-mer肽序列:QEAKYQASHPNLRKLDDTDPVPRGA;处理浓度:文中未明确说明 阅读提示:见Results 图7 |
| 动物实验 | 小鼠品系:APP/PS1(JAX Stock No. NMX-TG-192043);注射年龄:shRNA 6月龄,肽 8月龄;注射体积:shRNA 0.1 μL,肽 0.5 μL 阅读提示:见Methods 'Animals' 和 'Stereotaxic injection in the hippocampus' |
| EV分离与检测 | 超速离心条件:100,000×g,2小时,4°C;纳米流式检测:50,000个粒子 阅读提示:见Methods 'EV isolation' 和 'Analysis of EVs by CytoFLEX' |