抗体筛选与验证
从人合成噬菌体展示文库中筛选出特异识别NiV NP的抗体。
通过固相和磁珠淘选,从scFv和Fab文库中富集NiV NP结合克隆,经ELISA验证,并转为全长鼠IgG进行IFA检测细胞内NiV NP。
A rapid detection of Nipah virus nucleocapsid antigen in inactivated viral cultures
包含体外抗体筛选、细胞免疫荧光验证、BLI亲和力测定、重组蛋白灵敏度/特异性分析及灭活病毒培养物检测等多个独立证据层面,并具备功能验证(检测性能)与机制讨论。
293T细胞(瞬时表达NiV NP) 重组NiV NP蛋白 γ射线灭活的培养尼帕病毒(马来西亚株)
抗体筛选:从人合成scFv和Fab噬菌体展示文库经迭代生物淘选获得,经ELISA和IFA验证 抗体配对:通过点印迹LFIA筛选,mAb #5为捕获抗体,mAb #2为检测抗体 检测条件:100 μL样本,反应15分钟,运行缓冲液 灭活病毒定量:γ射线灭活NiV(马来西亚株)经RT-ddPCR定量,检测限为4.1×10⁷拷贝/mL(读取器)和8.3×10⁷拷贝/mL(肉眼) 特异性:未与SARS-CoV-2、SARS-CoV、MERS-CoV、流感A交叉反应,但与麻疹病毒NP在2 µg/mL时有弱交叉反应
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从人合成噬菌体展示文库中筛选出特异识别NiV NP的抗体。
通过固相和磁珠淘选,从scFv和Fab文库中富集NiV NP结合克隆,经ELISA验证,并转为全长鼠IgG进行IFA检测细胞内NiV NP。
确定最适的捕获-检测抗体组合。
对四种候选抗体(#2, #4, #5, #8)进行十二种组合的夹心配对,通过点印迹LFIA评估信号强度和P/N比,选择最佳对。
量化所选抗体的结合亲和力。
利用BLI分析mAb #2和#5与NiV NP的结合动力学,计算KD值。
构建CNB增强的LFIA试纸条。
将抗NiV NP抗体偶联至红色CNB(检测探针),将鸡IgY偶联至蓝色CNB(对照探针),组装试纸条。
测定重组NiV NP的检测限和交叉反应性。
使用系列稀释的重组NiV NP评估灵敏度,并测试其他呼吸道病毒NP以评估特异性。
验证LFIA对真实病毒样本的检测能力。
对γ射线灭活NiV样本进行系列稀释,用LFIA检测,并与RT-qPCR和RT-ddPCR的病毒载量相关联。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与转染 | X-tremeGENE™ HP DNA转染试剂 | Roche Diagnostics | -- |
| 免疫荧光 | 抗NiV NP小鼠IgG | -- | -- |
| 山羊抗小鼠IgG–FITC | Jackson ImmunoResearch | -- | |
| 小鼠抗6×His抗体 | Abcam | -- | |
| EVOS M7000倒置荧光显微镜 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗体配对 | 重组NiV NP抗原 | The Native Antigen | REC31746 |
| Sapphire生物分子成像仪 | Azure Biosystems | -- | |
| BLI | BLITz生物层干涉仪 | ForteBio | -- |
| Ni-NTA生物传感器 | -- | -- | |
| CNB偶联 | 红色纤维素纳米珠(NanoAct) | Asahi Kasei Fibers Corporation | RE2AA |
| 蓝色纤维素纳米珠(NanoAct) | Asahi Kasei Fibers Corporation | BL1AA | |
| 偶联试剂盒 | DCN Diagnostics | CKNB-010 | |
| 鸡IgY抗体 | Bore Da Biotech | 40200 | |
| Synergy H1酶标仪 | BioTek | -- | |
| LFIA检测 | careSTART™ Light-G便携式读取器 | Wells Bio | -- |
| 特异性测试 | 重组SARS-CoV-2核衣壳蛋白 | Sino Biological | 40588-V08B |
| 重组SARS-CoV核衣壳蛋白 | Sino Biological | 40143-V08B | |
| 人甲型流感病毒H1N1 | Korea Bank for Pathogenic Viruses | KBPV-VR33 | |
| 麻疹病毒核衣壳蛋白 | The Native Antigen Company | REC31796 | |
| 病毒载量定量 | QIAamp病毒RNA提取试剂盒 | Qiagen | -- |
| RT-qPCR | StepOne实时荧光定量PCR系统 | ThermoFisher | -- |
| StepOne Plus实时荧光定量PCR系统 | ThermoFisher | -- | |
| PrimeScript™ RT-PCR试剂盒 | TaKaRa Bio | -- | |
| RT-ddPCR | QX200微滴数字PCR系统 | BioRad | -- |
| 探针专用高级试剂盒 | BioRad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 抗体筛选与验证 | 噬菌体文库来源、生物淘选方案、重组NiV NP浓度、ELISA阳性判定标准 阅读提示:Materials and methods (Phage display部分并未在此文本中详述,但参考补充材料);补充图S1 |
| IFA实验 | 293T细胞培养条件、转染试剂和用量、NP表达质粒、转染后培养时间、固定/透化/封闭液配方、一抗浓度(1 μg/100 μL)、二抗及稀释度、显微镜型号 阅读提示:Materials and methods (Immunofluorescence assay部分) |
| 配对筛选 | 抗体浓度(0.5 mg/mL)、抗原浓度(42.5 μg/mL)、CNB偶联抗体浓度(0.0025%)、运行缓冲液配方、反应时间(15 min) 阅读提示:Materials and methods (Pairing antibodies部分);图2 |
| BLI | 抗原固定浓度(100 μg/mL)、抗体浓度系列(66.7-666.7 nM)、结合模型(1:1 Langmuir) 阅读提示:Materials and methods (Bio-layer interferometry部分) |
| LFIA组装 | CNB类型(红/蓝)及偶联抗体、CNB浓度(红0.055%, 蓝0.1%)、T线抗体及浓度(0.5 mg/mL)、C线抗体及浓度(0.5 mg/mL)、膜处理(Triton X-100)、干燥条件(37°C, 1h)、切割宽度(3.75 mm) 阅读提示:Materials and methods (CNB conjugation和LFIA部分) |
| 分析性能 | 重组NiV NP浓度范围(200 pg/mL-2 μg/mL)、样本体积(100 μL)、反应时间(15 min)、重复数(3)、阈值(阴性+3SD) 阅读提示:Materials and methods (Analytical performance with recombinant NiV NP部分);图3 |
| 特异性评估 | 非靶抗原及其浓度(2 μg/mL)、来源和货号、相同buffer和反应条件 阅读提示:Materials and methods (Analytical performance部分);图3b,d |
| 灭活病毒检测 | 灭活NiV来源及品系、RT-ddPCR定量方法、稀释系列(1x, 0.5x, 0.25x)、判定标准(读取器/肉眼) 阅读提示:Materials and methods (Detection of NiV NP antigen in inactivated viral cultures部分);图5 |