空间分析识别出肝细胞癌中包裹肿瘤簇的血管中LAMTOR2过表达

背景：包裹肿瘤簇的血管（VETC）是肝细胞癌（HCC）中一种独特的血管生成模式。虽然VETC阳性HCC与不良预后相关，但它对血管靶向治疗表现出更好的反应。然而，定义VETC阳性HCC的分子特征仍然难以捉摸。本研究采用空间转录组学和单细胞RNA测序来表征VETC阳性HCC的分子景观，并识别候选生物标志物。方法：使用GeoMx数字空间分析，我们分析了来自24名HCC患者的肿瘤和邻近肝脏组织，重点关注VETC阳性、VETC阴性或非肿瘤性肝脏区域。进行了差异基因表达和通路富集分析。候选基因进一步通过免疫组织化学、癌症基因组图谱（TCGA）数据集和单细胞RNA测序进行评估。结果：空间转录组学分析确定了39个在VETC阳性区域上调的基因，富集了血管生成、WNT/β-catenin、Hedgehog和p53信号传导、上皮-间质转化和脂肪酸代谢通路，并抑制了免疫相关通路。其中，LAMTOR2、DPP4、ZNHIT1和MLXIPL在VETC阳性区域与VETC阴性和正常肝脏区域相比均持续上调。LAMTOR2在TCGA数据集中表现出肿瘤特异性定位。免疫组织化学证实，LAMTOR2表达的周围增强模式仅限于肿瘤细胞，并与RNA表达和VETC阳性密切相关。单细胞RNA测序进一步揭示了LAMTOR2在恶性肝细胞中的上调，特别是在富含脂质降解、脂肪酸氧化和解毒通路的VETC高亚群中。结论：VETC阳性HCC表现出独特的转录组和代谢谱。LAMTOR2在VETC阳性HCC中持续上调，可能促进血管生成和代谢重编程，为HCC的治疗分层提供潜在意义。