患者样本中H19表达及与纤维化标志物的相关性分析
检测H19在SSc皮肤和成纤维细胞中的表达水平,并评估其与促纤维化标志物的关联,以初步支持H19在SSc发病中的作用。
通过RNAscope原位杂交检测皮肤H19表达,RT-qPCR检测原代成纤维细胞H19 mRNA,免疫组化检测COL-1和STAT3,并分析H19与Col1A1、ACTA2、CCN2的相关性。
Long Non-Coding RNA H19 mediates STAT3 dependent activation of keratinocytes and fibroblasts in Systemic Sclerosis skin
包含皮肤组织水平表达分析(RNAscope/免疫组化)、体外细胞功能验证(siRNA敲低/过表达、凝胶收缩)、机制研究(ChIP、通路抑制)及细胞共培养实验等多层级验证。
皮肤组织(SSc患者与健康对照) 原代真皮成纤维细胞(SSc与健康对照) hTERT永生化真皮成纤维细胞(HC和SSc) HaCaT角质形成细胞
H19在SSc皮肤和成纤维细胞中的表达水平及与促纤维化标志物的相关性 siRNA敲低H19对SSc成纤维细胞促纤维化基因表达和凝胶收缩能力的影响 H19过表达对健康成纤维细胞促纤维化表型的诱导作用 TGF-β、IL-6、IL-11通过STAT3调节H19表达的机制,包括ChIP验证pSTAT3结合H19启动子 SSc成纤维细胞共培养诱导HaCaT细胞STAT3/STAT1磷酸化,且该效应依赖H19
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测H19在SSc皮肤和成纤维细胞中的表达水平,并评估其与促纤维化标志物的关联,以初步支持H19在SSc发病中的作用。
通过RNAscope原位杂交检测皮肤H19表达,RT-qPCR检测原代成纤维细胞H19 mRNA,免疫组化检测COL-1和STAT3,并分析H19与Col1A1、ACTA2、CCN2的相关性。
验证H19是否直接调控SSc成纤维细胞的促纤维化活性和收缩能力。
使用siRNA1和siRNA2敲低H19,通过RT-qPCR检测促纤维化基因表达,Western blot检测蛋白水平,并通过凝胶收缩实验评估细胞收缩能力。
验证H19过表达是否足以在正常成纤维细胞中诱导促纤维化表型,进一步支持其因果作用。
通过逆转录病毒转导在hTERT HC成纤维细胞中过表达H19,RT-qPCR检测促纤维化基因表达,Western blot检测蛋白水平,凝胶收缩实验评估功能变化,并用miR-29a mimic验证其逆转作用。
探究TGF-β、IL-6和IL-11是否通过STAT3调控H19表达,并验证pSTAT3对H19启动子的直接结合。
使用TGF-β、IL-6或IL-11刺激HC成纤维细胞,并用SD208(TGF-βR抑制剂)、CTS(STAT3二聚化抑制剂)或siSTAT3处理,检测H19和STAT3 mRNA及蛋白水平;通过ChIP验证pSTAT3与H19启动子结合;在SSc成纤维细胞中敲低STAT3检测H19表达。
验证SSc成纤维细胞通过H19依赖方式激活角质形成细胞的STAT3和STAT1信号。
使用Transwell共培养系统,将SSc或HC成纤维细胞与HaCaT细胞共培养,Western blot检测HaCaT中pSTAT3、STAT3、pSTAT1和STAT1蛋白水平;同时设置H19敲低组验证其依赖性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Sigma | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Sigma | -- | |
| 遗传霉素 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 药物处理 | SD208 | Sigma | -- |
| 隐丹参酮 | MedChemExpress | -- | |
| 转化生长因子-β | R&D Systems | -- | |
| 白细胞介素-6 | PeproTech | -- | |
| 白细胞介素-11 | PeproTech | -- | |
| RNA提取和RT-qPCR | RNA提取试剂盒 | Zymo Research | -- |
| RT-qPCR | cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher | -- |
| SyBr Green PCR试剂盒 | Bio-Rad | -- | |
| CFX Connect实时荧光定量PCR检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| GAPDH抗体 | Proteintech | HRP-60004 | |
| pSTAT3 (Tyr705)抗体 | Cell Signaling | 9131 | |
| STAT3抗体 | Abcam | 119352 | |
| CTGF/CCN2抗体 | Abcam | ab209780 | |
| pSMAD3抗体 | Abcam | ab52903 | |
| SMAD3抗体 | Cell Signaling | 9523 | |
| pSTAT1抗体 | Cell Signaling | 9167 | |
| STAT1抗体 | Cell Signaling | 9172 | |
| Supersignal West Pico PLUS化学发光底物 | Thermo Fisher | 34577 | |
| Amersham硝酸纤维素膜 | Amersham Biosciences | -- | |
| RNAscope | H19 RNAscope探针 | Biotechnne | 1152841-C1 |
| RNAscope 2.5HD检测试剂盒(红色) | -- | 322360 | |
| RNA-蛋白质共检测辅助试剂盒 | Biotechnne | 323180 | |
| DAB显色液 | Vector Laboratories | -- | |
| siRNA转染 | H19 siRNA双链体 | Origene | SR319206 |
| siTrans 2.0转染试剂 | -- | TT320001 | |
| STAT3 siRNA | Qiagen | SI00048363 | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher | -- | |
| miRNA转染 | miRIDIAN miRNA模拟物(miR-29a) | Horizon | -- |
| DharmaFECT4转染试剂 | Horizon | T-2004-02 | |
| 逆转录病毒转导 | pBabepuro载体 | -- | -- |
| 嘌呤霉素 | Gibco | -- | |
| 凝胶收缩 | 胶原凝胶工作液 | Cambridge Biosciences | CBA-201 |
| ChIP | IgG抗体 | Thermo Fisher | 86199 |
| Dynabeads Protein G磁珠 | Thermo Fisher | 10004D | |
| DNA纯化试剂盒 | Qiagen | 28104 | |
| 共培养 | Transwell插入小室(0.40 μm孔径) | Corning | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本和细胞系 | SSc患者和HC的皮肤活检来源、样本量(SSc n=20,HC n=8);hTERT永生化成纤维细胞株的来源和代数限制 阅读提示:Materials and Methods - Patient enrollment and clinical characterization; Cell culture |
| 细胞培养和刺激 | 细胞培养条件(DMEM, 10% FBS, 37°C, 5% CO2);血清饥饿时间(24小时);TGF-β (10 ng/mL)、IL-6 (50 ng/mL)、IL-11 (50 ng/mL)的处理时间;SD208(1 μM)和CTS(5 μM)的预处理时间 阅读提示:Materials and Methods - Cell culture; Morphogen stimulation |
| siRNA敲低 | H19 siRNA(siRNA1和2)的序列和浓度;转染试剂(siTrans 2.0, Lipofectamine 2000)及转染时间;敲低效率和验证时间(48小时) 阅读提示:Materials and Methods - Small RNA interference transfections; Results - H19 expression regulates profibrotic activation |
| H19过表达 | 逆转录病毒载体(pBabepuro-H19)及转导过程;筛选浓度(Puromycin 1.0 μg/mL,维持0.5 μg/mL);细胞代数限制 阅读提示:Materials and Methods - Retroviral transduction |
| 凝胶收缩实验 | 细胞密度(200,000 cells/孔);胶原凝胶工作液配置;聚合时间(1小时,37°C,无CO2);测量时间点(0、24、48小时) 阅读提示:Materials and Methods - Gel contraction; Results - H19 expression regulates profibrotic activation |
| Transwell共培养 | 成纤维细胞与HaCaT细胞的比例(90%汇合度);共培养时间(48小时);血清饥饿处理(血清-free培养基) 阅读提示:Materials and Methods - Transwell assay; Results - LncRNA H19 dermal fibroblast expression can modulate cell-cell communication |
| ChIP实验 | 交联时间(15分钟);超声条件(2×30 秒 50 mHz);抗体孵育时间(2小时室温);洗涤缓冲液和DNA纯化步骤 阅读提示:Materials and Methods - Chromatin immunoprecipitation analysis |