小鼠淋巴瘤模型构建与表征
模拟人类MYD88L265P驱动的惰性淋巴瘤和DLBCL,并验证其病理和分子特征。
通过Cre-loxP系统在B细胞不同分化阶段激活MYD88L252P,并与BCR信号、BCL2表达、BLIMP1或TP53缺失等额外遗传改变组合,构建四种小鼠模型。通过生存分析、组织病理学、流式细胞术、免疫球蛋白检测等表征其淋巴瘤类型。
Genetically driven immune microenvironment states associate with therapeutic responses in MYD88 mutant lymphomas
包含多个独立证据层级:小鼠遗传模型、患者样本、体外共培养、体内治疗试验及组学分析,且具有明确的功能验证和机制验证。
BcrM88mb1小鼠(MYD88L252P+BCR信号) Bcl2M88mb1小鼠(MYD88L252P+BCL2表达) Blimp1M88cγ1小鼠(MYD88L252P+BLIMP1缺失) P53M88cγ1小鼠(MYD88L252P+TP53缺失)
小鼠模型构建时的Cre重组酶系统(Mb1-Cre或Cγ1-Cre)及额外遗传病变(BCR、BCL2、BLIMP1或TP53) 惰性淋巴瘤与DLBCL的病理学特征(组织学、免疫组化、免疫球蛋白分泌) T细胞亚群(CD4+ Tfh/Th1、CD8+ T细胞、Treg)的组成和功能状态 关键信号通路(CD40:CD40L、PD-1/PD-L1、IL10-IL10RA、MHC-I/II)的活性 治疗试验的给药方案(药物、剂量、频率、持续时间)及疗效评估指标(血清Ig、CBC)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟人类MYD88L265P驱动的惰性淋巴瘤和DLBCL,并验证其病理和分子特征。
通过Cre-loxP系统在B细胞不同分化阶段激活MYD88L252P,并与BCR信号、BCL2表达、BLIMP1或TP53缺失等额外遗传改变组合,构建四种小鼠模型。通过生存分析、组织病理学、流式细胞术、免疫球蛋白检测等表征其淋巴瘤类型。
确定小鼠模型是否重现人类MYD88突变淋巴瘤的分子特征。
对小鼠和患者淋巴瘤细胞进行scRNA-seq/BCR-seq,比较转录组特征和克隆性。
表征不同淋巴瘤模型中的免疫微环境状态。
通过流式、免疫组化、免疫荧光、单细胞测序(scRNA-seq/TCR-seq)和成像质谱流式分析T细胞亚群、共定位和功能状态。
验证T细胞对淋巴瘤细胞存活和增殖的影响。
通过体外共培养、CD4+或CD8+ T细胞耗竭、连续移植实验、CD40:CD40L相互作用及BTK抑制剂处理等,评估T细胞依赖性和CD40信号的作用。
阐明TP53缺失DLBCL中免疫耗竭微环境的机制。
通过全外显子测序、转录组分析、抗原呈递功能实验,以及低剂量阿扎胞苷联合R-CHOP治疗实验,研究肿瘤突变负荷、MHC分子表达和治疗反应。
探索针对免疫微环境的治疗靶点并评估联合治疗疗效。
针对IL10-IL10RA轴、4-1BB共刺激和PD-1-IL2v进行治疗试验,评估抗肿瘤反应及与R-CHOP或CAR-T的联合效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | 52400-025 |
| IMDM培养基 | Gibco | 12440-053 | |
| 胎牛血清 | Gibco | 10270-106 | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| 重组小鼠IL-4蛋白 | R&D Systems | 404-ML-010 | |
| 药物处理 | 依鲁替尼 | MedChemExpress | HY-10997 |
| 维奈托克 | MedChemExpress | HY-15531 | |
| 5-氮杂胞苷 | MedChemExpress | HY-10586R | |
| DRI-C21045 | MedChemExpress | HY-120323 | |
| 抗体治疗 | 抗CD19×4-1BBL双特异性抗体 | Roche | P1AG5884 |
| 抗PD1-IL2v | Roche | P1AD4866 | |
| 抗CD20单克隆抗体 | Roche | P1AG4479 | |
| 细胞因子检测 | ProcartaPlex免疫分析 | Thermo Fisher Scientific | PPX-08 |
| MILLIPLEX小鼠免疫球蛋白分型磁珠面板 | Millipore | MGMMAG-300K | |
| 细胞分选 | 小鼠CD4+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-104-454 |
| 小鼠CD8a+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-104-075 | |
| 细胞增殖检测 | CellTrace Violet细胞增殖试剂盒 | Thermo Fisher | C34557 |
| 细胞活力检测 | Deep Blue细胞活力试剂盒 | BioLegend | 424702 |
| 流式细胞术 | FACS CantoII流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| FACS AriaII分选仪 | BD Biosciences | -- | |
| 单细胞测序 | 10X Genomics单细胞5'解决方案 | 10X Genomics | -- |
| 测序平台 | NextSeq550测序仪 | Illumina | -- |
| NovaSeq6000测序仪 | Illumina | -- | |
| 全外显子测序 | SureSelect XT小鼠全外显子捕获试剂盒 | Agilent Technologies | G7550E |
| DNA提取 | NucleoSpin组织DNA提取试剂盒 | Macherey-Nagel | 740952 |
| 流式抗体 | APC抗小鼠CD25 | BioLegend | 102011 |
| APC抗小鼠CD279 (PD-1) | BioLegend | 135209 | |
| APC抗小鼠CD4 | BioLegend | 100516 | |
| APC抗小鼠/人CD45R/B220 | BioLegend | 103212 | |
| APC/Cyanine7抗小鼠CD19 | BioLegend | 115530 | |
| APC/Fire 750抗小鼠/人CD44 | BioLegend | 103061 | |
| Alexa Fluor 700抗小鼠CD4 | BioLegend | 100536 | |
| Brilliant Violet 421抗小鼠CD62L | BioLegend | 104435 | |
| Brilliant Violet 421抗小鼠CD155 (PVR) | BioLegend | 131517 | |
| Brilliant Violet 421抗小鼠CD279 (PD-1) | BioLegend | 135218 | |
| Brilliant Violet 510抗小鼠CD8a | BioLegend | 100752 | |
| Brilliant Violet 510抗小鼠CD138 | BioLegend | 142521 | |
| Brilliant Violet 650抗小鼠CD223 (LAG-3) | BioLegend | 125227 | |
| Brilliant Violet 785抗小鼠CD366 (Tim-3) | BioLegend | 119725 | |
| PE抗小鼠CD137 | BioLegend | 106105 | |
| PE抗小鼠CD138 (Syndecan-1) | BioLegend | 142504 | |
| PE抗小鼠FOXP3 | Invitrogen | 12-5773-82 | |
| PE抗小鼠TIGIT (Vstm3) | BioLegend | 142103 | |
| PE大鼠抗小鼠CD274 (PD-L1) | BioLegend | 558091 | |
| PE/Cyanine7抗小鼠CD3 | BioLegend | 100220 | |
| PE/Cyanine7抗小鼠TIGIT (Vstm3) | BioLegend | 142108 | |
| 纯化抗小鼠CD16/32,克隆93 | BioLegend | 101302 | |
| Ultra-LEAF纯化抗小鼠CD154 | BioLegend | 106518 | |
| Ultra-LEAF纯化抗小鼠CD210 (IL-10 R) | BioLegend | 1112712 | |
| BD Pharmingen纯化NA/LE仓鼠抗小鼠CD40 | BD Biosciences | 553721 | |
| 免疫组化 | 兔抗CD3 | Thermo Scientific | RM-9107 |
| 兔抗CD138 | BD Biosciences | 553712 | |
| Ki67抗体 | Cell Signaling | 12202 | |
| 抗兔EnVision+/HRP | Agilent | K4003 | |
| CD20 (GOT214A) | Antibodies Core Unit | AM(214A) | |
| Bcl6 (191E/A8) | Antibodies Core Unit | AM(191E/A8) | |
| IRF4抗体 (M17) | Santa Cruz Biotechnology | sc-6059 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型构建 | Cre-loxP系统(Mb1-Cre或Cγ1-Cre)诱导的MYD88L252P表达,以及额外遗传改变(Bcr、Bcl2、Blimp1或Trp53)的基因型和纯合性。 阅读提示:Methods and materials - Genetically engineered mouse lines |
| 免疫组化与流式分析 | 抗体克隆、稀释度、固定/透化条件、染色方案。 阅读提示:Methods and materials - Flow cytometry analyses and cell sorting; Immunohistochemistry (IHC) and Immunofluorescense (IF) analyses |
| 体外共培养实验 | 共培养的细胞比例、培养基、细胞因子(IL-4、LPS)、处理药物浓度(如ibrutinib、DRI-C21045)及持续时间。 阅读提示:Methods and materials - Ex vivo therapeutic assays |
| 治疗试验 | 药物剂量、给药途径、频率、治疗持续时间,以及肿瘤负荷评估标准(M-spike、CBC等)。 阅读提示:Methods and materials - Preclinical therapy trials |
| 单细胞测序 | 样本制备、细胞分选策略(如B220+或CD3+)、文库构建试剂盒版本、测序平台(NextSeq550、NovaSeq6000)和数据分析流程(Cell Ranger版本、Seurat版本、参数)。 阅读提示:Methods and materials - Single-cell RNA sequencing with BCR and TCR sequencing; Computational data analyses |