易突变RAS残基的乳酰化模拟致癌突变并驱动组成性激活

Lactylation of Mutation-Prone RAS Residues Mimics Oncogenic Mutations and Drives Constitutive Activation

作者信息Ruocen Liao, Chenglong Ma, Xingyu Chen, Longchang Bai, Qianhua Cao, Yu Zhang, Chenfang Dong
PMID42656841
发布时间2026-08
DOI10.34133/cancomm.0047

实验完整度

包含质谱鉴定、位点特异性乳酰化系统、体外酶活实验、细胞功能实验、异种移植模型及临床样本分析等多个独立验证层级。

主要模型

HEK293T细胞 NIH/3T3细胞 乳腺癌细胞系(Hs578T、MDA-MB-468等) BALB/c裸鼠异种移植模型 乳腺癌患者组织样本

重点核对

乳酰化位点特异性:K117和K147 酶催化机制:TIP60负责乳酰化,SIRT2负责去乳酰化 功能影响:乳酰化激活下游ERK/MEK信号通路,促进集落形成和肿瘤生长 蛋白稳定性:K147乳酰化阻断K48泛素化,增加RAS稳定性 临床相关性:RAS乳酰化在乳腺癌组织中升高,与预后不良相关

摘要

背景:野生型RAS的高表达有助于肿瘤发生,但其不依赖突变的过度活跃的机制仍不清楚。乳酰化是一种源自乳酸的翻译后修饰,已成为癌症中的一种调节因子,但其在RAS激活中的作用尚不清楚。在此,我们研究了RAS在特定残基上的乳酰化是否驱动其组成性激活及其潜在机制。方法:通过质谱法鉴定了RAS上的乳酰化位点。采用位点特异性乳酰化系统在K117和K147位点将乳酰赖氨酸引入RAS。通过分子动力学模拟分析结构效应。通过GTP结合和GTPase实验评估RAS活性;使用泛素化突变体和放线菌酮追踪评估蛋白质稳定性。通过体外乳酰化和去乳酰化实验确定了负责的酶。通过集落形成、乳腺球实验和异种移植模型测试了功能影响。在乳腺癌组织和生存数据库中检查了临床相关性,并通过将降乳酸药物与MEK抑制剂联合评估了药物协同作用。结果:我们报道RAS在K117和K147位点被乳酰化,这两个残基在癌症中发生突变。机制上,RAS乳酰化由TIP60催化,由SIRT2逆转。这些残基的乳酰化通过破坏GTP相互作用、损害内在鸟苷三磷酸酶(GTPase)活性以及竞争性拮抗K147位点的K48连接泛素化以稳定RAS,再现了致癌突变的特征。功能上,RAS乳酰化促进了恶性转化和肿瘤发生,模拟了相同位点的致癌突变。抑制乳酸产生使乳酰化RAS驱动的癌细胞对靶向RAS突变的药物敏感,揭示了一种治疗脆弱性。临床上,RAS乳酰化在乳腺癌组织中升高,并与不良预后相关。通过使用位点特异性乳酰化系统,我们进一步证实了单独的乳酰化模拟了突变驱动的RAS激活。结论:我们的研究将乳酰化重新定义为一种功能性“突变模拟”机制,它不仅再现了致癌突变的效果,而且弥合了癌症中遗传和表观遗传驱动因素之间的差距。这表明单独靶向乳酰化途径或与突变导向疗法联合,是治疗野生型RAS驱动癌症的一种有前景的策略。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
RAS在K117和K147位点的乳酰化是否驱动其组成性激活,并阐明其分子机制和功能后果。
核心机制
RAS乳酰化通过破坏GTP相互作用、抑制内在GTPase活性,并通过竞争性阻断K147位点的K48连接泛素化来增强蛋白稳定性,从而模拟致癌突变,驱动RAS组成性激活。
主要证据
通过质谱鉴定乳酰化位点;使用位点特异性乳酰化系统引入乳酰赖氨酸;GTPase和GTP结合实验证明活性增强;泛素化实验和CHX chase证明蛋白稳定性增加;体内异种移植模型证明肿瘤生长加速。
研究意义
本研究将乳酰化定义为一种动态的“突变模拟”机制,弥合了遗传和表观遗传驱动因素之间的差距,并提出靶向乳酰化通路或与突变靶向疗法联合治疗野生型RAS驱动癌症的新策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

鉴定RAS乳酰化位点

确定RAS蛋白上是否存在乳酰化修饰及其具体位点。

通过免疫沉淀和质谱分析,在HEK293T细胞中鉴定HRAS的乳酰化位点。

2

验证乳酰化对RAS活性的影响

检验乳酰化是否影响RAS的GTP结合和GTPase活性,从而影响其激活状态。

利用位点特异性乳酰化系统表达K117La/K147La HRAS,通过GTP-RBD pull-down和GTPase测定评估活性。

3

评估乳酰化对RAS蛋白稳定性的影响

探究乳酰化是否通过影响泛素化来调节RAS蛋白的稳定性。

通过CHX追踪和泛素化实验分析K147乳酰化对RAS稳定性的影响。

4

体内肿瘤形成实验

验证乳酰化模拟突变是否在体内促进肿瘤生长。

将表达HRAS-WT或乳酰化模拟突变体(K117Q/K147Q)的细胞注入裸鼠,监测肿瘤生长。

5

临床相关性分析

评估RAS乳酰化在乳腺癌组织中的表达及其与预后的关系。

检测乳腺癌组织中RAS乳酰化水平,并分析其与患者生存的关系。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

验证样本或模型特征
验证细胞功能变化
验证分子表达变化
评估体内效果
数据分析与统计

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基Gibco11965-092
胎牛血清Thermo FisherA5256701
Leibovitz's L-15培养基Thermo Fisher11415064
嘌呤霉素Thermo FisherA1113803
乳酰赖氨酸GL Biochem--
RIPA裂解液Cell Signaling Technology9806
N-乙基马来酰亚胺Thermo Fisher23030
抗Flag M2亲和凝胶Sigma-Aldrich--
PVDF膜PALLBSP0161
青霉素-链霉素----
琼脂糖Sigma-Aldrich--
结晶紫Sigma-Aldrich--
磷酸盐检测试剂盒Sigma-Aldrich--
GTP-琼脂糖Sigma-AldrichG9768
GST-TIP60蛋白SinobiologicalK314-380G
His-SIRT2蛋白--S36-30H
司美替尼----
司替戊醇----
草氨酸钠----
抗泛RAS抗体Proteintech12063-1-AP
抗FLAG抗体Sigma-AldrichF3165
抗ERK抗体Sigma-AldrichM5670
抗磷酸化ERK抗体Cell Signaling Technology9102
抗MEK1/2抗体Cell Signaling Technology8727
抗磷酸化MEK抗体Cell Signaling Technology9154
抗泛乳酰赖氨酸抗体PTM BioPTM-1401RM
抗GFP抗体Santa Cruzsc-9996
抗GST抗体Cell Signaling Technology2625
抗HRAS抗体Abcamab32417
抗NRAS抗体AbwaysCY5418
Q Exactive HF-X质谱仪Thermo Scientific--
BIOVIA Discovery Studio软件BIOVIA--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养
细胞系(ATCC认证),培养基(DMEM或L-15),血清(10% FBS),培养条件(37°C,5% CO2)
阅读提示:Methods: Cell culture
质谱鉴定
细胞系(HEK293T),Flag-HRAS表达,RIPA裂解缓冲液,蛋白酶抑制剂,NEM(20 mM),胰蛋白酶消化,LC-MS/MS参数
阅读提示:Methods: Mass spectrometry
位点特异性乳酰化
质粒(HRAS-K117TAG或K147TAG),核酶-tRNA质粒,转染比例(3:1),Kla浓度(2 mM或5 mM),处理时间(48 h)
阅读提示:Methods: Intracellular expression of site-specific lactylated proteins
GTPase实验
蛋白纯化(Flag标签),GTP负载,磷酸盐检测试剂盒(Sigma-Aldrich),OD620读数
阅读提示:Methods: GTPase assay
蛋白稳定性实验
CHX浓度(50 μg/ml或25 μg/ml),处理时间点,泛素化检测
阅读提示:Methods: Immunoprecipitation and Western blotting
体内肿瘤形成
小鼠品系(BALB/c裸鼠,5-6周龄),细胞数量(1×10^6),注射方式(皮下,双侧),基质胶比例(1:1),观察时间(28天)
阅读提示:Methods: Tumorigenesis assay