检测TAM受体与配体在疾病中的表达
验证TAM受体(Axl、Mer)及其配体Gas6和磷脂酰丝氨酸是否在AD小鼠和人类中与Aβ斑块相关。
通过免疫组化检测APP/PS1和APP41小鼠及人AD脑组织中Axl、Mer、Gas6的表达;使用pSIVA检测磷脂酰丝氨酸在斑块上的外化。
Microglia use TAM receptors to detect and engulf amyloid β plaques
包含多层级验证:单细胞转录组学、活体双光子成像、免疫组化、行为学测试等,并对TAM缺陷小鼠在细胞和整体水平进行功能与机制验证。
APP/PS1小鼠模型 APP/PS1Axl−/−Mertk−/−小鼠模型 5xFAD小鼠模型(引用) 人AD脑组织(BRAAK 6期)
确认TAM受体(Axl和Mer)在斑块相关小胶质细胞中的表达上调 验证Gas6和磷脂酰丝氨酸在Aβ斑块上的共定位 单细胞RNA-seq揭示TAM缺失对转录组的影响 体内双光子成像测量小胶质细胞对斑块的吞噬能力 Thioflavin S染色定量致密核心斑块负荷
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证TAM受体(Axl、Mer)及其配体Gas6和磷脂酰丝氨酸是否在AD小鼠和人类中与Aβ斑块相关。
通过免疫组化检测APP/PS1和APP41小鼠及人AD脑组织中Axl、Mer、Gas6的表达;使用pSIVA检测磷脂酰丝氨酸在斑块上的外化。
探究TAM信号对小胶质细胞转录组状态的影响。
对18月龄APP/PS1和APP/PS1Axl−/−Mertk−/−小鼠皮层CD45+细胞进行单细胞RNA测序。
实时观察TAM缺陷对小胶质细胞检测、结合和吞噬Aβ斑块的影响。
使用Cx3cr1GFP标记小胶质细胞,MX04标记斑块,对16月龄小鼠进行活体双光子成像。
评估TAM缺失对致密核心斑块形成的影响。
使用Thioflavin S染色定量不同基因型小鼠皮层和海马中致密核心斑块的密度。
评估TAM缺失对认知功能的影响。
进行场景恐惧条件化测试,评估恐惧获得和情境记忆。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | 抗Axl抗体 | R&D Systems | AF854 |
| 抗Mer抗体 | eBioscience | DS5MMER | |
| 抗Gas6抗体 | R&D Systems | AF986 | |
| 抗β淀粉样蛋白抗体(6E10克隆) | Biolegend | 803001 | |
| 抗Iba1抗体 | Wako | 019-19741 | |
| 抗GFAP抗体 | Dako | z-334 | |
| 抗切割Casp3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 | |
| 抗CD68抗体 | BioRad | MCA1957 | |
| 抗RTN3抗体 | EMD Millipore | ABN1723 | |
| 抗Tmem119抗体 | Abcam | AB209064 | |
| 抗LAMP1抗体 | BD Biosciences | 553792 | |
| 抗Trem2抗体 | R&D Systems | AF1729 | |
| 抗CD31抗体 | R&D Systems | AF3628 | |
| 抗层粘连蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | L-9393 | |
| 流式细胞术 | 抗CD45-PE抗体 | Invitrogen | 12-9459-42 |
| 抗CD11b-FITC抗体 | Invitrogen | 11-0112-85 | |
| 免疫印迹 | 抗GAPDH抗体 | Millipore | MAB374 |
| 组织学染色 | Hoechst 33258 | Sigma-Aldrich | B-2883 |
| TrueBlack®脂褐素自发荧光淬灭剂 | Biotium | 23007 | |
| ELISA | 合成人Aβ1-42肽 | Anaspec | 20276 |
| 体内斑块标记 | 甲氧基-X04 | Tocris | 4920 |
| pSIVA检测 | pSIVA-IANBD™ | Novus Biologicals | NBP2-29382 |
| PCR | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596026 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | 使用的转基因小鼠品系(APP/PS1、APP41等)、年龄、性别、饲养条件。 阅读提示:Methods - Mice |
| 免疫组化 | 抗体浓度、抗原修复条件、封闭缓冲液、孵育时间。 阅读提示:Methods - Immunohistochemistry and histochemistry |
| 单细胞RNA-seq | 细胞分离方法、建库平台、测序深度、分析参数。 阅读提示:Methods - Single cell sequencing |
| 两光子成像 | 小鼠准备、麻醉、手术窗口、成像参数、时间序列。 阅读提示:Methods - Surgery and animal preparation for in vivo two-photon imaging |
| 斑块定量 | Thioflavin S染色方案、图像分析参数(阈值、粒子分析)。 阅读提示:Methods - Immunohistochemistry and histochemistry; Figure 6 |
| 行为学 | 恐惧条件化测试的具体参数(声音、电击强度、时间间隔)、动物性别和年龄。 阅读提示:Methods - Contextual fear conditioning behavior test |