制备淀粉样纤维
制备SEVI、胰岛素和Aβ42纤维,用于比较检测剂反应。
胰岛素纤维在pH 2、70°C孵育制备;PAPf39在pH 7.4 PBS中37°C振荡孵育制备SEVI;Aβ42用HFIP预处理后在pH 7.4缓冲液中37°C孵育。
K114 (trans, trans)-bromo-2,5-bis(4-hydroxystyryl)benzene is an efficient detector of cationic amyloid fibrils.
体内外实验:体外荧光检测、NMR、CD、TEM等,缺少体内模型和功能验证。
SEVI(PAPf39淀粉样纤维) 胰岛素淀粉样纤维 Aβ42淀粉样纤维
ThT与SEVI的摩尔比1:1 K114与PAPf39的摩尔比1:2 K114浓度10 µM,DMSO含量1% (v/v) ThT浓度100 µM SEVI浓度范围6.8-34.1 µg
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
制备SEVI、胰岛素和Aβ42纤维,用于比较检测剂反应。
胰岛素纤维在pH 2、70°C孵育制备;PAPf39在pH 7.4 PBS中37°C振荡孵育制备SEVI;Aβ42用HFIP预处理后在pH 7.4缓冲液中37°C孵育。
评估ThT对SEVI的检测效率。
在ThT与蛋白摩尔比1:1条件下,测量ThT在缓冲液、SEVI和胰岛素纤维存在下的荧光光谱。
评估K114对SEVI的检测效率,并比较与胰岛素和Aβ42纤维的反应。
在K114与蛋白摩尔比1:2条件下,测量K114在未纤维化PAPf39、SEVI、胰岛素纤维和Aβ42纤维存在下的荧光光谱,并分析发射峰位移和强度。
检测ThT在SEVI表面是否存在快速结合-解离。
对ThT在缓冲液、胰岛素纤维和SEVI存在下进行NOESY实验。
验证K114荧光强度可用于定量SEVI。
测量不同SEVI量下K114在535 nm的荧光强度,并进行线性回归。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 制备淀粉样纤维 | 人胰岛素 | Sigma-Aldrich | -- |
| PAPf39多肽 | NeoBioScience | -- | |
| Aβ42多肽 | 21st Century Biochemicals | -- | |
| 荧光光谱 | 硫黄素T | AnaSpec Inc. | -- |
| K114 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 安捷伦Cary Eclipse荧光分光光度计 | Agilent | -- | |
| NMR光谱 | Varian INOVA核磁共振波谱仪 | Varian | -- |
| 圆二色谱 | JASCO J-815圆二色光谱仪 | JASCO | -- |
| TEM | 碳包覆铜网 | -- | -- |
| 醋酸铀酰 | -- | -- | |
| 分子建模 | 分子操作环境 | Chemical Computing Group | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 制备淀粉样纤维 | 胰岛素纤维制备条件(浓度、缓冲液、pH、温度);PAPf39(SEVI)制备条件(浓度、缓冲液、pH、温度、振荡速度);Aβ42预处理(HFIP处理时间) 阅读提示:Materials and Methods: Preparation of fibrils |
| ThT荧光检测 | ThT浓度、ThT:蛋白比例、激发/发射波长 阅读提示:Materials and Methods: Fluorescence spectroscopy |
| K114荧光检测 | K114浓度、K114:蛋白比例、DMSO含量、激发/发射波长 阅读提示:Materials and Methods: Fluorescence spectroscopy |
| NMR实验 | ThT浓度、ThT:蛋白比例、溶剂(D2O)、温度、混合时间 阅读提示:Materials and Methods: NMR spectroscopy |
| SEVI定量 | SEVI量范围、K114浓度、K114:蛋白比例、测量波长、重复次数 阅读提示:Results and Discussion, Figure 4 |