建立不同CMA活性的乳腺癌细胞系
验证LAMP2A敲低和过表达对CMA活性的调控效果。
通过慢病毒介导的shRNA和过表达载体感染乳腺癌细胞系,经嘌呤霉素筛选稳定细胞系;通过Western blot和GAPDH-溶酶体结合实验检测CMA活性。
Chaperone-mediated autophagy promotes breast cancer angiogenesis via regulation of aerobic glycolysis.
包含体外细胞模型(乳腺癌细胞系与HUVECs共培养)、体内裸鼠异种移植模型、功能验证(管形成、增殖、迁移)和机制验证(糖酵解、HK2敲低)。
乳腺癌细胞系(MDA-MB-231、MDA-MB-436、T47D、MCF7) 人脐静脉内皮细胞(HUVECs) 裸鼠异种移植模型(BALB/c nude mice)
LAMP2A敲低和过表达效率(Western blot验证) CMA活性检测(GAPDH与溶酶体结合实验) 乳酸水平检测(Lactate Assay Kit,TCM上清) ECAR测量(Seahorse,葡萄糖25 mM、寡霉素1 μM、2-DG 50 mM) HK2敲低效率及对管形成能力影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证LAMP2A敲低和过表达对CMA活性的调控效果。
通过慢病毒介导的shRNA和过表达载体感染乳腺癌细胞系,经嘌呤霉素筛选稳定细胞系;通过Western blot和GAPDH-溶酶体结合实验检测CMA活性。
检测不同CMA活性的乳腺癌细胞条件培养基对HUVECs管形成、增殖和迁移能力的影响。
收集不同LAMP2A表达乳腺癌细胞的条件培养基(TCM),与HUVECs共培养,进行管形成、MTT、集落形成、迁移和伤口愈合实验。
验证CMA是否影响乳腺癌细胞中VEGFA的mRNA和蛋白水平。
通过qRT-PCR、Western blot和ELISA检测不同LAMP2A表达乳腺癌细胞中VEGFA的表达和分泌;在异种移植肿瘤组织中用Western blot检测VEGFA蛋白水平。
探究CMA是否通过调控有氧糖酵解影响乳酸产生和细胞外酸化。
检测TCM中乳酸水平,利用Seahorse分析ECAR,检测HK2 mRNA和蛋白水平。
确定HK2是否为CMA促进血管生成的关键下游分子。
敲低HK2后检测乳酸水平、HUVECs管形成、增殖和迁移能力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | -- |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| MEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 胰岛素 | -- | -- | |
| 细胞感染和转染 | Opti-MEM I培养基 | Beyotime | 31985-062 |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668-027 | |
| 嘌呤霉素 | Invitrogen | A11138-03 | |
| 慢病毒 | GenePharma | -- | |
| CMA活性检测 | 溶酶体富集试剂盒 | Pierce | 89839 |
| 重组his-GAPDH蛋白 | -- | -- | |
| his-HSC70蛋白 | -- | -- | |
| 乳酸检测 | 乳酸检测试剂盒 | MBL International | -- |
| 管形成实验 | 基质胶 | BD Biosciences | -- |
| 钙黄绿素-AM | -- | -- | |
| 荧光显微镜 | -- | -- | |
| MTT实验 | MTT试剂 | Sigma-Aldrich | M5655 |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | D4540 | |
| 集落形成实验 | 结晶紫 | Beyotime | C0121 |
| 迁移实验 | Transwell小室 | Millipore | PIEP12R48 |
| qRT-PCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| Bestar™ qPCR反转录试剂盒 | DBI® Bioscience | -- | |
| Bestar® SybrGreen qPCR预混液 | DBI® Bioscience | -- | |
| Bio-Rad IQ5检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| ELISA | 人VEGF ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EHC108.96 |
| ECAR测量 | XF-96细胞外通量分析仪 | Seahorse Bioscience | -- |
| XF 96孔微孔板 | Seahorse Bioscience | -- | |
| Western blot | HK2抗体 | Cell Signaling Technology | 2867 |
| LAMP2A抗体 | Abcam | ab18528 | |
| VEGFA抗体 | Abcam | ab214424 | |
| β-actin抗体 | Boster | BM0626 | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| ECL化学发光试剂盒 | Millipore | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养基:MDA-MB-231、MDA-MB-436、T47D、MCF7、HUVECs来源及培养条件(如RPMI 1640、DMEM、MEM、FBS浓度、胰岛素、非必需氨基酸)。 阅读提示:Materials and methods 中的 Cell culture |
| LAMP2A敲低和过表达 | 慢病毒载体构建和感染参数,嘌呤霉素筛选浓度,敲低靶序列。 阅读提示:Materials and methods 中的 Cell infection and transfection |
| CMA活性检测 | 溶酶体分离方法、GAPDH结合实验条件(蛋白量、孵育时间等)。 阅读提示:Materials and methods 中的 Lysosomal association of human recombinant his-GAPDH |
| 条件培养基收集 | 细胞种植密度(1×10⁵/孔)、培养时间(24h)、培养基体积(2ml)、离心条件(1500rpm,5min)。 阅读提示:Materials and methods 中的 Tumor-conditioned medium collection |
| 乳酸检测 | 乳酸检测试剂盒使用步骤、样品制备。 阅读提示:Materials and methods 中的 Lactate detection |
| 管形成实验 | Matrigel量(100μl/孔)、HUVECs种子量(2×10⁴)、孵育时间(12h)、染色条件(Calcein-AM 5μM,30min)。 阅读提示:Materials and methods 中的 Tube formation assay |
| 细胞增殖和迁移检测 | MTT、集落形成、迁移实验的具体条件和参数。 阅读提示:Materials and methods 中的 MTT assay, Colony formation assay, Migration assay, Wound-healing assay |
| qRT-PCR | 引物序列、RNA提取和反转录试剂、PCR条件。 阅读提示:Materials and methods 中的 Quantitative real-time PCR |
| ELISA | ELISA试剂盒操作步骤、样品体积、孵育时间等。 阅读提示:Materials and methods 中的 ELISA |
| ECAR测量 | 细胞种子密度(8000细胞/孔)、药物处理浓度(葡萄糖25mM、寡霉素1μM、2-DG 50mM)。 阅读提示:Materials and methods 中的 Extracellular acidification rate measurement |
| 体内异种移植实验 | 动物品系(BALB/c裸鼠)、年龄(4-6周)、性别(雌性)、分组(4组,每组n=5)、细胞注射量(1×10⁷细胞/小鼠)、注射体积(200μl)、肿瘤体积计算方式。 阅读提示:Materials and methods 中的 Animal study 和 Results 中的相关描述 |