尿液细胞采集与扩增
从患者非侵入性获取体细胞用于重编程。
收集患者中段尿液,离心沉淀细胞,在含REGM培养基的明胶包被板上培养,扩增尿液上皮细胞。
Generation and Characterization of Induced Pluripotent Stem Cells and Retinal Organoids From a Leber's Congenital Amaurosis Patient With Novel RPE65 Mutations.
包含患者尿液细胞重编程、hiPSCs多能性验证(免疫荧光、RT-PCR、核型、畸胎瘤)、视网膜类器官分化及功能验证(qPCR、免疫荧光、吞噬实验、ELISA)等多个独立证据层级。
RPE65-hiPSCs(患者特异性iPSCs) 视网膜类器官(含光感受器和RPE细胞) 患者iPSC来源的RPE细胞 NOD-SCID小鼠畸胎瘤模型
尿液细胞重编程使用电穿孔导入episomal质粒(OCT4, SOX2, SV40LT, KLF4和miR-302-367簇) 患者RPE65突变位点c.200T>G和c.430T>C经Sanger测序确认 视网膜分化方案:D0悬浮形成EBs,D5-7铺板,D16换为RDM,4-6周后分离NR域 RPE细胞功能检测:POS吞噬实验(37°C vs 4°C,12小时)和VEGF分泌ELISA(24小时)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从患者非侵入性获取体细胞用于重编程。
收集患者中段尿液,离心沉淀细胞,在含REGM培养基的明胶包被板上培养,扩增尿液上皮细胞。
生成无整合的患者特异性诱导多能干细胞。
通过电穿孔将episomal质粒导入尿液细胞,在mTeSR1培养基中培养,挑取克隆并扩增。
确认RPE65-hiPSCs具有多能性且无外源质粒整合。
通过免疫荧光检测多能性标志物,RT-PCR检测内源和外源基因表达,核型分析,畸胎瘤形成实验。
确定患者hiPSCs能否分化为包含光感受器和RPE细胞的分层视网膜类器官。
采用逐步视网膜分化方案,形成EBs,铺板后诱导为神经视网膜域,分离后悬浮培养形成类器官。
验证类器官中是否产生所有主要视网膜细胞类型并形成分层结构。
通过免疫荧光检测不同发育阶段的视网膜细胞标志物,并用透射电镜观察光感受器超微结构。
评估患者RPE细胞的分子特征和功能是否受损。
从分化培养物中分离RPE细胞,扩增后检测RPE65、MITF、CRALBP表达,并进行吞噬实验和VEGF分泌检测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/Ham's F-12营养混合物 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | Natocor | -- | |
| REGM SingleQuot试剂盒 | Lonza | -- | |
| TrypLE表达酶 | Life Technologies, Inc. | -- | |
| 细胞重编程 | pEP4EO2SET2K质粒 | -- | -- |
| pCEP4-miR-302-367质粒 | -- | -- | |
| A-83-01 | Sigma | SML0788 | |
| CHIR99021 | Selleck | S1263 | |
| Tzv | Selleck | S1459 | |
| PD0325901 | Selleck | S1036 | |
| 细胞培养 | mTeSR1培养基 | Stem Cell Technologies | -- |
| 基质胶 | -- | -- | |
| 视网膜分化 | Blebbistatin | Sigma-Aldrich | -- |
| N2添加剂 | Invitrogen | -- | |
| B27添加剂(不含维生素A) | Invitrogen | -- | |
| 肝素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 牛磺酸 | Sigma-Aldrich | -- | |
| GlutaMAX补充剂 | -- | -- | |
| 免疫染色 | Triton X-100 | -- | -- |
| 驴血清 | -- | -- | |
| DAPI | Sigma-Aldrich | -- | |
| E-钙黏蛋白抗体 | Abcam | ab76055 | |
| KRT7抗体 | GeneTex | GTX107343 | |
| CD44抗体 | GeneTex | GTX102111 | |
| OCT4抗体 | Bioss | bs-0830R | |
| SOX2抗体 | Abcam | ab92494 | |
| NANOG抗体 | Abcam | ab24624 | |
| SSEA4抗体 | Abcam | ab16287 | |
| TRA-1-81抗体 | Abcam | ab16298 | |
| TRA-1-60抗体 | Abcam | ab16288 | |
| PAX6抗体 | DSHB | 3B5 | |
| SOX1抗体 | Abcam | ab109290 | |
| SIX3抗体 | Rockland | 600-401-A26 | |
| OTX2抗体 | Abcam | ab21990 | |
| LHX2抗体 | Santa Cruz | sc-81311 | |
| VSX2抗体 | Millipore | ab9016 | |
| MCM2抗体 | Abcam | ab4461 | |
| BRN3抗体 | Santa Cruz | SC-6026X | |
| AP2抗体 | DSHB | 3B5a | |
| PROX1抗体 | Millipore | AB5475 | |
| PKC-α抗体 | Abcam | ab32376 | |
| CRALBP抗体 | Abcam | ab15051 | |
| Recoverin抗体 | Millipore | ab5585 | |
| 视紫红质抗体 | Abcam | ab3267 | |
| L/M视蛋白抗体 | -- | -- | |
| S视蛋白抗体 | -- | -- | |
| ZO-1抗体 | Thermo Fisher | 33-9100 | |
| RPE65抗体 | Abcam | ab78036 | |
| MITF抗体 | Abcam | ab12039 | |
| 驴抗兔(555) | Invitrogen | A31572 | |
| 驴抗兔(488) | Invitrogen | A21206 | |
| 驴抗鼠(488) | Invitrogen | A21202 | |
| 驴抗鼠(555) | Invitrogen | A31570 | |
| 驴抗山羊(555) | Invitrogen | A21432 | |
| 驴抗绵羊(488) | Invitrogen | A11015 | |
| 基因表达分析 | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| PrimeScript RT预混液 | Takara Bio | -- | |
| SYBR Green qPCR预混液 | -- | -- | |
| 多能性检测 | 碱性磷酸酶染色试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | D001-2 |
| 核型分析 | 秋水仙素 | -- | -- |
| 吉姆萨染色 | -- | -- | |
| 奥林巴斯BX51显微镜 | Olympus | -- | |
| Ikaros核型分析系统 | MetaSystems | -- | |
| Sanger测序 | DNA Midi试剂盒 | Qiagen | -- |
| 结构分析 | Swiss-Model | -- | -- |
| FoldX 5.0 | -- | -- | |
| VMD 1.9.3 | -- | -- | |
| PDB2PQR 2.1.1 | -- | -- | |
| 吞噬实验 | CM-Dil细胞膜荧光探针 | Invitrogen | -- |
| 蔡司LSM 880共聚焦显微镜 | Carl Zeiss Meditec, Inc. | -- | |
| ELISA | 人VEGF ELISA试剂盒 | QuantiCyto | -- |
| 显微镜 | 尼康显微镜 | Nikon | -- |
| 免疫荧光 | 蔡司LSM 510共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 尿液细胞采集和扩增 | 尿液体积、离心条件、培养基组成、细胞传代条件 阅读提示:Materials and Methods: Urine Collection and Cell Expansion |
| hiPSCs重编程 | 电穿孔质粒和用量、电穿孔程序、诱导培养基成分、克隆挑取时间 阅读提示:Materials and Methods: Urine Cell Reprogramming and hiPSCs Culture |
| 视网膜类器官分化 | EB形成条件、NIM和RDM成分、NR域分离时间、悬浮培养条件 阅读提示:Materials and Methods: Retinal Differentiation and 3D Retinal Organoids Culture |
| RPE细胞功能评估 | RPE细胞培养时间、吞噬实验温度和时间、VEGF分泌检测方法 阅读提示:Materials and Methods: Phagocytosis Assay, Enzyme-Linked Immunosorbent Assay; Results: Evaluation of Cell Function of Patient RPE |