建立H/R诱导的HUVECs损伤模型并验证焦亡
确定H/R是否诱导HUVECs发生焦亡,并评估细胞活力、死亡及焦亡相关蛋白和炎症因子。
HUVECs进行缺氧12小时和复氧4小时处理;CCK-8检测细胞活力;Calcein-AM/PI染色检测细胞死亡;Western blot检测NLRP3、c-caspase-1、GSDMD-N蛋白水平;ELISA检测IL-1β和IL-18分泌。
HSP90-Dependent Upregulation of EZH2 Promotes Hypoxia/Reoxygenation-Induced Pyroptosis by Inhibiting miR-22 in Endothelial Cells.
包含体外细胞实验(HUVECs)和多种功能验证(siRNA、过表达、miR-22 mimic/inhibitor)及机制验证(ChIP、双荧光素酶、Co-IP),但缺乏动物或临床样本验证。
人脐静脉内皮细胞(HUVECs) H/R处理的HUVECs体外模型
细胞系:HUVECs (Cat. No. BNCC342247),培养条件:ECM、10% FBS、1% ECGS、1% P/S,37°C、5% CO2 H/R模型:无糖无血清培养基缺氧12 h(1% O2, 94% N2, 5% CO2),然后正常DMEM+10% FBS复氧4 h HUVECs以5×10^3细胞/孔接种96孔板,CCK-8试剂10 μL/孔孵育2 h,450 nm读取吸光度 EZH2 siRNA序列:5'-CCAUGUUUACAACUAUCAA-3';HSP90 siRNA:5'-TCGTCAGAGCTGATGATGAAGT-3';siNC:5'-UUCUCCGAACGUGUCACGU-3' GSK126处理浓度:5 μM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定H/R是否诱导HUVECs发生焦亡,并评估细胞活力、死亡及焦亡相关蛋白和炎症因子。
HUVECs进行缺氧12小时和复氧4小时处理;CCK-8检测细胞活力;Calcein-AM/PI染色检测细胞死亡;Western blot检测NLRP3、c-caspase-1、GSDMD-N蛋白水平;ELISA检测IL-1β和IL-18分泌。
检测H/R对EZH2表达的影响,并通过敲低EZH2观察其对焦亡的影响。
Western blot检测H/R后EZH2水平;用siEZH2转染HUVECs,随后测定细胞活力、焦亡蛋白表达及炎症因子释放。
探讨EZH2是否通过下调miR-22促进焦亡。
RT-qPCR检测miR-22表达;在siEZH2基础上使用miR-22 inhibitor,观察对焦亡的逆转;在EZH2过表达基础上使用miR-22 mimic,观察对焦亡的抑制。
确定EZH2是否通过组蛋白甲基化直接抑制miR-22转录。
免疫荧光检测EZH2核定位;ChIP检测EZH2和H3K27me3在miR-22启动子区域的富集;使用GSK126抑制EZH2甲基转移酶活性,检测miR-22表达和EZH2结合变化。
确认miR-22通过直接结合NLRP3 3'UTR调控其表达。
双荧光素酶报告实验检测miR-22对NLRP3 WT/Mut 3'UTR荧光素酶活性的影响;Western blot检测miR-22 mimic/inhibitor对NLRP3蛋白水平的影响。
探讨HSP90是否通过稳定EZH2促进H/R诱导的焦亡。
Western blot检测H/R后HSP90表达;siHSP90转染后检测EZH2表达和焦亡指标;Co-IP检测HSP90与EZH2相互作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 人脐静脉内皮细胞 | BeNa culture collection | BNCC342247 |
| 内皮细胞培养基 | Sciencell | 1001 | |
| 胎牛血清 | Sciencell | 0025 | |
| 内皮细胞生长补充剂 | Sciencell | 1052 | |
| 青霉素/链霉素 | Sciencell | 0503 | |
| 缺氧诱导 | 厌氧产气袋容器 | Mitsubishi Gas Chemical | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | C0037 |
| 酶标仪 | BioTek Instruments | ELx800 | |
| 细胞死亡检测 | Calcein-AM/PI细胞活力/细胞毒性检测试剂盒 | Beyotime | C2015M |
| ELISA | IL-18 ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EMC011.96 |
| IL-1β ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EMC001b.96.2 | |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013C |
| 蛋白定量 | 增强型BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0010 |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| 抗NLRP3抗体 | Cell Signaling Technology | 15101 | |
| 抗裂解caspase-1抗体 | Cell Signaling Technology | 4199 | |
| 抗GSDMD-N抗体 | Cell Signaling Technology | #36425 | |
| 抗HSP90抗体 | Cell Signaling Technology | 4877 | |
| 抗EZH2抗体 | Cell Signaling Technology | 5246 | |
| 抗H3K27me3抗体 | Cell Signaling Technology | 9733 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| 二抗 | Santa Cruz Technology | sc-2004 | |
| 增强化学发光试剂 | Thermo Fisher Scientific | 34577 | |
| 免疫荧光 | Alex Fluor®488标记二抗 | Invitrogen | A11008 |
| DAPI | Southern Biotech | 0100-20 | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 反转录试剂盒 | TaKaRa | RR037A | |
| SYBR Premix Ex Taq II试剂盒 | TaKaRa | RR390A | |
| ABI 7300实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 细胞转染 | Lipo6000转染试剂 | Beyotime | D2107 |
| EZH2 siRNA | GenePharm | -- | |
| HSP90 siRNA | GenePharm | -- | |
| miR-22模拟物 | GenePharm | -- | |
| miR-22抑制剂 | GenePharm | -- | |
| pcDNA3.1-HA-EZH2质粒 | Shanghai Genechem | -- | |
| ChIP | ChIP试剂盒 | Beyotime | P2078 |
| 抗EZH2抗体 | Cell Signaling Technology | 5246 | |
| 抗H3K27me3抗体 | Cell Signaling Technology | 9733 | |
| 兔抗IgG | Beyotime | A7016 | |
| 双荧光素酶实验 | pGLuc-Dura-miR基础荧光素酶报告载体 | Beyotime | C0526 |
| 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Beyotime | RG027 | |
| Co-IP | 免疫沉淀试剂盒 | Beyotime | P2177S |
| 统计学 | GraphPad Prism | -- | 9.0 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与H/R模型 | HUVECs来源(BNCC342247),培养基成分(ECM, FBS, ECGS, P/S),缺氧时间(12h)和复氧时间(4h),氧气浓度(1% O2, 94% N2, 5% CO2) 阅读提示:Materials and Methods, Cell Culture and Treatment |
| 细胞活力检测 | 细胞密度(5×10^3 cells/well),CCK-8试剂体积(10 μL/孔),孵育时间(2 h),检测波长(450 nm) 阅读提示:Materials and Methods, Cell Viability Assay |
| 焦亡检测 | Calcein-AM/PI染色孵育时间(30 min),温度(37°C),Western blot抗体稀释比(NLRP3 1:1000, c-caspase-1 1:2000, GSDMD-N 1:2000),ELISA试剂盒(IL-18: EMC011.96, IL-1β: EMC001b.96.2) 阅读提示:Materials and Methods, ELISA Assay and Western Blot |
| RNA干扰和过表达 | siRNA序列(siEZH2, siHSP90),miR-22 mimic/inhibitor来源,质粒(pcDNA3.1-HA-EZH2),转染试剂(Lipo6000) 阅读提示:Materials and Methods, siRNAs, Plasmid and Cell Transfection |
| GSK126处理 | GSK126浓度(5 μM),处理时间(文中未明确说明) 阅读提示:Results, Figure 5C-E |